秦川牛SIX1和SIX4基因SNPs檢測及其與體尺和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2023-04-23 15:47
SIX1和SIX4基因是一類進(jìn)化上比較保守的轉(zhuǎn)錄因子,它們屬于SIX家族。SIX1和SIX4是肌肉發(fā)生、分化時重要的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子在動物胚胎及骨骼肌發(fā)育期間,SIX1和SIX4基因協(xié)同作用,它們可直接或通過生肌決定因子家族調(diào)控肌肉發(fā)育相關(guān)基因。 因此,本研究以487頭秦川牛為實(shí)驗(yàn)材料,通過DNA測序、PCR-RFLP和PCR-SSCP等技術(shù)手段分析研究了在肌肉發(fā)育中起關(guān)鍵作用的SIX1和SIX4基因在487頭秦川牛群體中的遺傳變異情況,統(tǒng)計了各個基因型的頻率和遺傳多樣性,并研究了這些遺傳變異與秦川牛體尺和肉質(zhì)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)性。通過研究這些遺傳變異的遺傳效應(yīng),希望發(fā)現(xiàn)顯著影響秦川牛經(jīng)濟(jì)性狀的DNA標(biāo)記,為分子育種提高秦川牛的生產(chǎn)和肉質(zhì)性能提供理論基礎(chǔ)。 本研究取得了如下結(jié)果: 1. SIX1和SIX4基因的遺傳變異分析 根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫顯示SIX1基因(GeneID:511371)包含有3個外顯子。在對SIX1基因設(shè)計了4對引物,經(jīng)PCR擴(kuò)增、DNA測序后,發(fā)現(xiàn)SIX1基因的3個外顯子區(qū)域并不存在SNP。 根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫顯示SIX4基因(GeneID:526104)包含有3個外顯子。在對...
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
文獻(xiàn)綜述
第一章 研究背景
1.1 秦川牛情況簡介
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)簡介
1.2.1 限制性片斷長度多態(tài)性(RFLP)
1.2.2 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)
1.2.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
1.2.4 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性 DNA (RAPD)
1.2.5 微衛(wèi)星 DNA 標(biāo)記
1.3 SIX1 和 SIX4 基因概況
1.3.1 肌肉細(xì)胞分化、生長調(diào)控的功能基因及其調(diào)控機(jī)理
1.3.2 SIX 同源框基因家族的研究概況
1.4 本研究的目的和意義
實(shí)驗(yàn)研究
第二章 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因的遺傳多態(tài)性及其與體尺和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn) DNA 樣品
2.1.2 生產(chǎn)性狀資料
2.1.3 主要儀器設(shè)備及試劑
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因組 DNA 的提取
2.2.2 PCR 擴(kuò)增體系
2.2.3 PCR-RFLP 分析
2.2.4 PCR-SSCP 分析
2.2.5 統(tǒng)計分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 秦川牛血液基因組 DNA 樣品的檢測
2.3.2 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 電泳檢測結(jié)果
2.3.3 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 擴(kuò)增后的測序結(jié)果
2.3.4 SIX4 基因的擴(kuò)增產(chǎn)物 RFLP 分析
2.3.5 SIX4 基因擴(kuò)增產(chǎn)物的 SSCP 分析
2.3.6 秦川牛 SIX1 和 SIX4 多態(tài)位點(diǎn)的遺傳學(xué)分析
2.3.7 秦川牛 SIX4 基因多態(tài)位點(diǎn)間的單倍型分析
2.3.8 SIX4 基因多態(tài)性與秦川牛體尺和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.4 討論
2.4.1 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因遺傳突變位點(diǎn)的分析
2.5 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3800001
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
文獻(xiàn)綜述
第一章 研究背景
1.1 秦川牛情況簡介
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)簡介
1.2.1 限制性片斷長度多態(tài)性(RFLP)
1.2.2 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)
1.2.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
1.2.4 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性 DNA (RAPD)
1.2.5 微衛(wèi)星 DNA 標(biāo)記
1.3 SIX1 和 SIX4 基因概況
1.3.1 肌肉細(xì)胞分化、生長調(diào)控的功能基因及其調(diào)控機(jī)理
1.3.2 SIX 同源框基因家族的研究概況
1.4 本研究的目的和意義
實(shí)驗(yàn)研究
第二章 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因的遺傳多態(tài)性及其與體尺和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn) DNA 樣品
2.1.2 生產(chǎn)性狀資料
2.1.3 主要儀器設(shè)備及試劑
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因組 DNA 的提取
2.2.2 PCR 擴(kuò)增體系
2.2.3 PCR-RFLP 分析
2.2.4 PCR-SSCP 分析
2.2.5 統(tǒng)計分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 秦川牛血液基因組 DNA 樣品的檢測
2.3.2 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 電泳檢測結(jié)果
2.3.3 SIX1 和 SIX4 基因 PCR 擴(kuò)增后的測序結(jié)果
2.3.4 SIX4 基因的擴(kuò)增產(chǎn)物 RFLP 分析
2.3.5 SIX4 基因擴(kuò)增產(chǎn)物的 SSCP 分析
2.3.6 秦川牛 SIX1 和 SIX4 多態(tài)位點(diǎn)的遺傳學(xué)分析
2.3.7 秦川牛 SIX4 基因多態(tài)位點(diǎn)間的單倍型分析
2.3.8 SIX4 基因多態(tài)性與秦川牛體尺和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.4 討論
2.4.1 秦川牛 SIX1 和 SIX4 基因遺傳突變位點(diǎn)的分析
2.5 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3800001
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