靶向鴨瘟病毒ICP4基因的microRNA功能初探
發(fā)布時間:2023-04-07 00:06
鴨瘟病毒(duck plague virus,DPV)屬皰疹病毒科(herpesvirales)α皰疹病毒亞科(Alphaherpesvirinae),可引起禽類急性敗血癥,對世界各國水禽業(yè)具有嚴重危害性。皰疹病毒micro RNA(mi RNA)的數(shù)量占病毒mi RNA總數(shù)的90%以上,其多數(shù)成員編碼的mi RNA研究已有較大進展,但關(guān)于鴨瘟病毒mi RNA的研究報道甚少。本研究以對病毒復(fù)制具有重要調(diào)控作用的立即早期基因ICP4為目的基因,結(jié)合實驗室測序獲得的CHv株編碼的39個鴨瘟病毒mi RNA,篩選出靶向病毒ICP4基因的mi RNA,并對其功能進行了初步研究,結(jié)果如下:1靶向鴨瘟病毒ICP4基因的mi RNA篩選預(yù)測結(jié)果顯示,mi R-D22-3p、mi R-D22-5p及mi R-D23-5p均完全互補于ICP4基因,本試驗選擇由同一前體分化的mi R-D22-3p及mi R-D22-5p為篩選對象。將mi R-D22-5p mimics和NC mimics分別與熒光質(zhì)粒pmir GLO-ICP4-WT及pmir GLO-ICP4-MUT5p共轉(zhuǎn)染COS7細胞。結(jié)果表明,與...
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表(Abbreviations)
第一章 文獻綜述
1 miRNA的研究
1.1 miRNA生源途徑
1.2 miRNA的調(diào)控途徑
1.2.1 參與翻譯抑制
1.2.2 參與降解mRNA
2 禽皰疹病毒miRNA的研究
3 皰疹病毒ICP4基因的研究
4 研究目的與意義
第二章 試驗研究
1 材料
1.1 毒株、質(zhì)粒和細胞等
1.2 主要試劑及其配制
1.3 主要儀器
2 試驗方法
2.1 靶向鴨瘟病毒ICP4基因的miRNA的篩選
2.1.1 在線預(yù)測靶向鴨瘟病毒ICP4基因的miRNA
2.1.2 雙熒光報告基因載體野生型及突變型的構(gòu)建
2.1.3 轉(zhuǎn)染
2.1.4 熒光檢測
2.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因表達的影響
2.2.1 熒光質(zhì)粒表達的檢測
2.2.2 RT-qPCR檢測ICP4基因mRNA的表達
2.2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因蛋白表達的影響
2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒增殖的影響
2.3.1 鴨瘟病毒液TCID50及病毒粒子拷貝數(shù)的檢測
2.3.2 qPCR檢測不同時間點miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
2.3.3 qPCR不同濃度miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
3 結(jié)果
3.1 靶向鴨瘟ICP4基因的miRNA篩選及驗證
3.1.1 在線預(yù)測靶向鴨瘟ICP4基因的候選miRNA
3.1.2 雙熒光報告基因載體野生型及突變型的構(gòu)建
3.1.3 熒光檢測
3.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因表達的影響
3.2.1 熒光質(zhì)粒表達的檢測
3.2.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因mRNA表達的影響
3.2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因蛋白表達的影響
3.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒增殖的影響
3.3.1 鴨瘟病毒液TCID50及病毒粒子拷貝數(shù)
3.3.2 不同時間點miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
3.3.3 不同濃度miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
4 討論
總結(jié)
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3784684
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表(Abbreviations)
第一章 文獻綜述
1 miRNA的研究
1.1 miRNA生源途徑
1.2 miRNA的調(diào)控途徑
1.2.1 參與翻譯抑制
1.2.2 參與降解mRNA
2 禽皰疹病毒miRNA的研究
3 皰疹病毒ICP4基因的研究
4 研究目的與意義
第二章 試驗研究
1 材料
1.1 毒株、質(zhì)粒和細胞等
1.2 主要試劑及其配制
1.3 主要儀器
2 試驗方法
2.1 靶向鴨瘟病毒ICP4基因的miRNA的篩選
2.1.1 在線預(yù)測靶向鴨瘟病毒ICP4基因的miRNA
2.1.2 雙熒光報告基因載體野生型及突變型的構(gòu)建
2.1.3 轉(zhuǎn)染
2.1.4 熒光檢測
2.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因表達的影響
2.2.1 熒光質(zhì)粒表達的檢測
2.2.2 RT-qPCR檢測ICP4基因mRNA的表達
2.2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因蛋白表達的影響
2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒增殖的影響
2.3.1 鴨瘟病毒液TCID50及病毒粒子拷貝數(shù)的檢測
2.3.2 qPCR檢測不同時間點miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
2.3.3 qPCR不同濃度miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
3 結(jié)果
3.1 靶向鴨瘟ICP4基因的miRNA篩選及驗證
3.1.1 在線預(yù)測靶向鴨瘟ICP4基因的候選miRNA
3.1.2 雙熒光報告基因載體野生型及突變型的構(gòu)建
3.1.3 熒光檢測
3.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因表達的影響
3.2.1 熒光質(zhì)粒表達的檢測
3.2.2 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因mRNA表達的影響
3.2.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒ICP4基因蛋白表達的影響
3.3 miR-D22-5p對鴨瘟病毒增殖的影響
3.3.1 鴨瘟病毒液TCID50及病毒粒子拷貝數(shù)
3.3.2 不同時間點miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
3.3.3 不同濃度miRNA對鴨瘟病毒DNA拷貝數(shù)的影響
4 討論
總結(jié)
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本文編號:3784684
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