在山羊中,安徽白山羊總體各項(xiàng)繁殖力參數(shù)較高,是安徽省皖北和江淮之間的廣大平原、丘陵地區(qū)人民的重要生產(chǎn)資料,其經(jīng)濟(jì)效益依賴于它的總生產(chǎn)力,而這種總生產(chǎn)力更多的依賴于母羊的高產(chǎn)羔率。然而,有關(guān)于山羊繁殖性狀的遺傳力很低(0.09-0.14),較難過傳統(tǒng)的育種方法來改進(jìn)其遺傳進(jìn)展。因此研究者們將他們的目光聚焦于分子育種技術(shù),以期快速提高山羊繁殖力。卵巢是動物體內(nèi)重要的生殖器官之一,在生殖調(diào)控過程中發(fā)揮非常重要的作用,其排卵的多少影響個(gè)體產(chǎn)羔率的高低。MicroRNA(miRNA)是一類通過降解或干擾mRNA正常表達(dá)的方式來實(shí)現(xiàn)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄后表達(dá)的非編碼小RNA。許多研究表明,miRNA在卵巢的所有生物學(xué)過程都起較重要的作用,包括卵泡形成、發(fā)育、凋亡,黃體形成與消失。為探索解釋miRNA在山羊繁殖性狀中產(chǎn)羔率方面所扮演的角色,期望篩選并鑒別某些miRNA序列可被用于后續(xù)研究以提高山羊排卵率及產(chǎn)羔率。在本研究中,我們使用高通量測序的方法,在產(chǎn)單羔和多羔的安徽白山羊母羊卵泡期卵巢中探測miRNA的各自表達(dá)譜,及其差異性表達(dá)情況,預(yù)測其潛在的候選miRNA,并對miRNA的靶基因進(jìn)行了GO富集分析和...

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
    1 山羊的產(chǎn)羔率性狀
        1.1 山羊的產(chǎn)羔率定義
        1.2 各品種山羊的產(chǎn)羔率概況
        1.3 山羊產(chǎn)羔率性狀的經(jīng)濟(jì)價(jià)值
    2 山羊產(chǎn)羔率的差異研究
        2.1 環(huán)境因素對山羊產(chǎn)羔率的影響
        2.2 營養(yǎng)水平對山羊產(chǎn)羔率的影響
        2.3 激素分泌對山羊產(chǎn)羔率的影響
        2.4 遺傳基因?qū)ι窖虍a(chǎn)羔率的影響
    3 關(guān)于山羊卵巢的研究
        3.1 卵巢中的卵泡生長
        3.2 卵巢的激素分泌研究
        3.3 卵巢基因表達(dá)研究
    4 miRNA在卵巢上的研究進(jìn)展
        4.1 miRNA的特點(diǎn)與生物學(xué)功能
        4.2 卵巢中的miRNA研究
        4.3 研究較多的幾種卵巢miRNA
引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
        1.1.1 試驗(yàn)動物與樣品采集
        1.1.2 主要儀器設(shè)備
        1.1.3 主要試驗(yàn)藥品與試劑
    1.2 試驗(yàn)方法與流程
        1.2.1 總RNA提取
        1.2.2 總RNA的質(zhì)量分析
        1.2.3 RNA混合池建立
        1.2.4 卵巢miRNA測序文庫的構(gòu)建和高通量測序
        1.2.5 測序原始數(shù)據(jù)處理
        1.2.6 小RNA的基因組比對
        1.2.7 與重復(fù)序列的比對
        1.2.8 與外顯子、內(nèi)含子的比對
        1.2.9 小RNA文庫的分類注釋
        1.2.10 卵泡期卵巢miRNA的表達(dá)譜構(gòu)建
        1.2.11 已知miRNA的差異分析
        1.2.12 聚類分析
        1.2.13 候選miRNA的預(yù)測
        1.2.14 miRNA靶基因的GO富集分析
        1.2.15 miRNA靶基因的KEGG通路分析
        1.2.16 miRNA測序結(jié)果的qRT-PCR驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 總RNA質(zhì)量檢測
    2.2 文庫序列質(zhì)量處理
    2.3 小RNA文庫片段長度分布統(tǒng)計(jì)
    2.4 小RNA基因組比對
    2.5 與重復(fù)序列比對
    2.6 與外顯子、內(nèi)含子的比對
    2.7 小RNA文庫的分類注釋
    2.8 山羊卵泡期卵巢miRNA的表達(dá)譜構(gòu)建
    2.9 單、多羔山羊卵泡期卵巢miRNA的差異表達(dá)分析
    2.10 繪制miRNA表達(dá)聚類圖
    2.11 候選miRNA的預(yù)測
    2.12 miRNA靶基因的GO富集分析
    2.13 miRNA靶基因的KEGG通路分析
    2.14 定量驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
    3.1 試驗(yàn)材料的選擇
    3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)補(bǔ)充說明
    3.3 miRNA表達(dá)譜與候選miRNA的預(yù)測
    3.4 單、多羔文庫差異表達(dá)miRNA的探測
    3.5 GO富集分析與KEGG通路分析
    3.6 定量驗(yàn)證討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄A 單、多羔山羊卵巢組織miRNA差異表達(dá)(單羔組歸一化表達(dá)量高于100部分)
致謝
個(gè)人簡介



本文編號：3784272