為系統(tǒng)挖掘豬沉默信息調(diào)節(jié)因子5(silence information regulator 5, SIRT5)基因外顯子區(qū)域SNPs位點(diǎn),以4個(gè)豬資源群體(從江香豬、黔北黑豬♀×巴克夏♂F₁代雜交豬、夜郎黃金豬和大約克豬)為研究對(duì)象,構(gòu)建品種DNA池,采用直接測(cè)序技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)軟件分析豬SIRT5外顯子多態(tài)性。結(jié)果顯示:4個(gè)豬資源群體中共篩選得到G515A、C831T和A882G 3個(gè)變異位點(diǎn),其中G515A屬于錯(cuò)義突變,可由甘氨酸改變?yōu)楣劝彼?等位基因頻率估算發(fā)現(xiàn),C831T和A882G變異位點(diǎn)在從江香豬群體中多態(tài)豐度高,而在大約克豬中均呈現(xiàn)偏態(tài)分布;生物信息學(xué)發(fā)現(xiàn),G515A突變后,豬SIRT5基因mRNA最小自由能降低,穩(wěn)定性提升。本研究成功篩選出豬SIRT5基因外顯子區(qū)的多態(tài)位點(diǎn),為進(jìn)一步驗(yàn)證該基因突變位點(diǎn)是否具有調(diào)控地方豬脂肪代謝水平提供參考。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 引物設(shè)計(jì)與合成
    1.4 PCR擴(kuò)增反應(yīng)
    1.5 變異位點(diǎn)篩選及等位基因頻率估算
    1.6 mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 DNA提取與PCR擴(kuò)增
    2.2 序列比對(duì)與SNP位點(diǎn)挖掘
    2.3 等位基因頻率估算
    2.4 mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
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