MiR-1和miR-133在山羊骨骼肌組織和細胞中的表達規(guī)律及功能研究
發(fā)布時間:2023-02-07 08:39
MicroRNAs (miRNAs)是一組內源性非編碼的小RNA分子,由19-22個核苷酸組成,在病毒、動物和植物等生物中廣泛存在。它可以通過與靶基因mRNA的3’端非編碼區(qū)(3’UTR)堿基完全或不完全互補配對,使基因mRNA直接降解或者抑制其翻譯,導致基因在轉錄后水平發(fā)生沉默,從而影響基因的表達,進而對細胞增殖、細胞分化、細胞凋亡、腫瘤的發(fā)生以及脂類代謝等過程進行調控。目前,關于miRNAs的研究仍處于初步階段,國內外的研究主要集中于模式生物miRNAs的發(fā)現,以及其中與生長發(fā)育、疾病發(fā)生相關的miRNAs的功能研究,而對于重要的家畜—山羊的miRNAs的研究則相對較少。本試驗的目的在于通過分析miR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌的發(fā)育過程和骨骼肌衛(wèi)星細胞中的時空表達規(guī)律以及功能研究,以了解其在山羊骨骼肌發(fā)育過程中的重要作用。1.山羊miR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)時空表達規(guī)律研究。在影響山羊生長發(fā)育的眾多microRNAs中,選取了兩個重要的microRNAs (miR-1和miR-133)作為研究對象,并利用生物信息學...
【文章頁數】:81 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 研究背景
1.2 NcRNA
1.2.1 NcRNA的種類
1.2.2 NcRNA的功能
1.2.3 NcRNA小家族成員——miRNA與siRNA
1.3 MicroRNA的來源及其作用機制
1.4 MicroRNA的特征
1.4.1 MicroRNAs的存在形式
1.4.2 MicroRNA的生物學特性
1.5 MiRNA、miRNA-1和miRNA-133的功能及其研究進展
1.5.1 MiRNAs的功能
1.5.2 MiRNA-1和miRNA-133對動物發(fā)育的調控作用
1.5.3 MiRNA-1和miRNA-133對肌細胞增殖與分化的調控
1.5.4 MiRNA-1和miRNA-133對動物疾病發(fā)生的影響
1.6 MicroRNA基因的鑒定
1.6.1 構建富集miRNA的cDNA文庫法
1.6.2 生物信息學分析法
1.7 MiRNA靶基因的預測與鑒定
1.7.1 MiRNA靶基因的預測
1.7.2 MiRNA靶基因的鑒定
1.8 MiRNA的研究展望
第二章 山羊miR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)時空表達規(guī)律研究
引言
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗對象
2.1.2 主要儀器與設備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 相關溶液配置
2.2 實驗方法
2.2.1 MiRNA-1和miRNA-133引物設計與合成
2.2.2 總RNA提取和cDNA合成
2.2.3 MiR-1和miR-133靶基因的預測
2.2.4 3'RACE法擴增靶基因的3'UTR
2.2.5 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)熒光定量檢測
2.3 結果與分析
2.3.1 總RNA的抽提與檢測
2.3.2 MiR-1、miR-133以及靶基因(HDAC4和SRF)基因的獲得
2.3.3 3'RACE方法擴增HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR
2.3.4 3'RACE方法擴增HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR基因測序圖
2.3.5 熒光定量的結果
2.4 討論
2.4.1 RNA純度的測定與檢驗
2.4.2 測序方式的選擇
2.4.3 MiR-1和miR-133的靶基因預測
2.4.4 3'RACE方法擴增靶基因HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR以及測序分析
2.4.5 山羊miR-1和miR-133以及靶基因(HDAC4和SRF)定量方法的建立
2.4.6 關于miRNA、miR-1和miR-133及其靶基因的功能
2.4.7 山羊生長發(fā)育與miR-1和miR-133可能的關系
2.5 小結
第三章 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
引言
3.1 材料和方法
3.1.1 主要試劑
3.1.2 主要儀器
3.1.3 常用溶液的配制
3.1.4 細胞培養(yǎng)
3.1.5 細胞中總RNA的提取
3.1.6 cDNA合成
3.1.7 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
3.1.8 數據分析
3.2 結果
3.2.1 細胞總RNA提取結果
3.2.2 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
3.3 討論
3.4 小結
第四章 MiR-1和miR-133對靶基因(HDAC4和SRF)的調控研究
引言
4.1 材料和方法
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器
4.1.3 常用溶液的配制
4.1.4 Real Time PCR和Western blotting對miR-1和miR-133靶基因表達的驗證
4.1.4.1 MiRNA mimics轉染條件的摸索
4.2 結果
4.2.1 細胞總RNA提取結果
4.2.2 MiRNA mimics轉染條件的摸索結果
4.2.3 MiR-1和miR-133 mimics瞬時轉染結果
4.2.4 MiR-1和miR-133 mimics瞬轉后HDAC4和SRF mRNA表達的檢測
4.2.5 miR-1和miR-133 mimics轉染后HDAC4和SRF蛋白的表達的檢測
4.3 討論
4.4 小結
結論
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3736765
【文章頁數】:81 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
1.1 研究背景
1.2 NcRNA
1.2.1 NcRNA的種類
1.2.2 NcRNA的功能
1.2.3 NcRNA小家族成員——miRNA與siRNA
1.3 MicroRNA的來源及其作用機制
1.4 MicroRNA的特征
1.4.1 MicroRNAs的存在形式
1.4.2 MicroRNA的生物學特性
1.5 MiRNA、miRNA-1和miRNA-133的功能及其研究進展
1.5.1 MiRNAs的功能
1.5.2 MiRNA-1和miRNA-133對動物發(fā)育的調控作用
1.5.3 MiRNA-1和miRNA-133對肌細胞增殖與分化的調控
1.5.4 MiRNA-1和miRNA-133對動物疾病發(fā)生的影響
1.6 MicroRNA基因的鑒定
1.6.1 構建富集miRNA的cDNA文庫法
1.6.2 生物信息學分析法
1.7 MiRNA靶基因的預測與鑒定
1.7.1 MiRNA靶基因的預測
1.7.2 MiRNA靶基因的鑒定
1.8 MiRNA的研究展望
第二章 山羊miR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)時空表達規(guī)律研究
引言
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗對象
2.1.2 主要儀器與設備
2.1.3 主要試劑
2.1.4 相關溶液配置
2.2 實驗方法
2.2.1 MiRNA-1和miRNA-133引物設計與合成
2.2.2 總RNA提取和cDNA合成
2.2.3 MiR-1和miR-133靶基因的預測
2.2.4 3'RACE法擴增靶基因的3'UTR
2.2.5 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)熒光定量檢測
2.3 結果與分析
2.3.1 總RNA的抽提與檢測
2.3.2 MiR-1、miR-133以及靶基因(HDAC4和SRF)基因的獲得
2.3.3 3'RACE方法擴增HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR
2.3.4 3'RACE方法擴增HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR基因測序圖
2.3.5 熒光定量的結果
2.4 討論
2.4.1 RNA純度的測定與檢驗
2.4.2 測序方式的選擇
2.4.3 MiR-1和miR-133的靶基因預測
2.4.4 3'RACE方法擴增靶基因HDAC4 3'UTR和SRF 3'UTR以及測序分析
2.4.5 山羊miR-1和miR-133以及靶基因(HDAC4和SRF)定量方法的建立
2.4.6 關于miRNA、miR-1和miR-133及其靶基因的功能
2.4.7 山羊生長發(fā)育與miR-1和miR-133可能的關系
2.5 小結
第三章 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
引言
3.1 材料和方法
3.1.1 主要試劑
3.1.2 主要儀器
3.1.3 常用溶液的配制
3.1.4 細胞培養(yǎng)
3.1.5 細胞中總RNA的提取
3.1.6 cDNA合成
3.1.7 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
3.1.8 數據分析
3.2 結果
3.2.1 細胞總RNA提取結果
3.2.2 MiR-1和miR-133及其靶基因(HDAC4和SRF)在山羊骨骼肌衛(wèi)星細胞中的表達規(guī)律
3.3 討論
3.4 小結
第四章 MiR-1和miR-133對靶基因(HDAC4和SRF)的調控研究
引言
4.1 材料和方法
4.1.1 主要試劑
4.1.2 主要儀器
4.1.3 常用溶液的配制
4.1.4 Real Time PCR和Western blotting對miR-1和miR-133靶基因表達的驗證
4.1.4.1 MiRNA mimics轉染條件的摸索
4.2 結果
4.2.1 細胞總RNA提取結果
4.2.2 MiRNA mimics轉染條件的摸索結果
4.2.3 MiR-1和miR-133 mimics瞬時轉染結果
4.2.4 MiR-1和miR-133 mimics瞬轉后HDAC4和SRF mRNA表達的檢測
4.2.5 miR-1和miR-133 mimics轉染后HDAC4和SRF蛋白的表達的檢測
4.3 討論
4.4 小結
結論
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3736765
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