2018—2019年LX4型雞傳染性支氣管炎病毒S1基因變異性分析
發(fā)布時(shí)間:2023-02-05 18:04
為了解近兩年我國(guó)家禽中流行的IBV S1基因的變異情況,文章對(duì)2018—2019年雞傳染性支氣管炎病毒(IBV)陽(yáng)性樣本進(jìn)行檢測(cè),共分離到134株IBV,進(jìn)一步對(duì)分離株S1基因進(jìn)行克隆和測(cè)序鑒定。結(jié)果顯示經(jīng)過(guò)與NCBI登錄的參考毒株序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)107株分離株為L(zhǎng)X4型,并且與LX4(AY338732)的氨基酸同源性為88.0%~95.2%,且點(diǎn)突變較多,糖基化位點(diǎn)在第54、138、247、447、454位出現(xiàn)變異和缺失,第533位蛋白質(zhì)裂解位點(diǎn)也出現(xiàn)不同程度的變異。以上結(jié)果表明近兩年我國(guó)流行的IBV S1基因已出現(xiàn)不同程度的變異。
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毒株來(lái)源和參考毒株
1.2 主要試劑及儀器
1.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.4 病毒分離與鑒定
1.5 S1基因擴(kuò)增和遺傳變異性分析
1.6 S1基因進(jìn)化樹(shù)及遺傳變異性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 雞胚病毒分離
2.2 S1基因PCR鑒定結(jié)果
2.3 LX4型分離株S1基因同源性及進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 LX4型分離株S1基因氨基酸差異性分析
3 討論
3.1 影響IBV分離的因素
3.2 IBV變異及其影響
4 結(jié)論
本文編號(hào):3735435
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1 材料與方法
1.1 毒株來(lái)源和參考毒株
1.2 主要試劑及儀器
1.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.4 病毒分離與鑒定
1.5 S1基因擴(kuò)增和遺傳變異性分析
1.6 S1基因進(jìn)化樹(shù)及遺傳變異性分析
2 結(jié)果與分析
2.1 雞胚病毒分離
2.2 S1基因PCR鑒定結(jié)果
2.3 LX4型分離株S1基因同源性及進(jìn)化樹(shù)分析
2.4 LX4型分離株S1基因氨基酸差異性分析
3 討論
3.1 影響IBV分離的因素
3.2 IBV變異及其影響
4 結(jié)論
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