基于代謝組學的水牛早期胚胎發(fā)育潛能預測模型建立的初步研究
發(fā)布時間:2023-01-03 09:58
胚胎代謝組學的變化動態(tài)地反映了胚胎發(fā)育狀態(tài)及其對內(nèi)外環(huán)境做出的應答,可作為胚胎發(fā)育潛能的評價標準。基于胚胎代謝組學的整體預測模式比以形態(tài)學為基礎(chǔ)的傳統(tǒng)評價方法對胚胎發(fā)育潛能的預測具有更好的一致性和預見性。本研究通過建立單胚胎培養(yǎng)體系,借助代謝組學的理論和方法,初步建立了早期胚胎發(fā)育潛能的預測模型。本研究分為三個部分,簡述如下: 研究一,通過改良當前水牛胚胎體外培養(yǎng)體系,初步建立了培養(yǎng)效果較好的單胚胎培養(yǎng)系統(tǒng)。本實驗中,將水牛胚胎的體外培養(yǎng)分為兩步。第一步是水牛卵子進行體外受精后,將假定受精卵移入提前培養(yǎng)好的單層細胞中,第二步將成功發(fā)育至桑葚胚的胚胎移入無血清微滴中進行單胚胎培養(yǎng)。實驗結(jié)果顯示,兩步法培養(yǎng)水牛單胚胎,相比較于傳統(tǒng)方法培養(yǎng)水牛胚胎,培養(yǎng)效率(指桑葚胚發(fā)育至囊胚效率)較低(51.2%V.S40.4%,),但優(yōu)于一些文獻報道中的無血清單胚胎培養(yǎng)實驗的囊胚發(fā)育率。兩步法無血清的單胚胎培養(yǎng)平臺的建立,為后續(xù)代謝組學研究奠定了基礎(chǔ)。 研究二,探討了兩步法培養(yǎng)水牛胚胎過程中第二步培養(yǎng)時血清和BSA在水牛胚胎發(fā)育過程中拉曼指紋圖譜的變化。結(jié)果顯示,在血清培養(yǎng)系統(tǒng)中,不同來源的...
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
1. 胚胎體外培養(yǎng)系統(tǒng)
1.1 植入前胚胎培養(yǎng)液
1.1.1 含血清的培養(yǎng)系統(tǒng)
1.1.2 無血清培養(yǎng)系統(tǒng)
1.2 植入前胚胎培養(yǎng)系統(tǒng)其他相關(guān)因素
1.2.1 培養(yǎng)箱氣相環(huán)境
1.2.2 培養(yǎng)方式
2. 單胚胎培養(yǎng)應用于代謝研究
2.1 代謝組學
2.2 代謝組學研究應用于單胚胎研究
2.2.1 單胚胎培養(yǎng)
2.2.2 代謝組學應用于單胚胎研究
3. 拉曼光譜學應用于代謝組學研究
3.1 拉曼光譜
3.2 拉曼光譜在生命科學領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀
4 基于支持向量機的拉曼光譜數(shù)據(jù)分類及預測
4.1 支持向量機算法簡介
4.2 SVM原理
4.3 提高SVM的性能討論
第二部分 實驗研究
第一章 實驗材料及方法
1 實驗材料和主要儀器
1.1 主要試劑
1.2 操作液
1.3 主要實驗儀器
2 試驗方法
2.1 共培養(yǎng)系統(tǒng)單層的制備
2.2 卵泡液的制備
2.3 發(fā)情牛血清的制備
2.4 卵母細胞的體外成熟(IVM)
2.5 卵母細胞的體外受精(IVF)
2.6 胚胎培養(yǎng)(IVC)
2.7 單胚胎培養(yǎng)液的收集
2.8 單胚胎培養(yǎng)液拉曼光譜的測量
2.9 統(tǒng)計分析
第二章 兩步法培養(yǎng)水牛單胚胎
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
分析和討論
小結(jié)
第三章 對單胚胎培養(yǎng)液的拉曼光譜研究
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
1 不同積分時間對樣品拉曼光譜結(jié)果的影響
2 不同添加物對兩步法胚胎培養(yǎng)的拉曼光譜
分析和討論
1 不同積分時間對樣品拉曼光譜結(jié)果的影響
2 血清對兩步法胚胎培養(yǎng)的拉曼光譜的影響
小結(jié)
第四章 胚胎發(fā)育潛能的預測模型初步建立
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
分析和討論
1 測量數(shù)據(jù)的可視化
2 數(shù)據(jù)預處理
3 樣本分類設(shè)置
4 SVM分類預測
5 SVM預測模型的優(yōu)化
小結(jié)
參考文獻
附錄Ⅰ 重要術(shù)語中英文對照表
附錄Ⅱ 拉曼特征峰物質(zhì)歸屬表
致謝
碩士期間發(fā)表文章情況
【參考文獻】:
期刊論文
[1]代謝組學:一個迅速發(fā)展的新興學科(英文)[J]. 唐惠儒,王玉蘭. 生物化學與生物物理進展. 2006(05)
本文編號:3727249
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
1. 胚胎體外培養(yǎng)系統(tǒng)
1.1 植入前胚胎培養(yǎng)液
1.1.1 含血清的培養(yǎng)系統(tǒng)
1.1.2 無血清培養(yǎng)系統(tǒng)
1.2 植入前胚胎培養(yǎng)系統(tǒng)其他相關(guān)因素
1.2.1 培養(yǎng)箱氣相環(huán)境
1.2.2 培養(yǎng)方式
2. 單胚胎培養(yǎng)應用于代謝研究
2.1 代謝組學
2.2 代謝組學研究應用于單胚胎研究
2.2.1 單胚胎培養(yǎng)
2.2.2 代謝組學應用于單胚胎研究
3. 拉曼光譜學應用于代謝組學研究
3.1 拉曼光譜
3.2 拉曼光譜在生命科學領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀
4 基于支持向量機的拉曼光譜數(shù)據(jù)分類及預測
4.1 支持向量機算法簡介
4.2 SVM原理
4.3 提高SVM的性能討論
第二部分 實驗研究
第一章 實驗材料及方法
1 實驗材料和主要儀器
1.1 主要試劑
1.2 操作液
1.3 主要實驗儀器
2 試驗方法
2.1 共培養(yǎng)系統(tǒng)單層的制備
2.2 卵泡液的制備
2.3 發(fā)情牛血清的制備
2.4 卵母細胞的體外成熟(IVM)
2.5 卵母細胞的體外受精(IVF)
2.6 胚胎培養(yǎng)(IVC)
2.7 單胚胎培養(yǎng)液的收集
2.8 單胚胎培養(yǎng)液拉曼光譜的測量
2.9 統(tǒng)計分析
第二章 兩步法培養(yǎng)水牛單胚胎
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
分析和討論
小結(jié)
第三章 對單胚胎培養(yǎng)液的拉曼光譜研究
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
1 不同積分時間對樣品拉曼光譜結(jié)果的影響
2 不同添加物對兩步法胚胎培養(yǎng)的拉曼光譜
分析和討論
1 不同積分時間對樣品拉曼光譜結(jié)果的影響
2 血清對兩步法胚胎培養(yǎng)的拉曼光譜的影響
小結(jié)
第四章 胚胎發(fā)育潛能的預測模型初步建立
前言
實驗設(shè)計與結(jié)果
分析和討論
1 測量數(shù)據(jù)的可視化
2 數(shù)據(jù)預處理
3 樣本分類設(shè)置
4 SVM分類預測
5 SVM預測模型的優(yōu)化
小結(jié)
參考文獻
附錄Ⅰ 重要術(shù)語中英文對照表
附錄Ⅱ 拉曼特征峰物質(zhì)歸屬表
致謝
碩士期間發(fā)表文章情況
【參考文獻】:
期刊論文
[1]代謝組學:一個迅速發(fā)展的新興學科(英文)[J]. 唐惠儒,王玉蘭. 生物化學與生物物理進展. 2006(05)
本文編號:3727249
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3727249.html
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