反芻家畜隱孢子蟲分子流行病學(xué)及微小隱孢子蟲群體遺傳研究
發(fā)布時(shí)間:2022-12-22 23:59
隱孢子蟲(Cryptosporidium)是一種呈全球性分布的重要食源性/水源性人獸共患病原蟲,它可以通過多種途徑導(dǎo)致人類和其他動(dòng)物感染隱孢子蟲病,是人和動(dòng)物急性腹瀉或慢性致死性腹瀉的重要致病因子。隱孢子蟲屬內(nèi)種類眾多,已命名26個(gè)有效蟲種和70多個(gè)基因型。由隱孢子蟲引起的隱孢子蟲病是重要的人獸共患病,隱孢子蟲病可感染包括人類在內(nèi)的280多種動(dòng)物,與糞便接觸、食用被隱孢子蟲卵囊污染的食物或水都可以傳播隱孢子蟲病。目前對(duì)隱孢子蟲病的致病機(jī)理并不完全清楚,也尚無有效的治療藥物或疫苗。因此,隱孢子蟲病不僅對(duì)畜牧養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)生重大的威脅,也對(duì)人類的健康產(chǎn)生巨大影響。為了解我國山羊隱孢子蟲流行狀況和公共衛(wèi)生意義,對(duì)河南省和重慶市共7個(gè)養(yǎng)殖場(chǎng)1265份山羊糞便樣品進(jìn)行了檢測(cè)。隱孢子蟲感染率為3.48%(44/1256)。不同年齡段隱孢子蟲感染率存在顯著性差異,斷奶后羔羊感染率最高達(dá)4.58%;赟SU rRNA基因的PCR-RFLP分析和DNA序列分析鑒定出3個(gè)種,包括發(fā)現(xiàn)于河南省和重慶市山羊種的C.ubiquitum (24/44),發(fā)現(xiàn)于河南省的C.andersoni (16/44)和C.xia...
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 隱孢子蟲宿主特異性
2 牛羊隱孢子蟲病
2.1 牛隱孢子蟲病
2.2 羊隱孢子蟲病
3 隱孢子蟲基因分型
3.1 隱孢子蟲基因分型工具
3.2 隱孢子蟲基因亞型工具
3.3 隱孢子蟲群體遺傳分析技術(shù)
4 牛羊微小隱孢子蟲(C.parvum)感染
5 微小隱孢子蟲(Cparvum)亞型和人獸共患傳播
6 結(jié)語
第二章 河南和重慶山羊隱孢子蟲分子流行病學(xué)研究
1 引言
2 材料與方法
2.1 樣品來源
2.2 試劑配制
2.3 顯微鏡檢查
2.4 DNA提取
2.5 SSU rRNA基因PCR擴(kuò)增
2.6 泛在隱孢子蟲(C.ubiquitum)亞型分型
2.7 RFLP鑒定
2.8 DNA序列分析
2.9 凝膠電泳
2.10 種系發(fā)育分析
2.11 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 山羊隱孢子蟲感染率
3.2 隱孢子蟲種類分布情況
3.3 隱孢子蟲種類年齡類型
3.4 泛在隱孢子蟲(C.ubiquitum)亞型
3.5 種系發(fā)育分析
4 討論
第三章 寧夏奶牛隱孢子蟲分子流行病學(xué)研究
1 引言
2 材料與方法
2.1 樣品來源
2.2 顯微鏡檢查方法
2.3 DNA提取
2.4 SSU rRNA基因PCR擴(kuò)增
2.5 RFLP鑒定和DNA序列分析
2.6 凝膠電泳
2.7 種系發(fā)育分析
2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 隱孢子蟲感染率
3.2 奶牛感染隱孢子蟲種類分布
3.3 不同年齡段隱孢子蟲種類分布特征
3.4 隱孢子蟲亞型
4 討論
第四章 微小隱孢子蟲IID分離株多位點(diǎn)序列分型及群體遺傳分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 微小隱孢子蟲(Cparvum)樣品采集
2.2 多位點(diǎn)序列分型
2.3 種系發(fā)育關(guān)系及DNA多態(tài)性分析
2.4 連鎖不平衡分析
2.5 STRUCTURE分析
2.6 核苷酸序列登錄號(hào)
3 結(jié)果
3.1 MLST亞型及序列多態(tài)性
3.2 西亞地區(qū)在gp60基因位點(diǎn)上具有較高的遺傳多態(tài)性
3.3 種系發(fā)育分析揭示分離株存在顯著的地理區(qū)域隔離
3.4 LD分析表明IId分離株為克隆性群體結(jié)構(gòu)
3.5 STRUCTURE分析產(chǎn)生3個(gè)祖先群
4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重慶市部分種羊場(chǎng)山羊隱孢子蟲感染情況調(diào)查[J]. 陳靜,沈克飛,任航行,高立芳,寧長(zhǎng)申. 中國獸醫(yī)雜志. 2012(12)
[2]廣西奶牛隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 陶立,陳澤祥,韋志鋒,王榮軍,秦若甫,李軍,唐林生,彭昊,蘭美益,魏曉瑞,楊威. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(07)
[3]隱孢子蟲基因分型標(biāo)記的研究進(jìn)展[J]. 王強(qiáng),安春霞,菅復(fù)春,朱靜靜,寧長(zhǎng)申,張龍現(xiàn). 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2010(03)
[4]乳牛源隱孢子蟲種類的PCR-RFLP和分子種系發(fā)育分析鑒定[J]. 梁楠,菅復(fù)春,李家誠,仇書興,張龍現(xiàn). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2009(01)
[5]河南省山羊隱孢子蟲流行病學(xué)調(diào)查[J]. 崔彬,王永立,菅復(fù)春,陳玉霞,馬超鋒,張龍現(xiàn),寧長(zhǎng)申. 中國獸醫(yī)雜志. 2008(09)
[6]河南省部分地區(qū)乳牛隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 盧慶斌,仇書興,茹寶瑞,劉偉,王淑梅,苗霆,王巖,段張秀,寧長(zhǎng)申,張龍現(xiàn). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(03)
[7]河南省綿羊隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王永立,崔彬,菅復(fù)春,張龍現(xiàn),寧長(zhǎng)申,董和平,盧慶斌,高庚渠. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(02)
[8]天津地區(qū)奶牛感染隱孢子蟲情況的調(diào)查[J]. 孟然,王欣,董明,張振庭,劉俊燕,紀(jì)偉華,楊秀珍. 中國病原生物學(xué)雜志. 2007(03)
[9]青海省化隆縣牦牛隱孢子蟲流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王春景,劉恒明. 中國獸醫(yī)雜志. 2007(05)
[10]PCR-RFLP鑒定隱孢子蟲種類研究[J]. 張龍現(xiàn),蔣金書,劉群,寧長(zhǎng)申,趙金鳳,劉紅英. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2004(05)
本文編號(hào):3724301
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 隱孢子蟲宿主特異性
2 牛羊隱孢子蟲病
2.1 牛隱孢子蟲病
2.2 羊隱孢子蟲病
3 隱孢子蟲基因分型
3.1 隱孢子蟲基因分型工具
3.2 隱孢子蟲基因亞型工具
3.3 隱孢子蟲群體遺傳分析技術(shù)
4 牛羊微小隱孢子蟲(C.parvum)感染
5 微小隱孢子蟲(Cparvum)亞型和人獸共患傳播
6 結(jié)語
第二章 河南和重慶山羊隱孢子蟲分子流行病學(xué)研究
1 引言
2 材料與方法
2.1 樣品來源
2.2 試劑配制
2.3 顯微鏡檢查
2.4 DNA提取
2.5 SSU rRNA基因PCR擴(kuò)增
2.6 泛在隱孢子蟲(C.ubiquitum)亞型分型
2.7 RFLP鑒定
2.8 DNA序列分析
2.9 凝膠電泳
2.10 種系發(fā)育分析
2.11 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 山羊隱孢子蟲感染率
3.2 隱孢子蟲種類分布情況
3.3 隱孢子蟲種類年齡類型
3.4 泛在隱孢子蟲(C.ubiquitum)亞型
3.5 種系發(fā)育分析
4 討論
第三章 寧夏奶牛隱孢子蟲分子流行病學(xué)研究
1 引言
2 材料與方法
2.1 樣品來源
2.2 顯微鏡檢查方法
2.3 DNA提取
2.4 SSU rRNA基因PCR擴(kuò)增
2.5 RFLP鑒定和DNA序列分析
2.6 凝膠電泳
2.7 種系發(fā)育分析
2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 隱孢子蟲感染率
3.2 奶牛感染隱孢子蟲種類分布
3.3 不同年齡段隱孢子蟲種類分布特征
3.4 隱孢子蟲亞型
4 討論
第四章 微小隱孢子蟲IID分離株多位點(diǎn)序列分型及群體遺傳分析
1 引言
2 材料與方法
2.1 微小隱孢子蟲(Cparvum)樣品采集
2.2 多位點(diǎn)序列分型
2.3 種系發(fā)育關(guān)系及DNA多態(tài)性分析
2.4 連鎖不平衡分析
2.5 STRUCTURE分析
2.6 核苷酸序列登錄號(hào)
3 結(jié)果
3.1 MLST亞型及序列多態(tài)性
3.2 西亞地區(qū)在gp60基因位點(diǎn)上具有較高的遺傳多態(tài)性
3.3 種系發(fā)育分析揭示分離株存在顯著的地理區(qū)域隔離
3.4 LD分析表明IId分離株為克隆性群體結(jié)構(gòu)
3.5 STRUCTURE分析產(chǎn)生3個(gè)祖先群
4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]重慶市部分種羊場(chǎng)山羊隱孢子蟲感染情況調(diào)查[J]. 陳靜,沈克飛,任航行,高立芳,寧長(zhǎng)申. 中國獸醫(yī)雜志. 2012(12)
[2]廣西奶牛隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 陶立,陳澤祥,韋志鋒,王榮軍,秦若甫,李軍,唐林生,彭昊,蘭美益,魏曉瑞,楊威. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(07)
[3]隱孢子蟲基因分型標(biāo)記的研究進(jìn)展[J]. 王強(qiáng),安春霞,菅復(fù)春,朱靜靜,寧長(zhǎng)申,張龍現(xiàn). 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2010(03)
[4]乳牛源隱孢子蟲種類的PCR-RFLP和分子種系發(fā)育分析鑒定[J]. 梁楠,菅復(fù)春,李家誠,仇書興,張龍現(xiàn). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2009(01)
[5]河南省山羊隱孢子蟲流行病學(xué)調(diào)查[J]. 崔彬,王永立,菅復(fù)春,陳玉霞,馬超鋒,張龍現(xiàn),寧長(zhǎng)申. 中國獸醫(yī)雜志. 2008(09)
[6]河南省部分地區(qū)乳牛隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 盧慶斌,仇書興,茹寶瑞,劉偉,王淑梅,苗霆,王巖,段張秀,寧長(zhǎng)申,張龍現(xiàn). 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(03)
[7]河南省綿羊隱孢子蟲病的流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王永立,崔彬,菅復(fù)春,張龍現(xiàn),寧長(zhǎng)申,董和平,盧慶斌,高庚渠. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(02)
[8]天津地區(qū)奶牛感染隱孢子蟲情況的調(diào)查[J]. 孟然,王欣,董明,張振庭,劉俊燕,紀(jì)偉華,楊秀珍. 中國病原生物學(xué)雜志. 2007(03)
[9]青海省化隆縣牦牛隱孢子蟲流行病學(xué)調(diào)查[J]. 王春景,劉恒明. 中國獸醫(yī)雜志. 2007(05)
[10]PCR-RFLP鑒定隱孢子蟲種類研究[J]. 張龍現(xiàn),蔣金書,劉群,寧長(zhǎng)申,趙金鳳,劉紅英. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2004(05)
本文編號(hào):3724301
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