本研究以櫻桃谷鴨（104只）、三穗鴨（133只）和興義鴨（110只）為材料，主要采用PCR-SSCP結(jié)合直接測序法研究MyoD1、DRD1和SCD1基因變異對血清生化指標和肉質(zhì)性狀的遺傳效應，并對不同多態(tài)位點及多態(tài)座位間的不同基因型進行聚合效應分析，以期找出對血清生化指標和肉質(zhì)性狀有積極影響作用的分子遺傳標記輔助選擇位點，服務于鴨的早期選育和育種工作，為改善鴨肉質(zhì)性狀，提高鴨的生產(chǎn)性能提供理論依據(jù)，為下一步開展3個基因的作用機制，基因間聚合效應研究等奠定工作基礎。本研究主要結(jié)果如下： 1．鴨MyoD1基因多態(tài)對肉質(zhì)和血清生化指標的遺傳效應分析 （1）設計5對引物對MyoD1基因的1-4全部外顯子及部分5’調(diào)控區(qū)和內(nèi)含子進行SNPs檢測，在櫻桃谷鴨和興義鴨MyoD1基因g.95589-95863區(qū)域發(fā)現(xiàn)1個處于5’調(diào)控區(qū)的SNP位點g.95617C＞G，均屬中度多態(tài)座位，基因型分布均未偏離Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05）。在三穗鴨MyoD1基因g.95589-95863區(qū)域檢測到5個SNPs位點，其中g.95730G＞A處于5’端調(diào)控區(qū)內(nèi)；g.95740G＞A... 

【文章頁數(shù)】：108 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1.1 前言
    1.2 實驗鴨品種介紹
        1.2.1 櫻桃谷鴨
        1.2.2 三穗鴨
        1.2.3 興義鴨
    1.3 MyoD1 的研究進展
        1.3.1 MyoD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學功能
        1.3.2 MyoD1 的多態(tài)性研究
    1.4 DRD1 的研究進展
        1.4.1 DRD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學功能
        1.4.2 DRD1 的多態(tài)性研究
    1.5 SCD1 的研究進展
        1.5.1 SCD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學功能
        1.5.2 SCD1 基因的多態(tài)性研究
    1.6 PCR-SSCP 法
        1.6.1 PCR-SSCP 的原理及步驟
        1.6.2 PCR-SSCP 技術的應用
        1.6.3 PCR-SSCP 技術應用注意事項
    1.7 single nucleotide Polymorphism，SNP
    1.8 本研究的目的與意義
第二章 鴨 MyoD1 基因多態(tài)與肉質(zhì)和血清生化指標關聯(lián)性分析
    2.1 前言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 試驗鴨群
        2.2.2 試驗儀器
        2.2.3 試驗主要試劑
        2.2.4 試驗方法
            2.2.4.1 測定的肉質(zhì)性狀及方法
            2.2.4.2 血清生化指標測定方法
        2.2.5 試驗主要溶液的配制
        2.2.6 鴨全基因組 DNA 酚-氯仿提取方法
        2.2.7 DNA 濃度和純度檢測
        2.2.8 瓊脂糖凝膠電泳檢測
        2.2.9 引物設計與合成
        2.2.10 合成引物的稀釋
        2.2.11 PCR 擴增
        2.2.12 PCR 產(chǎn)物檢測
        2.2.13 PCR 產(chǎn)物純化
        2.2.14 PCR-SSCP 檢測
        2.2.15 制膠方法及電泳
        2.2.16 聚丙烯酰胺凝膠銀染
        2.2.17 序列分析
        2.2.18 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
        2.2.19 群體遺傳特性分析
            2.2.19.1 基因頻率和基因型頻率
            2.2.19.2 群體純合度
            2.2.19.3 群體雜合度
            2.2.19.4 有效等位基因數(shù)
            2.2.19.5 多態(tài)信息含量(PIC)
            2.2.19.6 群體 Hardy-Weinberg 平衡狀態(tài)的檢驗
        2.2.20 單基因聚合模型
        2.2.21 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 DNA 檢測結(jié)果
        2.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測結(jié)果
        2.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
            2.3.3.1 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-1F/1R 擴增的目的片段PCR-SSCP 分型
            2.3.3.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴增目的片段PCR-SSCP 分型
            2.3.3.3 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-4F1/4R1 擴增目的片段PCR-SSCP 分型
        2.3.4 SNPs 檢測結(jié)果
            2.3.4.1 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-1F/1R 擴增的目的片段SNPs 分析
            2.3.4.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴增目的片段 SNPs分析
            2.3.4.3 鴨MyoD1基因引物MyoD1-4F1/4R1擴增目的片段SNPs分析
        2.3.5 基因遺傳特性分析結(jié)果
            2.3.5.1 鴨MyoD1基因MyoD1-1F/1R引物擴增區(qū)域遺傳特異性分析
            2.3.5.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴增區(qū)域遺傳特異性分析
            2.3.5.3 鴨MyoD1基因引物MyoD1-4F1/4R1擴增區(qū)域遺傳特異性分析
        2.3.6 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性分析
        2.3.7 鴨MyoD1基因g.100111-100414區(qū)域多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性分析
        2.3.8 鴨 MyoD1 基因 g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性分析
        2.3.9 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)座位和g.100111-100414 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應分析
        2.3.10 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)座位和g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應分析
        2.3.11 鴨 MyoD1 基因 g.100111-100414 區(qū)域多態(tài)座位和g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應分析
    2.4 討論
第三章 鴨 DRD1 基因多態(tài)性與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性分析
    3.1 前言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 試驗材料
        3.2.2 試驗方法
        3.2.3 引物設計
        3.2.4 PCR 擴增
        3.2.5 PCR-SSCP 分型
        3.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    3.3. 結(jié)果與分析
        3.3.1 DNA 檢測結(jié)果
        3.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測結(jié)果
        3.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
            3.3.3.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴增片段 PCR-SSCP 分型
            3.3.3.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴增片段 PCR-SSCP 分型
        3.3.4 SNPs 檢測結(jié)果
            3.3.4.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴增的目的片段 SNPs 分析
            3.3.4.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴增的目的片段 SNPs 分析
        3.3.5 遺傳特性分析結(jié)果
            3.3.5.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴增片段遺傳特性分析
            3.3.5.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴增片段遺傳特性分析
        3.3.6 鴨 DRD1 基因多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)的關聯(lián)性分析
            3.3.6.1 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 130-587 bp 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)的關聯(lián)性分析
            3.3.6.2 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 572-980bp 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)的關聯(lián)性分析
            3.3.6.3 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 130-587 bp 區(qū)域多態(tài)座位和572-980bp 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應分析
    3.4 討論
第四章 鴨 SCD1 基因多態(tài)性與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的
    4.1 前言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 試驗材料
        4.2.2 試驗方法
        4.2.3 引物設計
        4.2.4 PCR 擴增
        4.2.5 PCR-SSCP 分型
        4.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 DNA 檢測結(jié)果
        4.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測結(jié)果
        4.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
        4.3.4 SNP 分析結(jié)果
        4.3.5 遺傳特性分析結(jié)果
        4.3.6 鴨 SCD1 基因多態(tài)與血清生化指標和肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性分析
    4.4 討論
第五章 結(jié)論
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 本研究創(chuàng)新點
    5.3 進一步需要開展的工作
參考文獻
致謝
附錄
附圖


【參考文獻】：
期刊論文
[1]優(yōu)質(zhì)肉雞肌苷酸與肌內(nèi)脂肪含量相關基因聚合效應研究[J]. 張增榮,杜華銳,金紅,李晴云,楊朝武,李雯,邱莫寒,劉嵐,宋小燕,蔣小松.  四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2013(03)
[2]山豬與杜洛克豬7個肉質(zhì)相關基因的比較分析[J]. 王薇,薛雷,趙丹璐,章熙霞,薛文達,許曉風.  中國畜牧雜志. 2013(17)
[3]櫻桃谷鴨DRD1基因CDS區(qū)域多態(tài)與生長性狀的關聯(lián)性分析[J]. 潘蘭兵,張依裕,林家棟,李萬貴,李思.  廣東農(nóng)業(yè)科學. 2013(15)
[4]家兔MyoD1基因多態(tài)性與生長和屠宰性能的相關性[J]. 何樺,張文秀,賴松家.  畜牧與獸醫(yī). 2013(06)
[5]高郵鴨和金定鴨胸肌早期發(fā)育及MyoD1基因表達分析[J]. 朱春紅,陶志云,宋遲,宋衛(wèi)濤,胡艷,束婧婷,章雙杰,李慧芳.  家畜生態(tài)學報. 2013(04)
[6]興義鴨體重生長曲線擬合與比較[J]. 張依裕,趙素閣,潘蘭兵,伍悅,劉傳朝,張明,王俊,肖純猛.  貴州農(nóng)業(yè)科學. 2013(03)
[7]莊河大骨雞GHR、IGF-Ⅰ基因的多態(tài)性及基因聚合對產(chǎn)肉性能的影響[J]. 王洪才,馬巍,袁曉春,宋天玉.  畜牧與獸醫(yī). 2013(02)
[8]五指山豬不同組織中Myf5與MyoD1基因的表達研究[J]. 曹婷,侯冠彧,施力光,周漢林,張立嶺.  家畜生態(tài)學報. 2012(05)
[9]鴨胚骨骼肌生肌調(diào)節(jié)因子MyoD1和Myf5發(fā)育性變化研究[J]. 陶志云,鄒劍敏,宋遲,宋衛(wèi)濤,胡艷,束婧婷,章雙杰,李慧芳.  中國家禽. 2012(17)
[10]豬MyoD1基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的相關分析[J]. 趙廣珍,賈青,張翠翠,雷娜,馮安學,邢增喜.  河北農(nóng)業(yè)大學學報. 2012(04)

博士論文
[1]動物標記輔助基因聚合優(yōu)化體系研究[D]. 徐凌洋.中國農(nóng)業(yè)科學院 2011

碩士論文
[1]鵝SCD1基因全長cDNA的克隆、組織表達及填飼對其表達的影響[D]. 付曉英.四川農(nóng)業(yè)大學 2010
[2]MyoD、MyoG基因的多態(tài)性及其與雞屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關性研究[D]. 王瓊.四川農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號：3708905