本研究以櫻桃谷鴨（104只）、三穗鴨（133只）和興義鴨（110只）為材料，主要采用PCR-SSCP結(jié)合直接測(cè)序法研究MyoD1、DRD1和SCD1基因變異對(duì)血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的遺傳效應(yīng)，并對(duì)不同多態(tài)位點(diǎn)及多態(tài)座位間的不同基因型進(jìn)行聚合效應(yīng)分析，以期找出對(duì)血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀有積極影響作用的分子遺傳標(biāo)記輔助選擇位點(diǎn)，服務(wù)于鴨的早期選育和育種工作，為改善鴨肉質(zhì)性狀，提高鴨的生產(chǎn)性能提供理論依據(jù)，為下一步開展3個(gè)基因的作用機(jī)制，基因間聚合效應(yīng)研究等奠定工作基礎(chǔ)。本研究主要結(jié)果如下： 1．鴨MyoD1基因多態(tài)對(duì)肉質(zhì)和血清生化指標(biāo)的遺傳效應(yīng)分析 （1）設(shè)計(jì)5對(duì)引物對(duì)MyoD1基因的1-4全部外顯子及部分5’調(diào)控區(qū)和內(nèi)含子進(jìn)行SNPs檢測(cè)，在櫻桃谷鴨和興義鴨MyoD1基因g.95589-95863區(qū)域發(fā)現(xiàn)1個(gè)處于5’調(diào)控區(qū)的SNP位點(diǎn)g.95617C＞G，均屬中度多態(tài)座位，基因型分布均未偏離Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05）。在三穗鴨MyoD1基因g.95589-95863區(qū)域檢測(cè)到5個(gè)SNPs位點(diǎn)，其中g(shù).95730G＞A處于5’端調(diào)控區(qū)內(nèi)；g.95740G＞A... 

【文章頁(yè)數(shù)】：108 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 前言
    1.2 實(shí)驗(yàn)鴨品種介紹
        1.2.1 櫻桃谷鴨
        1.2.2 三穗鴨
        1.2.3 興義鴨
    1.3 MyoD1 的研究進(jìn)展
        1.3.1 MyoD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
        1.3.2 MyoD1 的多態(tài)性研究
    1.4 DRD1 的研究進(jìn)展
        1.4.1 DRD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
        1.4.2 DRD1 的多態(tài)性研究
    1.5 SCD1 的研究進(jìn)展
        1.5.1 SCD1 基因的結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
        1.5.2 SCD1 基因的多態(tài)性研究
    1.6 PCR-SSCP 法
        1.6.1 PCR-SSCP 的原理及步驟
        1.6.2 PCR-SSCP 技術(shù)的應(yīng)用
        1.6.3 PCR-SSCP 技術(shù)應(yīng)用注意事項(xiàng)
    1.7 single nucleotide Polymorphism，SNP
    1.8 本研究的目的與意義
第二章 鴨 MyoD1 基因多態(tài)與肉質(zhì)和血清生化指標(biāo)關(guān)聯(lián)性分析
    2.1 前言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 試驗(yàn)鴨群
        2.2.2 試驗(yàn)儀器
        2.2.3 試驗(yàn)主要試劑
        2.2.4 試驗(yàn)方法
            2.2.4.1 測(cè)定的肉質(zhì)性狀及方法
            2.2.4.2 血清生化指標(biāo)測(cè)定方法
        2.2.5 試驗(yàn)主要溶液的配制
        2.2.6 鴨全基因組 DNA 酚-氯仿提取方法
        2.2.7 DNA 濃度和純度檢測(cè)
        2.2.8 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
        2.2.9 引物設(shè)計(jì)與合成
        2.2.10 合成引物的稀釋
        2.2.11 PCR 擴(kuò)增
        2.2.12 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)
        2.2.13 PCR 產(chǎn)物純化
        2.2.14 PCR-SSCP 檢測(cè)
        2.2.15 制膠方法及電泳
        2.2.16 聚丙烯酰胺凝膠銀染
        2.2.17 序列分析
        2.2.18 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
        2.2.19 群體遺傳特性分析
            2.2.19.1 基因頻率和基因型頻率
            2.2.19.2 群體純合度
            2.2.19.3 群體雜合度
            2.2.19.4 有效等位基因數(shù)
            2.2.19.5 多態(tài)信息含量(PIC)
            2.2.19.6 群體 Hardy-Weinberg 平衡狀態(tài)的檢驗(yàn)
        2.2.20 單基因聚合模型
        2.2.21 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 DNA 檢測(cè)結(jié)果
        2.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
        2.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
            2.3.3.1 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-1F/1R 擴(kuò)增的目的片段PCR-SSCP 分型
            2.3.3.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴(kuò)增目的片段PCR-SSCP 分型
            2.3.3.3 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-4F1/4R1 擴(kuò)增目的片段PCR-SSCP 分型
        2.3.4 SNPs 檢測(cè)結(jié)果
            2.3.4.1 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-1F/1R 擴(kuò)增的目的片段SNPs 分析
            2.3.4.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴(kuò)增目的片段 SNPs分析
            2.3.4.3 鴨MyoD1基因引物MyoD1-4F1/4R1擴(kuò)增目的片段SNPs分析
        2.3.5 基因遺傳特性分析結(jié)果
            2.3.5.1 鴨MyoD1基因MyoD1-1F/1R引物擴(kuò)增區(qū)域遺傳特異性分析
            2.3.5.2 鴨 MyoD1 基因引物 MyoD1-3F/3R 擴(kuò)增區(qū)域遺傳特異性分析
            2.3.5.3 鴨MyoD1基因引物MyoD1-4F1/4R1擴(kuò)增區(qū)域遺傳特異性分析
        2.3.6 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性分析
        2.3.7 鴨MyoD1基因g.100111-100414區(qū)域多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性分析
        2.3.8 鴨 MyoD1 基因 g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性分析
        2.3.9 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)座位和g.100111-100414 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應(yīng)分析
        2.3.10 鴨 MyoD1 基因 g.95589-95863 區(qū)域多態(tài)座位和g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應(yīng)分析
        2.3.11 鴨 MyoD1 基因 g.100111-100414 區(qū)域多態(tài)座位和g.100956-101194 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應(yīng)分析
    2.4 討論
第三章 鴨 DRD1 基因多態(tài)性與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性分析
    3.1 前言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 試驗(yàn)材料
        3.2.2 試驗(yàn)方法
        3.2.3 引物設(shè)計(jì)
        3.2.4 PCR 擴(kuò)增
        3.2.5 PCR-SSCP 分型
        3.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
    3.3. 結(jié)果與分析
        3.3.1 DNA 檢測(cè)結(jié)果
        3.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
        3.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
            3.3.3.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴(kuò)增片段 PCR-SSCP 分型
            3.3.3.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴(kuò)增片段 PCR-SSCP 分型
        3.3.4 SNPs 檢測(cè)結(jié)果
            3.3.4.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴(kuò)增的目的片段 SNPs 分析
            3.3.4.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴(kuò)增的目的片段 SNPs 分析
        3.3.5 遺傳特性分析結(jié)果
            3.3.5.1 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F1/R1 擴(kuò)增片段遺傳特性分析
            3.3.5.2 鴨 DRD1 基因引物 DRD1F2/R2 擴(kuò)增片段遺傳特性分析
        3.3.6 鴨 DRD1 基因多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析
            3.3.6.1 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 130-587 bp 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析
            3.3.6.2 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 572-980bp 區(qū)域多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析
            3.3.6.3 鴨 DRD1 基因編碼區(qū) 130-587 bp 區(qū)域多態(tài)座位和572-980bp 區(qū)域多態(tài)座位聚合效應(yīng)分析
    3.4 討論
第四章 鴨 SCD1 基因多態(tài)性與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的
    4.1 前言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 試驗(yàn)材料
        4.2.2 試驗(yàn)方法
        4.2.3 引物設(shè)計(jì)
        4.2.4 PCR 擴(kuò)增
        4.2.5 PCR-SSCP 分型
        4.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 DNA 檢測(cè)結(jié)果
        4.3.2 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果
        4.3.3 PCR-SSCP 分型結(jié)果
        4.3.4 SNP 分析結(jié)果
        4.3.5 遺傳特性分析結(jié)果
        4.3.6 鴨 SCD1 基因多態(tài)與血清生化指標(biāo)和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)性分析
    4.4 討論
第五章 結(jié)論
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 本研究創(chuàng)新點(diǎn)
    5.3 進(jìn)一步需要開展的工作
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
附圖


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]山豬與杜洛克豬7個(gè)肉質(zhì)相關(guān)基因的比較分析[J]. 王薇,薛雷,趙丹璐,章熙霞,薛文達(dá),許曉風(fēng).  中國(guó)畜牧雜志. 2013(17)
[3]櫻桃谷鴨DRD1基因CDS區(qū)域多態(tài)與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 潘蘭兵,張依裕,林家棟,李萬(wàn)貴,李思.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[4]家兔MyoD1基因多態(tài)性與生長(zhǎng)和屠宰性能的相關(guān)性[J]. 何樺,張文秀,賴松家.  畜牧與獸醫(yī). 2013(06)
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[10]豬MyoD1基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的相關(guān)分析[J]. 趙廣珍,賈青,張翠翠,雷娜,馮安學(xué),邢增喜.  河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(04)

博士論文
[1]動(dòng)物標(biāo)記輔助基因聚合優(yōu)化體系研究[D]. 徐凌洋.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011

碩士論文
[1]鵝SCD1基因全長(zhǎng)cDNA的克隆、組織表達(dá)及填飼對(duì)其表達(dá)的影響[D]. 付曉英.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]MyoD、MyoG基因的多態(tài)性及其與雞屠宰性狀和肉質(zhì)性狀的相關(guān)性研究[D]. 王瓊.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3708905