CRISPR/Cas9敲除技術(shù)在重組動(dòng)物皰疹病毒構(gòu)建中的初步應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2022-09-29 15:50
CRISPR系統(tǒng)是原核生物的一種獲得性免疫系統(tǒng),近年來隨著CRISPR/Cas9研究的不斷發(fā)展,其基因編輯功能逐漸被應(yīng)用于各個(gè)生物學(xué)領(lǐng)域。利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)對(duì)靶標(biāo)序列的識(shí)別,輔助病毒基因的敲除和重組,可提高新毒株的獲得效率。皰疹病毒的基因組為線性雙鏈DNA分子,其中偽狂犬病病毒(PRV)和牛皰疹病毒(BHV)的基因組皆能通過sgRNA引導(dǎo),而被CRISPR/Cas9系統(tǒng)所編輯,可作為其他病毒基因敲除和重組的模式參考。本研究通過構(gòu)建含敲除目的基因左右同源臂的重組質(zhì)粒,當(dāng)目的基因被Cas9蛋白切開后,利用同源重組原理將目的基因替換為eGFP熒光標(biāo)記蛋白,從而達(dá)到基因敲除的目的,并將純化得到重組的皰疹病毒進(jìn)行生物學(xué)特性分析,建立了高效構(gòu)建皰疹病毒重組毒株的技術(shù)平臺(tái)。本論文的主要研究結(jié)果如下:1.構(gòu)建PRV TK-/eGFP+毒株利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)從PRV Bartha-K61株基因組DNA中擴(kuò)增含TK啟動(dòng)子的TK基因同源臂左臂和TK基因同源臂右臂,與eGFP基因序列一起,順序克隆至克隆載體pUC19中,構(gòu)建重組載體pUC19-...
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
第一章 CRISPR/Cas9 技術(shù)與皰疹病毒基因敲除的研究進(jìn)展
1.1 CRISPR概述
1.1.1 CRISPR/Cas9 研究歷史
1.1.2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)核心結(jié)構(gòu)
1.1.3 CRISPR/Cas9 技術(shù)的應(yīng)用
1.2 偽狂犬病毒及其重組研究
1.2.1 PRV的國內(nèi)流行現(xiàn)狀
1.2.2 PRV基因組特征
1.2.3 PRV疫苗及重組研究
1.3 牛皰疹病毒I型及其重組研究
1.3.1 BHV的國內(nèi)流行現(xiàn)狀
1.3.2 BHV基因組特征
1.3.3 BHV疫苗及重組研究
1.4 研究目的和意義
試驗(yàn)研究
第二章 CRISPR/Cas9 技術(shù)在PRV基因敲除中的應(yīng)用
2.1 材料
2.1.1 毒種、細(xì)胞系和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 菌種和質(zhì)粒
2.1.3 試劑
2.1.4 培養(yǎng)基及緩沖液配制
2.2 方法
2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及病毒擴(kuò)增
2.2.2 病毒基因組DNA提取
2.2.3 重組載體構(gòu)建
2.2.4 sgRNA載體構(gòu)建
2.2.5 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
2.2.6 病毒重組
2.2.7 病毒蝕斑純化
2.2.8 重組病毒純度測(cè)定
2.2.9 重組病毒滴度測(cè)定
2.2.10 重組病毒生長曲線測(cè)定
2.2.11 重組病毒致病性測(cè)定
2.3 結(jié)果
2.3.1 重組載體構(gòu)建
2.3.2 sgRNA載體構(gòu)建
2.3.3 病毒基因組致病性
2.3.4 TK啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.3.5 病毒重組
2.3.6 病毒純化
2.3.7 重組病毒純度檢測(cè)
2.3.8 重組病毒生長特性
2.3.9 重組病毒致病性
2.4 討論
第三章 CRISPR/Cas9 技術(shù)在BHV基因敲除中的應(yīng)用
3.1 材料
3.1.1 毒種、細(xì)胞系和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 菌種和質(zhì)粒
3.1.3 試劑
3.1.4 培養(yǎng)基及緩沖液配制
3.2 方法
3.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及病毒擴(kuò)增
3.2.2 病毒基因組DNA提取
3.2.3 重組載體構(gòu)建
3.2.4 sgRNA載體構(gòu)建
3.2.5 病毒重組
3.2.6 病毒蝕斑純化
3.2.7 重組病毒驗(yàn)證
3.2.8 重組病毒滴度測(cè)定
3.2.9 重組病毒生長曲線測(cè)定
3.2.10 動(dòng)物抗體檢測(cè)
3.3 結(jié)果
3.3.1 重組載體構(gòu)建
3.3.2 sgRNA載體構(gòu)建
3.3.3 病毒重組
3.3.4 病毒純化
3.3.5 重組病毒純度檢測(cè)
3.3.6 重組病毒生長特性
3.3.7 動(dòng)物抗體檢測(cè)
3.4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2012~2017年我國部分地區(qū)規(guī);i場PRV野毒流行病學(xué)調(diào)查[J]. 高許雷,鄭輝,鄒敏,劉爽,劉蕾,范根成,吳發(fā)興. 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]2018年規(guī)模化豬場偽狂犬病野毒感染血清流行病學(xué)調(diào)查[J]. 林文耀,宋慶慶,劉玉梅,王凱,劉國民,黃超. 養(yǎng)豬. 2019(02)
[3]牛皰疹病毒Ⅰ型(BHV-1)免疫逃逸機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 楊志元,聞曉波,冉旭華. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(04)
[4]表達(dá)PEDV中國變異株S基因重組豬偽狂犬病病毒的構(gòu)建和純化[J]. 楊盼盼,吳艷陽,楊東東,高冬生,王川慶,趙軍,李存法. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]我國規(guī)模豬場偽狂犬病流行狀況及場間傳播風(fēng)險(xiǎn)因素[J]. 張淼潔,夏爐明,黃燁禎. 中國動(dòng)物檢疫. 2017(04)
[6]2012-2014年河南省豬偽狂犬病病毒gE基因和TK基因的遺傳變異分析[J]. 李寧,吳志明,閆若潛,趙雪麗,王淑娟,馬震原,周兵強(qiáng),劉毅,張珂. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(10)
[7]牛群爆發(fā)口腔黏膜潰瘍類疾病的實(shí)驗(yàn)室診斷[J]. 邢思毅,倪宏波,周玉龍,常春龍,常敬偉,李田田,王士霞. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]豬偽狂犬病病毒載體重組疫苗研究進(jìn)展[J]. 王林青,鄭蘭蘭,李坤,陳紅英,李文增,李坤陶,崔保安. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(02)
[9]《國家中長期動(dòng)物疫病防治規(guī)劃(2012~2020年)》(1)[J]. 特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)植物. 2014(02)
[10]表達(dá)O型口蹄疫病毒VP1基因的重組病毒BHV-1的構(gòu)建與鑒定[J]. 任憲剛,薛飛,朱遠(yuǎn)茂,童光志,王延輝,馮軍科,祖立闖,李嬌,史鴻飛,高欲燃. 微生物學(xué)報(bào). 2009(05)
博士論文
[1]河南省免疫豬場偽狂犬病毒分離株生物學(xué)特性研究及gE、TK基因雙缺失毒株的構(gòu)建[D]. 吳鳳筍.吉林大學(xué) 2018
[2]CRISPR/Cas9技術(shù)在偽狂犬病毒研究中的應(yīng)用[D]. 湯艷東.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[3]江蘇省牛常見呼吸道病毒病流行病學(xué)調(diào)查及表達(dá)BVDV-2 E2基因重組BHV-1疫苗的免疫效果評(píng)價(jià)[D]. 張信軍.揚(yáng)州大學(xué) 2018
[4]偽狂犬病毒IE180和EP0基因的表達(dá)調(diào)控[D]. 郭洪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[5]豬瘟偽狂犬病重組病毒活疫苗的研究[D]. 徐志文.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]豬偽狂犬病病毒HeN1株全基因組測(cè)序與病毒遺傳變異分析[D]. 葉超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]牛傳染性鼻氣管炎TK/gE基因缺失重組病毒的研究[D]. 定明.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3682873
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
第一章 CRISPR/Cas9 技術(shù)與皰疹病毒基因敲除的研究進(jìn)展
1.1 CRISPR概述
1.1.1 CRISPR/Cas9 研究歷史
1.1.2 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)核心結(jié)構(gòu)
1.1.3 CRISPR/Cas9 技術(shù)的應(yīng)用
1.2 偽狂犬病毒及其重組研究
1.2.1 PRV的國內(nèi)流行現(xiàn)狀
1.2.2 PRV基因組特征
1.2.3 PRV疫苗及重組研究
1.3 牛皰疹病毒I型及其重組研究
1.3.1 BHV的國內(nèi)流行現(xiàn)狀
1.3.2 BHV基因組特征
1.3.3 BHV疫苗及重組研究
1.4 研究目的和意義
試驗(yàn)研究
第二章 CRISPR/Cas9 技術(shù)在PRV基因敲除中的應(yīng)用
2.1 材料
2.1.1 毒種、細(xì)胞系和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 菌種和質(zhì)粒
2.1.3 試劑
2.1.4 培養(yǎng)基及緩沖液配制
2.2 方法
2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及病毒擴(kuò)增
2.2.2 病毒基因組DNA提取
2.2.3 重組載體構(gòu)建
2.2.4 sgRNA載體構(gòu)建
2.2.5 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
2.2.6 病毒重組
2.2.7 病毒蝕斑純化
2.2.8 重組病毒純度測(cè)定
2.2.9 重組病毒滴度測(cè)定
2.2.10 重組病毒生長曲線測(cè)定
2.2.11 重組病毒致病性測(cè)定
2.3 結(jié)果
2.3.1 重組載體構(gòu)建
2.3.2 sgRNA載體構(gòu)建
2.3.3 病毒基因組致病性
2.3.4 TK啟動(dòng)子活性驗(yàn)證
2.3.5 病毒重組
2.3.6 病毒純化
2.3.7 重組病毒純度檢測(cè)
2.3.8 重組病毒生長特性
2.3.9 重組病毒致病性
2.4 討論
第三章 CRISPR/Cas9 技術(shù)在BHV基因敲除中的應(yīng)用
3.1 材料
3.1.1 毒種、細(xì)胞系和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 菌種和質(zhì)粒
3.1.3 試劑
3.1.4 培養(yǎng)基及緩沖液配制
3.2 方法
3.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及病毒擴(kuò)增
3.2.2 病毒基因組DNA提取
3.2.3 重組載體構(gòu)建
3.2.4 sgRNA載體構(gòu)建
3.2.5 病毒重組
3.2.6 病毒蝕斑純化
3.2.7 重組病毒驗(yàn)證
3.2.8 重組病毒滴度測(cè)定
3.2.9 重組病毒生長曲線測(cè)定
3.2.10 動(dòng)物抗體檢測(cè)
3.3 結(jié)果
3.3.1 重組載體構(gòu)建
3.3.2 sgRNA載體構(gòu)建
3.3.3 病毒重組
3.3.4 病毒純化
3.3.5 重組病毒純度檢測(cè)
3.3.6 重組病毒生長特性
3.3.7 動(dòng)物抗體檢測(cè)
3.4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2012~2017年我國部分地區(qū)規(guī);i場PRV野毒流行病學(xué)調(diào)查[J]. 高許雷,鄭輝,鄒敏,劉爽,劉蕾,范根成,吳發(fā)興. 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2020(01)
[2]2018年規(guī)模化豬場偽狂犬病野毒感染血清流行病學(xué)調(diào)查[J]. 林文耀,宋慶慶,劉玉梅,王凱,劉國民,黃超. 養(yǎng)豬. 2019(02)
[3]牛皰疹病毒Ⅰ型(BHV-1)免疫逃逸機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 楊志元,聞曉波,冉旭華. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(04)
[4]表達(dá)PEDV中國變異株S基因重組豬偽狂犬病病毒的構(gòu)建和純化[J]. 楊盼盼,吳艷陽,楊東東,高冬生,王川慶,趙軍,李存法. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[5]我國規(guī)模豬場偽狂犬病流行狀況及場間傳播風(fēng)險(xiǎn)因素[J]. 張淼潔,夏爐明,黃燁禎. 中國動(dòng)物檢疫. 2017(04)
[6]2012-2014年河南省豬偽狂犬病病毒gE基因和TK基因的遺傳變異分析[J]. 李寧,吳志明,閆若潛,趙雪麗,王淑娟,馬震原,周兵強(qiáng),劉毅,張珂. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(10)
[7]牛群爆發(fā)口腔黏膜潰瘍類疾病的實(shí)驗(yàn)室診斷[J]. 邢思毅,倪宏波,周玉龍,常春龍,常敬偉,李田田,王士霞. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]豬偽狂犬病病毒載體重組疫苗研究進(jìn)展[J]. 王林青,鄭蘭蘭,李坤,陳紅英,李文增,李坤陶,崔保安. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(02)
[9]《國家中長期動(dòng)物疫病防治規(guī)劃(2012~2020年)》(1)[J]. 特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)植物. 2014(02)
[10]表達(dá)O型口蹄疫病毒VP1基因的重組病毒BHV-1的構(gòu)建與鑒定[J]. 任憲剛,薛飛,朱遠(yuǎn)茂,童光志,王延輝,馮軍科,祖立闖,李嬌,史鴻飛,高欲燃. 微生物學(xué)報(bào). 2009(05)
博士論文
[1]河南省免疫豬場偽狂犬病毒分離株生物學(xué)特性研究及gE、TK基因雙缺失毒株的構(gòu)建[D]. 吳鳳筍.吉林大學(xué) 2018
[2]CRISPR/Cas9技術(shù)在偽狂犬病毒研究中的應(yīng)用[D]. 湯艷東.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[3]江蘇省牛常見呼吸道病毒病流行病學(xué)調(diào)查及表達(dá)BVDV-2 E2基因重組BHV-1疫苗的免疫效果評(píng)價(jià)[D]. 張信軍.揚(yáng)州大學(xué) 2018
[4]偽狂犬病毒IE180和EP0基因的表達(dá)調(diào)控[D]. 郭洪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[5]豬瘟偽狂犬病重組病毒活疫苗的研究[D]. 徐志文.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]豬偽狂犬病病毒HeN1株全基因組測(cè)序與病毒遺傳變異分析[D]. 葉超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]牛傳染性鼻氣管炎TK/gE基因缺失重組病毒的研究[D]. 定明.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3682873
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