試驗(yàn)旨在研究過氧化物酶體增殖物激活受體γ輔助激活因子1α（PPARGC1A）在金華豬和大白豬中的遺傳特征和表達(dá)情況,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白質(zhì)水平的表達(dá)模式。以金華豬和大白豬為試驗(yàn)動(dòng)物,分別提取背脂組織的總RNA,根據(jù)GenBank中公布的豬PPARGC1A基因序列（登錄號(hào):NM₂13963.2）設(shè)計(jì)編碼區(qū)和實(shí)時(shí)定量PCR引物,以豬GAPDH基因和β-actin蛋白作為內(nèi)參,應(yīng)用多種生物信息學(xué)方法對(duì)PPARGC1A基因編碼蛋白進(jìn)行功能分析,并通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR及Western blotting檢測(cè)其在金華豬背脂中的表達(dá)水平。結(jié)果表明,金華豬PPARGC1A基因CDS區(qū)全長(zhǎng)2 361 bp,編碼786個(gè)氨基酸,該蛋白分子大小90 336.01 u,其中絲氨酸（ser）所占比例最高（13.7%）,色氨酸（Trp）所占比例最低（0.8%）。同源性比對(duì)結(jié)果顯示,金華豬PPARGC1A基因與山羊、牛和綿羊的同源性較高,分別為95.0%、94.9%和94.9%,在物種進(jìn)化中具有較強(qiáng)的保守性;金華豬PPARGC1A蛋白不穩(wěn)定指數(shù)為74.88,屬于不穩(wěn)定親... 

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料及方法
    1.1 樣本采集
    1.2 主要試劑
    1.3 金華豬PPARGC1A基因克隆
    1.4 金華豬PPARGC1A基因生物信息學(xué)分析
    1.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)
    1.6 Western blotting分析
    1.7 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié) 果
    2.1 金華豬PPARGC1A基因的克隆
    2.2 金華豬PPARGC1A基因序列分析
    2.3 金華豬PPARGC1A基因同源性比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
    2.4 金華豬PPARGC1A生物信息學(xué)分析
        2.4.1 金華豬PPARGC1A蛋白理化性質(zhì)分析
        2.4.2 金華豬PPARGC1A蛋白親/疏水性分析
        2.4.3 金華豬PPARGC1A蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
        2.4.4 金華豬PPARGC1A蛋白卷曲螺旋預(yù)測(cè)與分析
        2.4.5 金華豬PPARGC1A蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.4.6 金華豬PPARGC1A蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    2.5 豬PPARGC1A基因組織表達(dá)分析
    2.6 Western blotting分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]秦川牛PPARGC1A基因功能驗(yàn)證及遺傳變異研究[D]. 李密杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013

碩士論文
[1]蒙古馬運(yùn)動(dòng)候選基因PPARGC1A多態(tài)性和表達(dá)量研究[D]. 烏日古木拉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



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