為解析藏羊高原低氧適應的分子機制，本研究以分布在不同海拔高度的不同綿羊群體為研究對象，選擇與氧、能量代謝相關(guān)的COX17、 EPOR、 VEGF-A基因為候選基因，利用DNA混合池、直接測序法和高分辨率溶解曲線對COX17、EPOR、VEGF-A進行基因分型，分析其在不同綿羊群體中基因多態(tài)性，并進行COX17、EPOR、VEGF-A基因多態(tài)性與藏羊不同群體高海拔低氧適應的關(guān)聯(lián)性分析，以期為藏羊遺傳資源的保護利用與新品種選育提供科學依據(jù)。1.COX17基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性研究在不同海拔高度的綿羊群體中COX17基因內(nèi)含子區(qū)發(fā)現(xiàn)2個SNP位點，SNP1（g.402T/C），SNP2（g.408T/C），其基因型和等位基因頻率在低海拔和中海拔與高海拔綿羊群體間均差異顯著（P<0.05），在高海拔與中海拔綿羊群體間差異均不顯著（P>0.05）。SNP1（g.402T/C）、SNP2（g.408T/C）在中海拔與高海拔綿羊群體中的優(yōu)勢基因型均為TT，在低海拔綿羊群體中CC為優(yōu)勢基因型，三個綿羊群體中SNP1、SNP2均處于緊密連鎖不平衡狀態(tài)（D’>0.75，... 

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Summary
縮略詞對照表
目錄
第一章 文獻綜述
    1.藏羊遺傳資源的現(xiàn)狀
    2.低氧適應性的研究進展
        2.1 藏羊低氧適應性的研究進展
        2.2 COX17 基因的研究進展
        2.3 EPOR 基因的研究進展
        2.4 VEGF-A 基因的研究進展
    3. SNP 的簡介
        3.1 SNP 的定義和特點
        3.2 SNP 的檢測方法
    4.高分辨率溶解曲線
        4.1 HRM 的原理
        4.2 HRM 的工作流程
    5.本研究的目的與意義
第二章 材料與方法
    1.材料
        1.1 COX17、EPOR 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性研究試驗樣本
        1.2 VEGF-A 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性研究試驗樣本
        1.3 試劑
        1.4 儀器設備
    2.試驗方法
        2.1 基因組 DNA 的提取和稀釋
        2.2 DNA 混合池構(gòu)建
        2.3 引物設計
        2.4 PCR 擴增
        2.5 DNA 測序
        2.6 基于 HRM 小片段法 COX17、EPOR 基因分型
        2.7 統(tǒng)計分析
        2.8 生物信息學分析
第三章 結(jié)果與分析
    1.COX17 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性研究
        1.1 COX17 基因混合池測序
        1.2 基于 HRM 小片段法 COX17 基因分型
        1.3 COX17 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性分析
        1.4. COX17 基因的生物信息學分析
    2.EPOR 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性分析
        2.1 EPOR 基因混合池測序
        2.2 基于 HRM 小片段法 EPOR 基因分型
        2.3 EPOR 基因的多態(tài)性、連鎖不平衡和單倍型分析結(jié)果
        2.4 EPOR 基因生物信息學分析
    3.VEGF-A 基因多態(tài)性與藏羊高海拔低氧適應性的關(guān)聯(lián)性分析
        3.1 VEGF-A 基因混合池測序
        3.2 VEGF-A 基因的多態(tài)性、連鎖不平衡和單倍型分析
        3.3 VEGF-A 基因的生物信息學分析
第四章 討論
    1. COX17 基因試驗討論
    2. EPOR 基因試驗討論
    3. VEGF-A 試驗討論
第五章 全文結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡介
導師簡介


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]高住高練低訓對大鼠心肌線粒體呼吸鏈酶復合物活性的影響[D]. 吳剛.西北師范大學 2012



本文編號：3664062