中國(guó)地鼠口腔鱗癌相關(guān)circRNA的篩選及hsa c irc 0 127523功能機(jī)制的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2022-07-08 15:24
目的:建立中國(guó)地鼠頰囊口腔鱗癌動(dòng)物模型,通過二代高通量測(cè)序技術(shù)建立circRNA差異表達(dá)譜,并對(duì)篩選獲得的差異極顯著circRNAs進(jìn)行表達(dá)水平的驗(yàn)證,結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出在口腔癌中起關(guān)鍵作用的hsacirc012752,并在人口腔鱗癌細(xì)胞系中研究其功能作用。方法:通過二甲基苯丙蒽(9,10-Dimethy1-1,2-Benzanthracence,DMBA)涂抹法成功建立中國(guó)地鼠口腔鱗癌動(dòng)物模型,HE染色觀察病理結(jié)構(gòu)和透射電鏡觀察超微結(jié)構(gòu)對(duì)模型進(jìn)行評(píng)價(jià);對(duì)高通量測(cè)序結(jié)果的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,篩選差異表達(dá)的circRNA并在組織樣本中進(jìn)行qRT-PCR表達(dá)量驗(yàn)證;通過miRanda(v3.3a)軟件預(yù)測(cè)circRNA-miRNA-mRNA靶向關(guān)系并進(jìn)行了qRT-PCR表達(dá)水平測(cè)定;結(jié)合UCSC、circBase和circBank數(shù)據(jù)庫(kù)篩選到人口腔癌中差異表達(dá)的hsacirc0127523,在細(xì)胞水平通過CCK-8實(shí)驗(yàn)和Transwell小室實(shí)驗(yàn)檢測(cè)hsacirc0
【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對(duì)照表
前言
第一部分 中國(guó)地鼠口腔鱗癌動(dòng)物模型建立
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 中國(guó)地鼠口腔鱗癌模型肉眼觀察
2.2 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織光鏡觀察
2.3 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織電鏡超微結(jié)構(gòu)觀察
3 討論
4 結(jié)論
第二部分 中國(guó)地鼠口腔頰囊組織中circRNA的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析
1 材料與方法
1.1 動(dòng)物組織
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 頰囊組織中RNA質(zhì)檢
2.2 頰囊組織樣本間相關(guān)性分析
2.3 頰囊組織樣本主成分分析(PCA)
2.4 差異表達(dá)circRNAs的統(tǒng)計(jì)
2.5 差異表達(dá)circRNAs聚類圖和火山圖分析
2.6 差異circRNAs來源的宿主基因GO功能分析
2.7 差異circRNAs來源的宿主基因KEGG通路分析
2.8 circRNA與miRNA相互作用預(yù)測(cè)及構(gòu)建互作網(wǎng)狀圖
2.9 差異circRNA的表達(dá)量和環(huán)狀結(jié)構(gòu)驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
第三部分 hsa_circ_0127523的驗(yàn)證及其對(duì)口腔鱗癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 hsa_circ_0127523的分子結(jié)構(gòu)
2.2 檢測(cè)si-hsa_circ_0127523在口腔癌細(xì)胞中的干擾效率
2.3 沉默hsa_circ_0127523能夠抑制口腔鱗癌細(xì)胞的增殖
2.4 降低hsa_circ_0127523表達(dá)抑制口腔鱗癌細(xì)胞遷移及侵襲能力
2.5 hsa_circ_0127523的靶miRNAs預(yù)測(cè)及表達(dá)量驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水牛PPARG來源環(huán)狀RNA的鑒定及表達(dá)譜分析[J]. 馮雪,洪慧穎,孫曉菲,亐開興,黃必志,魏雪鋒,馬云,黃潔萍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(12)
[2]中國(guó)倉(cāng)鼠口腔鱗癌miR-504的表達(dá)特征分析[J]. 衛(wèi)佳寧,續(xù)國(guó)強(qiáng),高繼萍,王曉堂,肖蘭飛,宋國(guó)華. 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與比較醫(yī)學(xué). 2019(05)
[3]環(huán)狀RNA hsa_circ_0002203對(duì)口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和凋亡能力的影響[J]. 蘇文,王宇帆,王鋒,楊輝俊,楊宏宇. 華西口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2019(05)
[4]7,12-二甲基苯并[a]蒽誘發(fā)敘利亞地鼠頰鱗狀細(xì)胞癌模型中Th1/Th2、Th17/Treg平衡變化研究[J]. 田原野,李洪遠(yuǎn),李君萍,唐瞻貴. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2018(12)
[5]二甲基苯并蒽誘導(dǎo)外陰鱗狀上皮內(nèi)病變大鼠模型的建立[J]. 范藝巾,唐華均,劉瑤,李成志. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(11)
[6]環(huán)狀非編碼RNA在口腔鱗癌中的研究進(jìn)展[J]. 衛(wèi)佳寧,續(xù)國(guó)強(qiáng),高繼萍,宋國(guó)華. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(09)
[7]LPS誘導(dǎo)的小鼠腹腔巨噬細(xì)胞炎癥反應(yīng)中環(huán)狀RNA表達(dá)譜變化分析[J]. 羅清,姚芳苡,鄧楨,蘇日古,廖嵐,黃自坤. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2017 (06)
[8]下調(diào)miR-21表達(dá)對(duì)口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞增殖的影響[J]. 賀娟,劉亮,嚴(yán)翔,辛海濤. 口腔頜面外科雜志. 2017(01)
[9]環(huán)狀RNA:非編碼RNA研究新方向[J]. 戰(zhàn)昊,朱凱,胡志強(qiáng),王鵬程,代智,黃曉武,周儉. 中國(guó)臨床醫(yī)學(xué). 2016(05)
[10]中國(guó)地鼠口腔頰囊黏膜癌模型的建立及癌變的動(dòng)態(tài)觀察[J]. 皇甫冰,龐文彪,張銳虎,郭民,高繼萍,宋國(guó)華. 癌變·畸變·突變. 2016(01)
博士論文
[1]CircEZH2靶向miR-22抑制TGEV誘導(dǎo)的線粒體損傷作用與機(jī)制研究[D]. 馬雪連.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]血漿外泌體miRNA作為早期肺腺癌診斷標(biāo)記物研究[D]. 溫佳新.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2019
[3]miR-29b沉默Ⅰ型膠原基因抑制青光眼手術(shù)后濾過道瘢痕形成的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 李寧.中南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]lncRNA DARS-AS1與PCBP1結(jié)合正反饋調(diào)控HIF通路促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移的研究以及ALYREF在乳腺癌中的細(xì)胞功能研究[D]. 周祥明.廣東藥科大學(xué) 2019
本文編號(hào):3657272
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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常用縮寫詞中英文對(duì)照表
前言
第一部分 中國(guó)地鼠口腔鱗癌動(dòng)物模型建立
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果
2.1 中國(guó)地鼠口腔鱗癌模型肉眼觀察
2.2 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織光鏡觀察
2.3 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織電鏡超微結(jié)構(gòu)觀察
3 討論
4 結(jié)論
第二部分 中國(guó)地鼠口腔頰囊組織中circRNA的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析
1 材料與方法
1.1 動(dòng)物組織
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 頰囊組織中RNA質(zhì)檢
2.2 頰囊組織樣本間相關(guān)性分析
2.3 頰囊組織樣本主成分分析(PCA)
2.4 差異表達(dá)circRNAs的統(tǒng)計(jì)
2.5 差異表達(dá)circRNAs聚類圖和火山圖分析
2.6 差異circRNAs來源的宿主基因GO功能分析
2.7 差異circRNAs來源的宿主基因KEGG通路分析
2.8 circRNA與miRNA相互作用預(yù)測(cè)及構(gòu)建互作網(wǎng)狀圖
2.9 差異circRNA的表達(dá)量和環(huán)狀結(jié)構(gòu)驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
第三部分 hsa_circ_0127523的驗(yàn)證及其對(duì)口腔鱗癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果
2.1 hsa_circ_0127523的分子結(jié)構(gòu)
2.2 檢測(cè)si-hsa_circ_0127523在口腔癌細(xì)胞中的干擾效率
2.3 沉默hsa_circ_0127523能夠抑制口腔鱗癌細(xì)胞的增殖
2.4 降低hsa_circ_0127523表達(dá)抑制口腔鱗癌細(xì)胞遷移及侵襲能力
2.5 hsa_circ_0127523的靶miRNAs預(yù)測(cè)及表達(dá)量驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水牛PPARG來源環(huán)狀RNA的鑒定及表達(dá)譜分析[J]. 馮雪,洪慧穎,孫曉菲,亐開興,黃必志,魏雪鋒,馬云,黃潔萍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(12)
[2]中國(guó)倉(cāng)鼠口腔鱗癌miR-504的表達(dá)特征分析[J]. 衛(wèi)佳寧,續(xù)國(guó)強(qiáng),高繼萍,王曉堂,肖蘭飛,宋國(guó)華. 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與比較醫(yī)學(xué). 2019(05)
[3]環(huán)狀RNA hsa_circ_0002203對(duì)口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和凋亡能力的影響[J]. 蘇文,王宇帆,王鋒,楊輝俊,楊宏宇. 華西口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2019(05)
[4]7,12-二甲基苯并[a]蒽誘發(fā)敘利亞地鼠頰鱗狀細(xì)胞癌模型中Th1/Th2、Th17/Treg平衡變化研究[J]. 田原野,李洪遠(yuǎn),李君萍,唐瞻貴. 口腔醫(yī)學(xué)研究. 2018(12)
[5]二甲基苯并蒽誘導(dǎo)外陰鱗狀上皮內(nèi)病變大鼠模型的建立[J]. 范藝巾,唐華均,劉瑤,李成志. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(11)
[6]環(huán)狀非編碼RNA在口腔鱗癌中的研究進(jìn)展[J]. 衛(wèi)佳寧,續(xù)國(guó)強(qiáng),高繼萍,宋國(guó)華. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(09)
[7]LPS誘導(dǎo)的小鼠腹腔巨噬細(xì)胞炎癥反應(yīng)中環(huán)狀RNA表達(dá)譜變化分析[J]. 羅清,姚芳苡,鄧楨,蘇日古,廖嵐,黃自坤. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2017 (06)
[8]下調(diào)miR-21表達(dá)對(duì)口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞增殖的影響[J]. 賀娟,劉亮,嚴(yán)翔,辛海濤. 口腔頜面外科雜志. 2017(01)
[9]環(huán)狀RNA:非編碼RNA研究新方向[J]. 戰(zhàn)昊,朱凱,胡志強(qiáng),王鵬程,代智,黃曉武,周儉. 中國(guó)臨床醫(yī)學(xué). 2016(05)
[10]中國(guó)地鼠口腔頰囊黏膜癌模型的建立及癌變的動(dòng)態(tài)觀察[J]. 皇甫冰,龐文彪,張銳虎,郭民,高繼萍,宋國(guó)華. 癌變·畸變·突變. 2016(01)
博士論文
[1]CircEZH2靶向miR-22抑制TGEV誘導(dǎo)的線粒體損傷作用與機(jī)制研究[D]. 馬雪連.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]血漿外泌體miRNA作為早期肺腺癌診斷標(biāo)記物研究[D]. 溫佳新.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2019
[3]miR-29b沉默Ⅰ型膠原基因抑制青光眼手術(shù)后濾過道瘢痕形成的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 李寧.中南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]lncRNA DARS-AS1與PCBP1結(jié)合正反饋調(diào)控HIF通路促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移的研究以及ALYREF在乳腺癌中的細(xì)胞功能研究[D]. 周祥明.廣東藥科大學(xué) 2019
本文編號(hào):3657272
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