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中國(guó)地鼠口腔鱗癌相關(guān)circRNA的篩選及hsa c irc 0 127523功能機(jī)制的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2022-07-08 15:24
  目的:建立中國(guó)地鼠頰囊口腔鱗癌動(dòng)物模型,通過二代高通量測(cè)序技術(shù)建立circRNA差異表達(dá)譜,并對(duì)篩選獲得的差異極顯著circRNAs進(jìn)行表達(dá)水平的驗(yàn)證,結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出在口腔癌中起關(guān)鍵作用的hsacirc012752,并在人口腔鱗癌細(xì)胞系中研究其功能作用。方法:通過二甲基苯丙蒽(9,10-Dimethy1-1,2-Benzanthracence,DMBA)涂抹法成功建立中國(guó)地鼠口腔鱗癌動(dòng)物模型,HE染色觀察病理結(jié)構(gòu)和透射電鏡觀察超微結(jié)構(gòu)對(duì)模型進(jìn)行評(píng)價(jià);對(duì)高通量測(cè)序結(jié)果的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,篩選差異表達(dá)的circRNA并在組織樣本中進(jìn)行qRT-PCR表達(dá)量驗(yàn)證;通過miRanda(v3.3a)軟件預(yù)測(cè)circRNA-miRNA-mRNA靶向關(guān)系并進(jìn)行了qRT-PCR表達(dá)水平測(cè)定;結(jié)合UCSC、circBase和circBank數(shù)據(jù)庫(kù)篩選到人口腔癌中差異表達(dá)的hsacirc0127523,在細(xì)胞水平通過CCK-8實(shí)驗(yàn)和Transwell小室實(shí)驗(yàn)檢測(cè)hsacirc0

【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對(duì)照表
前言
第一部分 中國(guó)地鼠口腔鱗癌動(dòng)物模型建立
    1 材料與方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        1.2 儀器與試劑
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2 結(jié)果
        2.1 中國(guó)地鼠口腔鱗癌模型肉眼觀察
        2.2 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織光鏡觀察
        2.3 中國(guó)地鼠口腔鱗癌頰囊組織電鏡超微結(jié)構(gòu)觀察
    3 討論
    4 結(jié)論
第二部分 中國(guó)地鼠口腔頰囊組織中circRNA的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析
    1 材料與方法
        1.1 動(dòng)物組織
        1.2 儀器與試劑
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
        1.4 統(tǒng)計(jì)分析
    2 結(jié)果
        2.1 頰囊組織中RNA質(zhì)檢
        2.2 頰囊組織樣本間相關(guān)性分析
        2.3 頰囊組織樣本主成分分析(PCA)
        2.4 差異表達(dá)circRNAs的統(tǒng)計(jì)
        2.5 差異表達(dá)circRNAs聚類圖和火山圖分析
        2.6 差異circRNAs來源的宿主基因GO功能分析
        2.7 差異circRNAs來源的宿主基因KEGG通路分析
        2.8 circRNA與miRNA相互作用預(yù)測(cè)及構(gòu)建互作網(wǎng)狀圖
        2.9 差異circRNA的表達(dá)量和環(huán)狀結(jié)構(gòu)驗(yàn)證
    3 討論
    4 結(jié)論
第三部分 hsa_circ_0127523的驗(yàn)證及其對(duì)口腔鱗癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響
    1 材料與方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
        1.2 儀器與試劑
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
        1.4 統(tǒng)計(jì)分析
    2 結(jié)果
        2.1 hsa_circ_0127523的分子結(jié)構(gòu)
        2.2 檢測(cè)si-hsa_circ_0127523在口腔癌細(xì)胞中的干擾效率
        2.3 沉默hsa_circ_0127523能夠抑制口腔鱗癌細(xì)胞的增殖
        2.4 降低hsa_circ_0127523表達(dá)抑制口腔鱗癌細(xì)胞遷移及侵襲能力
        2.5 hsa_circ_0127523的靶miRNAs預(yù)測(cè)及表達(dá)量驗(yàn)證
    3 討論
    4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]CircEZH2靶向miR-22抑制TGEV誘導(dǎo)的線粒體損傷作用與機(jī)制研究[D]. 馬雪連.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]血漿外泌體miRNA作為早期肺腺癌診斷標(biāo)記物研究[D]. 溫佳新.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2019
[3]miR-29b沉默Ⅰ型膠原基因抑制青光眼手術(shù)后濾過道瘢痕形成的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 李寧.中南大學(xué) 2012

碩士論文
[1]lncRNA DARS-AS1與PCBP1結(jié)合正反饋調(diào)控HIF通路促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移的研究以及ALYREF在乳腺癌中的細(xì)胞功能研究[D]. 周祥明.廣東藥科大學(xué) 2019



本文編號(hào):3657272

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