10株廣西豬圓環(huán)病毒3型(PCV3)全基因組序列的遺傳變異分析
發(fā)布時間:2022-07-08 15:05
為了解廣西豬群豬圓環(huán)病毒3型(PCV3)的遺傳變異情況,以PCV3陽性DNA為模板,利用PCR的方法分2段擴增PCV3全基因序列并進行拼接,獲得10株P(guān)CV3全基因組序列,全長均為2 000 bp。10株廣西PCV3全基因組序列之間的核苷酸同源性為98.6%~99.8%。與國內(nèi)其他毒株的同源性為97.9%~99.8%;與國外其他毒株的同源性為98.8%~99.7%。10株廣西PCV3 Cap基因的大小均為645 bp,編碼214 aa。PCV3 Cap基因比較保守,10株廣西PCV3 Cap基因與參考株相比,僅存在散在的突變位點;赑CV3全基因和Cap基因構(gòu)建的遺傳進化樹顯示,兩者結(jié)果基本相同,10株廣西PCV3處于3a和3b兩個亞群。本試驗表明,廣西地區(qū)豬群中流行的PCV3至少存在2個亞群,不同亞群PCV3毒株的致病性差異還有待進一步的研究。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毒株來源
1.2 主要試劑
1.3 引物的設(shè)計與合成
1.4 PCV3陽性樣品DNA的提取
1.5 PCV3 全基因組序列的擴增及測序
1.6 序列分析和遺傳進化樹構(gòu)建分析
2 結(jié)果
2.1 PCV3全基因組的PCR擴增和序列測定
2.2 PCV3全基因組序列測序分析
2.3 PCV3全基因組遺傳進化分析
2.4 PCV3 Cap基因序列分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]華南地區(qū)豬圓環(huán)病毒3型感染的分子流行病學(xué)調(diào)查與分析[J]. 劉相聰,申翰欽,張鵬飛,黎嘉豪,劉燕玲,張樂宜,宋長緒. 畜牧與獸醫(yī). 2018(06)
本文編號:3657246
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毒株來源
1.2 主要試劑
1.3 引物的設(shè)計與合成
1.4 PCV3陽性樣品DNA的提取
1.5 PCV3 全基因組序列的擴增及測序
1.6 序列分析和遺傳進化樹構(gòu)建分析
2 結(jié)果
2.1 PCV3全基因組的PCR擴增和序列測定
2.2 PCV3全基因組序列測序分析
2.3 PCV3全基因組遺傳進化分析
2.4 PCV3 Cap基因序列分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]華南地區(qū)豬圓環(huán)病毒3型感染的分子流行病學(xué)調(diào)查與分析[J]. 劉相聰,申翰欽,張鵬飛,黎嘉豪,劉燕玲,張樂宜,宋長緒. 畜牧與獸醫(yī). 2018(06)
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