為了解廣西豬群豬圓環(huán)病毒3型（PCV3）的遺傳變異情況,以PCV3陽(yáng)性DNA為模板,利用PCR的方法分2段擴(kuò)增PCV3全基因序列并進(jìn)行拼接,獲得10株P(guān)CV3全基因組序列,全長(zhǎng)均為2 000 bp。10株廣西PCV3全基因組序列之間的核苷酸同源性為98.6%～99.8%。與國(guó)內(nèi)其他毒株的同源性為97.9%～99.8%;與國(guó)外其他毒株的同源性為98.8%～99.7%。10株廣西PCV3 Cap基因的大小均為645 bp,編碼214 aa。PCV3 Cap基因比較保守,10株廣西PCV3 Cap基因與參考株相比,僅存在散在的突變位點(diǎn)�；赑CV3全基因和Cap基因構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹(shù)顯示,兩者結(jié)果基本相同,10株廣西PCV3處于3a和3b兩個(gè)亞群。本試驗(yàn)表明,廣西地區(qū)豬群中流行的PCV3至少存在2個(gè)亞群,不同亞群PCV3毒株的致病性差異還有待進(jìn)一步的研究。 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 毒株來(lái)源
    1.2 主要試劑
    1.3 引物的設(shè)計(jì)與合成
    1.4 PCV3陽(yáng)性樣品DNA的提取
    1.5 PCV3 全基因組序列的擴(kuò)增及測(cè)序
    1.6 序列分析和遺傳進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建分析
2 結(jié)果
    2.1 PCV3全基因組的PCR擴(kuò)增和序列測(cè)定
    2.2 PCV3全基因組序列測(cè)序分析
    2.3 PCV3全基因組遺傳進(jìn)化分析
    2.4 PCV3 Cap基因序列分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]華南地區(qū)豬圓環(huán)病毒3型感染的分子流行病學(xué)調(diào)查與分析[J]. 劉相聰,申翰欽,張鵬飛,黎嘉豪,劉燕玲,張樂(lè)宜,宋長(zhǎng)緒.  畜牧與獸醫(yī). 2018(06)



本文編號(hào)：3657246