隨著當(dāng)代高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,DNA（deoxyribonucleic acid）條形碼技術(shù)已經(jīng)逐漸被用于肉類產(chǎn)品的溯源系統(tǒng)建立中。有利于保護(hù)生物多樣性,促進(jìn)物種資源的可持續(xù)利用以及為生物來源的新產(chǎn)品的開發(fā)提供知識(shí)和理論基礎(chǔ)。為了保護(hù)湖南當(dāng)?shù)氐奶厣贩N,本研究選用了我省寧鄉(xiāng)縣的優(yōu)質(zhì)品種——寧鄉(xiāng)豬,對(duì)寧鄉(xiāng)豬個(gè)體身份的DNA識(shí)別進(jìn)行了研究,用于豬個(gè)體身份識(shí)別及其產(chǎn)品的溯源。本研究結(jié)果如下:1.引物1（+122）、引物1（+242）、引物2（+42）、引物3（+254）這4個(gè)SNP位點(diǎn)在寧鄉(xiāng)豬和陸川豬兩個(gè)不同品種中的基因型頻率和基因頻率均具有不同程度的差異。其中在引物1（+122）位置,CC、CT、TT在寧鄉(xiāng)豬中分布差異不大,在陸川豬中CC占據(jù)主要地位,CT有極少量分布,沒有TT基因型。在引物1（+242）位置,SNP在寧鄉(xiāng)、陸川這2個(gè)中國(guó)地方特色豬種中,基因頻率也呈現(xiàn)極端分布,C基因的頻率在寧鄉(xiāng)豬中占82.0%,在陸川豬中達(dá)到100%,基因型頻率則由CC基因型占據(jù)絕對(duì)優(yōu)勢(shì)。在引物2（+42）位置,在寧鄉(xiāng)豬中GG占主導(dǎo)地位,AG、AA極少數(shù)分布,在陸川豬中全部表現(xiàn)為GG基因型。在引物3（+2... 

【文章來源】：湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】：56 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Absrtact
英文縮寫
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 動(dòng)物產(chǎn)品可追溯技術(shù)的研究進(jìn)展
        1.1 可追溯技術(shù)的定義
        1.2 可追溯技術(shù)的分類
        1.3 國(guó)外可追溯系統(tǒng)的研究進(jìn)展
        1.4 國(guó)內(nèi)可追溯系統(tǒng)的研究進(jìn)展
    2 SNP標(biāo)記的研究進(jìn)展
        2.1 SNP的定義
        2.2 SNP的檢測(cè)方法
        2.3 SNP的優(yōu)勢(shì)和特點(diǎn)
    3 DNA條形碼的研究進(jìn)展
        3.1 發(fā)展DNA條形碼的原由
        3.2 DNA條形碼的定義、優(yōu)點(diǎn)及原理
        3.3 DNA條形碼的開發(fā)程序
        3.4 DNA條形碼的發(fā)展歷程
        3.5 DNA條形碼的應(yīng)用領(lǐng)域
        3.6 DNA條形碼的展望
    4 研究目的與意義
第二章 寧鄉(xiāng)豬個(gè)體身份識(shí)別
    1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.1 實(shí)驗(yàn)樣品的采集
        1.2 實(shí)驗(yàn)相關(guān)儀器設(shè)備
        1.3 實(shí)驗(yàn)相關(guān)試劑及配制
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 耳樣DNA的提取
        2.2 檢測(cè)DNA濃度以及質(zhì)量
        2.3 引物設(shè)計(jì)
        2.4 PCR擴(kuò)增
        2.5 PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
        2.6 PCR產(chǎn)物的測(cè)序
    3 數(shù)據(jù)分析
        3.1 SNP等位基因頻率計(jì)算
        3.2 雜合度計(jì)算
        3.3 連鎖不平衡分析
    4 結(jié)果與分析
        4.1 分光光度計(jì)檢測(cè)DNA純度
        4.2 DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
        4.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳檢測(cè)
        4.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序峰圖分析
        4.5 SNP的檢測(cè)
        4.6 寧鄉(xiāng)豬和陸川豬4個(gè)SNP位點(diǎn)的比較分析
        4.7 SNP連鎖不平衡分析
        4.8 用于制作條形碼的SNP篩選結(jié)果
        4.9 SNP條形碼及數(shù)字條形碼編制
        4.10 基因型分析
    5 討論及結(jié)論
        5.1 DNA提取及PCR擴(kuò)增
        5.2 測(cè)序峰圖
        5.3 豬個(gè)體身份識(shí)別
        5.4 SNP位點(diǎn)的雜合度篩選以及連鎖不平衡分析
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3640320