為了探索牛病毒性腹瀉病毒（Bovine viral diarrhea-mucosal virus, BVDV）NS2-3基因的生物學(xué)特征,試驗(yàn)以不同生物型（ncp型和cp型）BVDV NS2-3基因序列及其蛋白氨基酸序列為研究對象,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件對不同生物型BVDV的NS2-3基因序列同源性、遺傳進(jìn)化關(guān)系、磷酸化位點(diǎn)、糖基化位點(diǎn)、酰基化位點(diǎn)、信號肽、亞細(xì)胞定位、同源重組及B細(xì)胞線性表位進(jìn)行預(yù)測分析。結(jié)果表明:ncp JL株NS2-3基因核苷酸序列與ncp PI285株同源性較高,cp Singer Arg株NS2-3基因核苷酸序列與cp/ncp NADL株同源性較高;ncp JL株與ncp Nebraska株及ncp PI285株遺傳進(jìn)化關(guān)系較近,cp Singer Arg株與cp/ncp NADL株、cp BVDV-1株遺傳進(jìn)化關(guān)系較近;不同生物型NS2-3蛋白所含磷酸化位點(diǎn)及糖基化位點(diǎn)數(shù)量不同,但均含有信號肽;ncp JL株NS2-3蛋白定位于宿主細(xì)胞核,而cp Singer Arg株NS2-3蛋白定位于宿主細(xì)胞核和宿主細(xì)胞質(zhì)中;ncp JL株和cp Singer Arg株都與... 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(23)北大核心

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料
    1.1 毒株
    1.2 參考株
2 方法
    2.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
    2.2 遺傳進(jìn)化樹的構(gòu)建
    2.3 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
    2.4 糖基化位點(diǎn)、酰基化位點(diǎn)預(yù)測
    2.5 信號肽位點(diǎn)預(yù)測
    2.6 亞細(xì)胞定位分析
    2.7 同源重組分析
    2.8 B細(xì)胞線性表位預(yù)測
3 結(jié)果與分析
    3.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
    3.2 遺傳進(jìn)化樹的構(gòu)建
    3.3 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測
    3.4 糖基化、�；稽c(diǎn)預(yù)測
    3.5 信號肽位點(diǎn)預(yù)測
    3.6 亞細(xì)胞定位分析
    3.7 同源重組分析
    3.8 B細(xì)胞線性表位預(yù)測
4 討論
5 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3627232