不同生物型BVDV的NS2-3基因生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2022-02-15 20:39
為了探索牛病毒性腹瀉病毒(Bovine viral diarrhea-mucosal virus, BVDV)NS2-3基因的生物學(xué)特征,試驗以不同生物型(ncp型和cp型)BVDV NS2-3基因序列及其蛋白氨基酸序列為研究對象,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件對不同生物型BVDV的NS2-3基因序列同源性、遺傳進化關(guān)系、磷酸化位點、糖基化位點、;稽c、信號肽、亞細胞定位、同源重組及B細胞線性表位進行預(yù)測分析。結(jié)果表明:ncp JL株NS2-3基因核苷酸序列與ncp PI285株同源性較高,cp Singer Arg株NS2-3基因核苷酸序列與cp/ncp NADL株同源性較高;ncp JL株與ncp Nebraska株及ncp PI285株遺傳進化關(guān)系較近,cp Singer Arg株與cp/ncp NADL株、cp BVDV-1株遺傳進化關(guān)系較近;不同生物型NS2-3蛋白所含磷酸化位點及糖基化位點數(shù)量不同,但均含有信號肽;ncp JL株NS2-3蛋白定位于宿主細胞核,而cp Singer Arg株NS2-3蛋白定位于宿主細胞核和宿主細胞質(zhì)中;ncp JL株和cp Singer Arg株都與...
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(23)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料
1.1 毒株
1.2 參考株
2 方法
2.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
2.2 遺傳進化樹的構(gòu)建
2.3 磷酸化位點預(yù)測
2.4 糖基化位點、;稽c預(yù)測
2.5 信號肽位點預(yù)測
2.6 亞細胞定位分析
2.7 同源重組分析
2.8 B細胞線性表位預(yù)測
3 結(jié)果與分析
3.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
3.2 遺傳進化樹的構(gòu)建
3.3 磷酸化位點預(yù)測
3.4 糖基化、;稽c預(yù)測
3.5 信號肽位點預(yù)測
3.6 亞細胞定位分析
3.7 同源重組分析
3.8 B細胞線性表位預(yù)測
4 討論
5 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒研究進展[J]. 韓慧,鄭源強,石艷春. 畜禽業(yè). 2019(07)
[2]牛病毒性腹瀉病毒非結(jié)構(gòu)蛋白研究進展[J]. 姚澤慧,刁乃超,李大帥,田甜,董守藝,童婷蓉,藺曉諭,王慧慧,時坤,杜銳. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2019(07)
[3]牛病毒性腹瀉病毒檢測技術(shù)研究進展[J]. 于志超,陳林軍,趙治國,崔強,延涵,王海艷,趙林立,李剛,郭文麗. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2019(01)
[4]牛病毒性腹瀉病毒Nano-PCR檢測方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 李健友,劉澤余,劉占悝,李家偉,張淑琴,王超,郭利. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(05)
[5]牦牛HSPB6基因的生物信息學(xué)和表達分析[J]. 劉東花,衛(wèi)陽飛. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(01)
[6]信號肽及其在蛋白質(zhì)表達中的應(yīng)用[J]. 韋雪芳,王冬梅,劉思,周鵬. 生物技術(shù)通報. 2006(06)
[7]蛋白糖基化與免疫[J]. 章曉聯(lián). 中國免疫學(xué)雜志. 2004(04)
本文編號:3627232
【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(23)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料
1.1 毒株
1.2 參考株
2 方法
2.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
2.2 遺傳進化樹的構(gòu)建
2.3 磷酸化位點預(yù)測
2.4 糖基化位點、;稽c預(yù)測
2.5 信號肽位點預(yù)測
2.6 亞細胞定位分析
2.7 同源重組分析
2.8 B細胞線性表位預(yù)測
3 結(jié)果與分析
3.1 NS2-3基因核苷酸序列同源性分析
3.2 遺傳進化樹的構(gòu)建
3.3 磷酸化位點預(yù)測
3.4 糖基化、;稽c預(yù)測
3.5 信號肽位點預(yù)測
3.6 亞細胞定位分析
3.7 同源重組分析
3.8 B細胞線性表位預(yù)測
4 討論
5 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牛病毒性腹瀉病毒研究進展[J]. 韓慧,鄭源強,石艷春. 畜禽業(yè). 2019(07)
[2]牛病毒性腹瀉病毒非結(jié)構(gòu)蛋白研究進展[J]. 姚澤慧,刁乃超,李大帥,田甜,董守藝,童婷蓉,藺曉諭,王慧慧,時坤,杜銳. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2019(07)
[3]牛病毒性腹瀉病毒檢測技術(shù)研究進展[J]. 于志超,陳林軍,趙治國,崔強,延涵,王海艷,趙林立,李剛,郭文麗. 動物醫(yī)學(xué)進展. 2019(01)
[4]牛病毒性腹瀉病毒Nano-PCR檢測方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 李健友,劉澤余,劉占悝,李家偉,張淑琴,王超,郭利. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(05)
[5]牦牛HSPB6基因的生物信息學(xué)和表達分析[J]. 劉東花,衛(wèi)陽飛. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(01)
[6]信號肽及其在蛋白質(zhì)表達中的應(yīng)用[J]. 韋雪芳,王冬梅,劉思,周鵬. 生物技術(shù)通報. 2006(06)
[7]蛋白糖基化與免疫[J]. 章曉聯(lián). 中國免疫學(xué)雜志. 2004(04)
本文編號:3627232
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3627232.html
最近更新
教材專著