藏豬,不僅是我國(guó)優(yōu)良的地方豬種,更是世界范圍內(nèi)少有的高海拔小型豬種,其自身具有草食、抗病等諸多優(yōu)良特性,這些特性的獲得在很大程度上得益于自身腸道細(xì)菌,為了加深對(duì)藏豬腸道細(xì)菌的了解,發(fā)掘藏豬腸道中獨(dú)特的菌種資源并將其用于仔豬高腹瀉率問(wèn)題的解決,本研究運(yùn)用16SrDNA高通量測(cè)序技術(shù)和分離培養(yǎng)兩種方法綜合研究藏豬盲腸細(xì)菌多樣性,對(duì)于培養(yǎng)獲得的菌株從短鏈脂肪酸產(chǎn)生能力、木聚糖降解能力、纖維素降解能力、酸耐受能力、膽鹽耐受能力這幾方面進(jìn)行篩選,隨后挑選表現(xiàn)優(yōu)異的菌株進(jìn)行仔豬飼喂試驗(yàn),結(jié)果如下:1、采用高通量測(cè)序方法研究藏豬腸道細(xì)菌多樣性。本研究選擇擴(kuò)增16S rDNA的V4-V5區(qū)序列,對(duì)測(cè)序產(chǎn)生的原始reads經(jīng)過(guò)過(guò)濾和均一化處理后每個(gè)樣品均含有30000條reads。在28個(gè)樣品中均以97%的閾值對(duì)clean reads進(jìn)行聚類(lèi),共獲得2153個(gè)OTU,使用greengene數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行物種注釋后表明藏豬盲腸中的細(xì)菌分為16個(gè)門(mén),80個(gè)科,114個(gè)屬。其中擬桿菌門(mén)、厚壁菌門(mén)細(xì)菌在整個(gè)群落中占比為60%-90%,處于主導(dǎo)地位。但在物種相對(duì)豐度方面,藏豬相比于其他豬種,擬桿菌門(mén)、螺旋體門(mén)細(xì)菌較高... 

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

注釋至門(mén)水平OTU統(tǒng)計(jì)

注釋至科水平OTU統(tǒng)計(jì)

注釋至屬水平OTU統(tǒng)計(jì)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]閉鎖繁殖藏豬群體不同世代間胴體和肉質(zhì)性能的比較研究[J]. 陳映,劉彬,李強(qiáng),帥素容,譚婭,張順華,朱礪.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(S1)
[2]Gene expression of vascular endothelial growth factor A and hypoxic adaptation in Tibetan pig[J]. Bo Zhang,Yangzong Qiangba,Peng Shang,Yunfeng Lu,Yuzeng Yang,Zhixiu Wang,Hao Zhang.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2016(04)
[3]藏豬生理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 周琳,王蜀金.  家畜生態(tài)學(xué)報(bào). 2014(07)
[4]日糧營(yíng)養(yǎng)調(diào)控豬肉品質(zhì)的研究進(jìn)展[J]. 王蜀金,李嘉英,陳慧娜,郭春華.  豬業(yè)科學(xué). 2013(10)
[5]藏豬和長(zhǎng)白豬對(duì)口蹄疫疫苗的免疫應(yīng)答特性比較研究[J]. 賀寒冰,尹洛蓉,楊肖,李江凌,白光明,劉瑞,曾凱,呂學(xué)斌,高榮.  四川動(dòng)物. 2011(04)
[6]天然富氧運(yùn)動(dòng)的食草綠色養(yǎng)豬法的提出及意義——迎接養(yǎng)豬業(yè)綠色革命浪潮的到來(lái)[J]. 曹斌云.  北方牧業(yè). 2010(19)
[7]藏豬繁殖性狀多基因效應(yīng)分析[J]. 劉軒,強(qiáng)巴央宗,王強(qiáng),凌遙,辜雪冬,吳克亮,張浩.  遺傳. 2010(05)
[8]小麥提取物對(duì)乳酸桿菌膽鹽耐受力的影響[J]. 倪學(xué)勤,曾東,張洪,田貴平,但言.  食品科學(xué). 2009(21)
[9]藏豬及不同雜交組合肥育與胴體性能研究[J]. 龔建軍,何志平,李正確,呂學(xué)斌,應(yīng)三成,陳曉暉.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2007(05)
[10]Spatial organization of bacterial flora in normal and inflamed intestine: A fluorescence in situ hybridization study in mice[J]. Alexander Swidsinski,Vera Loening-Baucke,Herbert Lochs,Laura P.Hale.  World Journal of Gastroenterology. 2005(08)

博士論文
[1]藏豬腸道中拮抗致病菌微生物的篩選及其抗菌肽研究[D]. 辛海云.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[2]藏豬腸道細(xì)菌群落組成與纖維素分解菌的研究[D]. 楊偉平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015

碩士論文
[1]海拔高度及飼養(yǎng)方式對(duì)藏豬腸道菌群結(jié)構(gòu)及其特征的影響[D]. 李卓君.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]藏豬腸道微生物多樣性的研究[D]. 肖文萍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012



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