綿羊UCP2和UCP3基因的克
發(fā)布時間:2021-12-11 05:57
UCP2和UCP3屬于線粒體內膜蛋白,在線粒體中通過解偶聯作用抑制ATP和ROS的形成,不僅對生物機體具有保護作用,而且可能參與能量代謝。綿羊是重要的經濟動物之一。通過研究UCP2和UCP3基因的結構和遺傳表達特性,有利于深入、全面地了解機體內復雜的代謝機制。目前關于綿羊UCP2和UCP3基因的核酸序列、分子結構、遺傳變異和表達的研究極少。本研究在]DNA、mRNA和蛋白質3個水平上研究綿羊UCP2和UCP3基因的序列結構、遺傳變異以及轉錄和翻譯水平上的表達。采用RT-PCR、RACE和序列測定技術克隆綿羊UCP2和UCP3基因的全長cDNA序列。通過電子克隆獲得兩基因的基因組序列。以UCP1基因為參照,用real-time PCR技術檢測南非肉用美利奴和山西肉用綿羊UCP2和UCP3 mRNA在冬春和夏秋兩個不同時段的13種組織中的差異性表達。用免疫組化技術研究兩個基因的蛋白產物在6種脂肪組織中的表達。應用多種軟件對UCP2和UCP3基因的核苷酸和氨基酸序列進行生物信息學分析。主要結果如下:(1)采用RACE方法獲得綿羊UCP2基因cDNA序列全長序列1641 bp,其中ORF為92...
【文章來源】:山西農業(yè)大學山西省
【文章頁數】:168 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略詞對照表
第一章 文獻綜述
1 生物能量學
1.1 線粒體的氧化磷酸化—ATP合成
1.2 代謝率
1.3 體內能量平衡
1.4 體溫調節(jié)
2 解偶聯蛋白家族基因(UCPs)
2.1 UCPs的類型及其分子特性
2.2 基因定位及其表達產物的分布
2.3 半衰期
2.4 UCP1-UCP3的進化分析
3 UCP2和UCP3分子調節(jié)機制的研究進展
3.1 質子漏和解偶聯作用
3.2 分子調控機制的研究進展
3.3 生物學功能
3.4 影響UCP2和UCP3基因表達的因素
3.5 UCP2和UCP3基因的多態(tài)性研究
4 本研究的目的與意義
參考文獻
第二章 綿羊UCP2和UCP3基因序列的克隆與分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.3 序列分析
2 結果與分析
2.1 綿羊UCP2基因部分cDNA序列的克隆與測序
2.2 綿羊UCP2和UCP3基因RACE擴增結果
2.3 綿羊UCP2和UCP3基因序列
2.4 不同物種間UCP2和UCP3基因的cDNA序列變異
2.5 不同物種UCP2和UCP3氨基酸多樣性
3 討論
3.1 綿羊UCP2和UCP3基因調控區(qū)預測位點、序列的分析
3.2 調控序列對基因表達的影響
3.3 變異位點及其效應分析
3.4 密碼子偏性、同義替換和非同義替換
參考文獻
第三章 UCP2和UCP3蛋白結構、功能預測與分子進化分析
1 材料與方法
1.1 序列的獲取
1.2 分析方法
2 結果與分析
2.1 UCP2和UCP3蛋白質的基本性質
2.2 蛋白信號肽和二硫鍵預測
2.3 糖基化位點
2.4 磷酸化位點
2.5 蛋白質二級結構預測
2.6 蛋白質三級結構
2.7 相似性及分子系統(tǒng)進化樹
3 討論
3.1 蛋白質結構預測與其功能的關系
3.2 不同種群遺傳分化和氨基酸序列相似性分析
參考文獻
第四章 綿羊UCP2和UCP3 MRNA的時空差異性表達研究
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法與操作技術
2 結果與分析
2.1 總RNA的提取
2.2 標準曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴增動力學曲線
2.4 樣品擴增熔解曲線
2.5 UCP1 mRNA的表達量及影響因素
2.6 UCP2 mRNA的表達量及影響因素
2.7 UCP3 mRNA的表達量及影響因素
3 討論
3.1 關于UCP1-UCP3 mRNA的空間性表達
3.2 關于UCP1-UCP3 mRNA的季節(jié)性表達
參考文獻
第五章 綿羊UCP2和UCP3蛋白的免疫組化分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法與操作技術
2 結果與分析
2.1 免疫組化分析
2.2 UCP2的表達量及影響因素
2.3 UCP3的表達量及影響因素
3 討論
參考文獻
全文結論
特色與創(chuàng)新
附錄一 綿羊UCP2和UCP3基因全長CDNA序列和對應氨基酸序列
附錄二 綿羊UCP2和UCP3基因的DNA序列
附錄三 綿羊UCP2和UCP3基因轉錄起始位點和啟動子預測結果
附錄四 綿羊UCP2和UCP3基因轉錄因子結合位點預測結果
附錄五 蛋白質結構預測對照軟件結果
附錄六 蛋白質結構預測對照軟件結果
ABSTRACT
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]糖皮質激素受體的生物學功能及其在骨代謝中作用的研究進展[J]. 郟舜杰,洪盾,陳海嘯. 中國細胞生物學學報. 2012(12)
[2]基于質譜的蛋白質O-糖基化分析[J]. 王勝,鄒霞,張延. 化學進展. 2010(12)
[3]豬UCP5基因克隆表達特性及與屠體性狀的關聯分析[J]. 李紅霞,趙興波,徐寧迎,姜運良,曹夢,劉玉方,方遲,李寧. 生物化學與生物物理進展. 2010(12)
[4]植物CBF1轉錄因子的生物信息學分析[J]. 蔣瑤,陳其兵. 林業(yè)科學. 2010(06)
[5]糖基化改變與腫瘤的基礎研究[J]. 范振符,陳智周,范飛舟. 標記免疫分析與臨床. 2010(02)
[6]轉錄因子Sp1與腫瘤關系研究的新進展[J]. 白雪,鄧紅. 浙江大學學報(醫(yī)學版). 2010(02)
[7]鱖UCP1,2基因結構、序列分析及組織表達[J]. 王琳,梁旭方,李光照,劉秀霞,林群,白俊杰. 水產學報. 2009(06)
[8]光周期和高脂食物對布氏田鼠能量代謝和產熱的影響[J]. 趙志軍,陳競峰,王德華. 動物學報. 2008(04)
[9]PPARδ在脂質代謝中的作用[J]. 王靜,江淼,夏軍輝,李霞,易光輝,阮長耿. 生命的化學. 2008(02)
[10]基因組CpG島甲基化檢測技術研究進展[J]. 張松法,葉楓,陳懷增,謝幸. 國際遺傳學雜志. 2006(03)
本文編號:3534133
【文章來源】:山西農業(yè)大學山西省
【文章頁數】:168 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略詞對照表
第一章 文獻綜述
1 生物能量學
1.1 線粒體的氧化磷酸化—ATP合成
1.2 代謝率
1.3 體內能量平衡
1.4 體溫調節(jié)
2 解偶聯蛋白家族基因(UCPs)
2.1 UCPs的類型及其分子特性
2.2 基因定位及其表達產物的分布
2.3 半衰期
2.4 UCP1-UCP3的進化分析
3 UCP2和UCP3分子調節(jié)機制的研究進展
3.1 質子漏和解偶聯作用
3.2 分子調控機制的研究進展
3.3 生物學功能
3.4 影響UCP2和UCP3基因表達的因素
3.5 UCP2和UCP3基因的多態(tài)性研究
4 本研究的目的與意義
參考文獻
第二章 綿羊UCP2和UCP3基因序列的克隆與分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
1.3 序列分析
2 結果與分析
2.1 綿羊UCP2基因部分cDNA序列的克隆與測序
2.2 綿羊UCP2和UCP3基因RACE擴增結果
2.3 綿羊UCP2和UCP3基因序列
2.4 不同物種間UCP2和UCP3基因的cDNA序列變異
2.5 不同物種UCP2和UCP3氨基酸多樣性
3 討論
3.1 綿羊UCP2和UCP3基因調控區(qū)預測位點、序列的分析
3.2 調控序列對基因表達的影響
3.3 變異位點及其效應分析
3.4 密碼子偏性、同義替換和非同義替換
參考文獻
第三章 UCP2和UCP3蛋白結構、功能預測與分子進化分析
1 材料與方法
1.1 序列的獲取
1.2 分析方法
2 結果與分析
2.1 UCP2和UCP3蛋白質的基本性質
2.2 蛋白信號肽和二硫鍵預測
2.3 糖基化位點
2.4 磷酸化位點
2.5 蛋白質二級結構預測
2.6 蛋白質三級結構
2.7 相似性及分子系統(tǒng)進化樹
3 討論
3.1 蛋白質結構預測與其功能的關系
3.2 不同種群遺傳分化和氨基酸序列相似性分析
參考文獻
第四章 綿羊UCP2和UCP3 MRNA的時空差異性表達研究
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法與操作技術
2 結果與分析
2.1 總RNA的提取
2.2 標準曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴增動力學曲線
2.4 樣品擴增熔解曲線
2.5 UCP1 mRNA的表達量及影響因素
2.6 UCP2 mRNA的表達量及影響因素
2.7 UCP3 mRNA的表達量及影響因素
3 討論
3.1 關于UCP1-UCP3 mRNA的空間性表達
3.2 關于UCP1-UCP3 mRNA的季節(jié)性表達
參考文獻
第五章 綿羊UCP2和UCP3蛋白的免疫組化分析
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法與操作技術
2 結果與分析
2.1 免疫組化分析
2.2 UCP2的表達量及影響因素
2.3 UCP3的表達量及影響因素
3 討論
參考文獻
全文結論
特色與創(chuàng)新
附錄一 綿羊UCP2和UCP3基因全長CDNA序列和對應氨基酸序列
附錄二 綿羊UCP2和UCP3基因的DNA序列
附錄三 綿羊UCP2和UCP3基因轉錄起始位點和啟動子預測結果
附錄四 綿羊UCP2和UCP3基因轉錄因子結合位點預測結果
附錄五 蛋白質結構預測對照軟件結果
附錄六 蛋白質結構預測對照軟件結果
ABSTRACT
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]糖皮質激素受體的生物學功能及其在骨代謝中作用的研究進展[J]. 郟舜杰,洪盾,陳海嘯. 中國細胞生物學學報. 2012(12)
[2]基于質譜的蛋白質O-糖基化分析[J]. 王勝,鄒霞,張延. 化學進展. 2010(12)
[3]豬UCP5基因克隆表達特性及與屠體性狀的關聯分析[J]. 李紅霞,趙興波,徐寧迎,姜運良,曹夢,劉玉方,方遲,李寧. 生物化學與生物物理進展. 2010(12)
[4]植物CBF1轉錄因子的生物信息學分析[J]. 蔣瑤,陳其兵. 林業(yè)科學. 2010(06)
[5]糖基化改變與腫瘤的基礎研究[J]. 范振符,陳智周,范飛舟. 標記免疫分析與臨床. 2010(02)
[6]轉錄因子Sp1與腫瘤關系研究的新進展[J]. 白雪,鄧紅. 浙江大學學報(醫(yī)學版). 2010(02)
[7]鱖UCP1,2基因結構、序列分析及組織表達[J]. 王琳,梁旭方,李光照,劉秀霞,林群,白俊杰. 水產學報. 2009(06)
[8]光周期和高脂食物對布氏田鼠能量代謝和產熱的影響[J]. 趙志軍,陳競峰,王德華. 動物學報. 2008(04)
[9]PPARδ在脂質代謝中的作用[J]. 王靜,江淼,夏軍輝,李霞,易光輝,阮長耿. 生命的化學. 2008(02)
[10]基因組CpG島甲基化檢測技術研究進展[J]. 張松法,葉楓,陳懷增,謝幸. 國際遺傳學雜志. 2006(03)
本文編號:3534133
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