英諾克李斯特菌侵染果蠅S2細(xì)胞后的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-11 05:42
【目的】英諾克李斯特菌Listeria innocua為李斯特菌屬Listeria的一種非致病菌,與致病菌單增李斯特菌L.monocytogenes具有共同的毒力祖先,本文旨在研究英諾克李斯特菌侵染后宿主基因表達(dá)的變化情況,為宿主調(diào)控、防御單增李斯特菌的危害提供參考!痉椒ā坑糜⒅Z克李斯特菌侵染果蠅S2細(xì)胞,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序檢測(cè)該細(xì)菌侵染后果蠅S2細(xì)胞的基因表達(dá)變化,采用qPCR驗(yàn)證英諾克李斯特菌侵染后果蠅S2細(xì)胞中差異表達(dá)的基因。【結(jié)果】英諾克李斯特侵染3 h后,宿主果蠅S2細(xì)胞中Toll/Imd信號(hào)通路發(fā)生顯著上調(diào),吞噬體和霍亂弧菌Vibrio cholerae感染信號(hào)通路顯著下調(diào);抗菌肽基因DmDef(DmDefensin)、DmDro(DmDrosomycin)、DmDpt A(DmDptericin A)、DmDpt B(DmDptericinB)、 DmMtk(DmMetchnikowin)、 DmCec A2(DmCecropinA2)、 DmAtt A(DmAttacinA)、 DmAtt B(DmAttacin B)、DmAtt D(DmAttacin D)、DmCec...
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
免疫相關(guān)基因表達(dá)的qPCR驗(yàn)證結(jié)果
對(duì)照組和試驗(yàn)組分別平均產(chǎn)生了59 125 670和60 779 885條原始數(shù)據(jù),錯(cuò)誤率均在0.025 6%以下(表1)。果蠅S2細(xì)胞被英諾克李斯特菌侵染前基因組的GC質(zhì)量分?jǐn)?shù)在50%左右,被侵染3 h后基因組GC質(zhì)量分?jǐn)?shù)變化不大(表1)。對(duì)照組和試驗(yàn)組的3次生物學(xué)重復(fù)之間的相關(guān)性系數(shù)均在0.994 9以上,表明各組之間重復(fù)性良好,可進(jìn)行下一步分析。2.3 果蠅S2細(xì)胞基因表達(dá)差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲肽聚糖識(shí)別蛋白研究進(jìn)展[J]. 陳康康,呂志強(qiáng). 昆蟲學(xué)報(bào). 2014(08)
[2]果蠅Toll和IMD信號(hào)通路中的功能結(jié)構(gòu)域[J]. 劉甜,羅開珺. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2011(03)
[3]李斯特菌毒力因子及其調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 郎需龍,王興龍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2011(03)
[4]單核細(xì)胞李斯特菌研究近況[J]. 李翠云. 中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué). 2010(01)
[5]V-ATPases的功能及其抑制劑研究進(jìn)展[J]. 游海燕,鄧云,覃文新. 生命科學(xué). 2009(04)
[6]單核細(xì)胞增多性李斯特菌hlyA基因序列及溶血素活性測(cè)定[J]. 譚炳乾,何啟蓋,肖軍,陳煥春. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(02)
[7]李斯特菌毒力因子及其進(jìn)化[J]. 陳健舜,江玲麗,方維煥. 微生物學(xué)報(bào). 2007(04)
[8]昆蟲抗菌肽基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理[J]. 程廷才,王根洪,李娟,夏慶友. 蠶學(xué)通訊. 2004(03)
博士論文
[1]基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)揭示單增李斯特菌毒力因子的研究[D]. 王旭.上海海洋大學(xué) 2016
碩士論文
[1]李斯特菌致病性的研究及部分基因的功能分析[D]. 杜秀嬡.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]單核細(xì)胞增生李斯特菌毒力相關(guān)基因的篩選鑒定及其功能研究[D]. 蔡雪薛.揚(yáng)州大學(xué) 2017
本文編號(hào):3534110
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
免疫相關(guān)基因表達(dá)的qPCR驗(yàn)證結(jié)果
對(duì)照組和試驗(yàn)組分別平均產(chǎn)生了59 125 670和60 779 885條原始數(shù)據(jù),錯(cuò)誤率均在0.025 6%以下(表1)。果蠅S2細(xì)胞被英諾克李斯特菌侵染前基因組的GC質(zhì)量分?jǐn)?shù)在50%左右,被侵染3 h后基因組GC質(zhì)量分?jǐn)?shù)變化不大(表1)。對(duì)照組和試驗(yàn)組的3次生物學(xué)重復(fù)之間的相關(guān)性系數(shù)均在0.994 9以上,表明各組之間重復(fù)性良好,可進(jìn)行下一步分析。2.3 果蠅S2細(xì)胞基因表達(dá)差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲肽聚糖識(shí)別蛋白研究進(jìn)展[J]. 陳康康,呂志強(qiáng). 昆蟲學(xué)報(bào). 2014(08)
[2]果蠅Toll和IMD信號(hào)通路中的功能結(jié)構(gòu)域[J]. 劉甜,羅開珺. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2011(03)
[3]李斯特菌毒力因子及其調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 郎需龍,王興龍. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2011(03)
[4]單核細(xì)胞李斯特菌研究近況[J]. 李翠云. 中國(guó)熱帶醫(yī)學(xué). 2010(01)
[5]V-ATPases的功能及其抑制劑研究進(jìn)展[J]. 游海燕,鄧云,覃文新. 生命科學(xué). 2009(04)
[6]單核細(xì)胞增多性李斯特菌hlyA基因序列及溶血素活性測(cè)定[J]. 譚炳乾,何啟蓋,肖軍,陳煥春. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(02)
[7]李斯特菌毒力因子及其進(jìn)化[J]. 陳健舜,江玲麗,方維煥. 微生物學(xué)報(bào). 2007(04)
[8]昆蟲抗菌肽基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理[J]. 程廷才,王根洪,李娟,夏慶友. 蠶學(xué)通訊. 2004(03)
博士論文
[1]基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)揭示單增李斯特菌毒力因子的研究[D]. 王旭.上海海洋大學(xué) 2016
碩士論文
[1]李斯特菌致病性的研究及部分基因的功能分析[D]. 杜秀嬡.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]單核細(xì)胞增生李斯特菌毒力相關(guān)基因的篩選鑒定及其功能研究[D]. 蔡雪薛.揚(yáng)州大學(xué) 2017
本文編號(hào):3534110
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