英諾克李斯特菌侵染果蠅S2細胞后的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2021-12-11 05:42
【目的】英諾克李斯特菌Listeria innocua為李斯特菌屬Listeria的一種非致病菌,與致病菌單增李斯特菌L.monocytogenes具有共同的毒力祖先,本文旨在研究英諾克李斯特菌侵染后宿主基因表達的變化情況,為宿主調(diào)控、防御單增李斯特菌的危害提供參考!痉椒ā坑糜⒅Z克李斯特菌侵染果蠅S2細胞,利用轉(zhuǎn)錄組測序檢測該細菌侵染后果蠅S2細胞的基因表達變化,采用qPCR驗證英諾克李斯特菌侵染后果蠅S2細胞中差異表達的基因!窘Y(jié)果】英諾克李斯特侵染3 h后,宿主果蠅S2細胞中Toll/Imd信號通路發(fā)生顯著上調(diào),吞噬體和霍亂弧菌Vibrio cholerae感染信號通路顯著下調(diào);抗菌肽基因DmDef(DmDefensin)、DmDro(DmDrosomycin)、DmDpt A(DmDptericin A)、DmDpt B(DmDptericinB)、 DmMtk(DmMetchnikowin)、 DmCec A2(DmCecropinA2)、 DmAtt A(DmAttacinA)、 DmAtt B(DmAttacin B)、DmAtt D(DmAttacin D)、DmCec...
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
免疫相關(guān)基因表達的qPCR驗證結(jié)果
對照組和試驗組分別平均產(chǎn)生了59 125 670和60 779 885條原始數(shù)據(jù),錯誤率均在0.025 6%以下(表1)。果蠅S2細胞被英諾克李斯特菌侵染前基因組的GC質(zhì)量分數(shù)在50%左右,被侵染3 h后基因組GC質(zhì)量分數(shù)變化不大(表1)。對照組和試驗組的3次生物學(xué)重復(fù)之間的相關(guān)性系數(shù)均在0.994 9以上,表明各組之間重復(fù)性良好,可進行下一步分析。2.3 果蠅S2細胞基因表達差異
【參考文獻】:
期刊論文
[1]昆蟲肽聚糖識別蛋白研究進展[J]. 陳康康,呂志強. 昆蟲學(xué)報. 2014(08)
[2]果蠅Toll和IMD信號通路中的功能結(jié)構(gòu)域[J]. 劉甜,羅開珺. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2011(03)
[3]李斯特菌毒力因子及其調(diào)控機制的研究進展[J]. 郎需龍,王興龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2011(03)
[4]單核細胞李斯特菌研究近況[J]. 李翠云. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2010(01)
[5]V-ATPases的功能及其抑制劑研究進展[J]. 游海燕,鄧云,覃文新. 生命科學(xué). 2009(04)
[6]單核細胞增多性李斯特菌hlyA基因序列及溶血素活性測定[J]. 譚炳乾,何啟蓋,肖軍,陳煥春. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2009(02)
[7]李斯特菌毒力因子及其進化[J]. 陳健舜,江玲麗,方維煥. 微生物學(xué)報. 2007(04)
[8]昆蟲抗菌肽基因表達調(diào)控機理[J]. 程廷才,王根洪,李娟,夏慶友. 蠶學(xué)通訊. 2004(03)
博士論文
[1]基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)揭示單增李斯特菌毒力因子的研究[D]. 王旭.上海海洋大學(xué) 2016
碩士論文
[1]李斯特菌致病性的研究及部分基因的功能分析[D]. 杜秀嬡.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]單核細胞增生李斯特菌毒力相關(guān)基因的篩選鑒定及其功能研究[D]. 蔡雪薛.揚州大學(xué) 2017
本文編號:3534110
【文章來源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
免疫相關(guān)基因表達的qPCR驗證結(jié)果
對照組和試驗組分別平均產(chǎn)生了59 125 670和60 779 885條原始數(shù)據(jù),錯誤率均在0.025 6%以下(表1)。果蠅S2細胞被英諾克李斯特菌侵染前基因組的GC質(zhì)量分數(shù)在50%左右,被侵染3 h后基因組GC質(zhì)量分數(shù)變化不大(表1)。對照組和試驗組的3次生物學(xué)重復(fù)之間的相關(guān)性系數(shù)均在0.994 9以上,表明各組之間重復(fù)性良好,可進行下一步分析。2.3 果蠅S2細胞基因表達差異
【參考文獻】:
期刊論文
[1]昆蟲肽聚糖識別蛋白研究進展[J]. 陳康康,呂志強. 昆蟲學(xué)報. 2014(08)
[2]果蠅Toll和IMD信號通路中的功能結(jié)構(gòu)域[J]. 劉甜,羅開珺. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2011(03)
[3]李斯特菌毒力因子及其調(diào)控機制的研究進展[J]. 郎需龍,王興龍. 中國畜牧獸醫(yī). 2011(03)
[4]單核細胞李斯特菌研究近況[J]. 李翠云. 中國熱帶醫(yī)學(xué). 2010(01)
[5]V-ATPases的功能及其抑制劑研究進展[J]. 游海燕,鄧云,覃文新. 生命科學(xué). 2009(04)
[6]單核細胞增多性李斯特菌hlyA基因序列及溶血素活性測定[J]. 譚炳乾,何啟蓋,肖軍,陳煥春. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2009(02)
[7]李斯特菌毒力因子及其進化[J]. 陳健舜,江玲麗,方維煥. 微生物學(xué)報. 2007(04)
[8]昆蟲抗菌肽基因表達調(diào)控機理[J]. 程廷才,王根洪,李娟,夏慶友. 蠶學(xué)通訊. 2004(03)
博士論文
[1]基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)揭示單增李斯特菌毒力因子的研究[D]. 王旭.上海海洋大學(xué) 2016
碩士論文
[1]李斯特菌致病性的研究及部分基因的功能分析[D]. 杜秀嬡.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]單核細胞增生李斯特菌毒力相關(guān)基因的篩選鑒定及其功能研究[D]. 蔡雪薛.揚州大學(xué) 2017
本文編號:3534110
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