不同克隆效率水牛體細胞染色質(zhì)開放度與ATP含量的初步分析
發(fā)布時間:2021-12-11 07:10
水牛體細胞克隆是良種水牛快速擴繁的一種有效技術(shù)手段,但因其效率較低,尚無法推廣應(yīng)用。研究表明,來自不同水牛個體細胞的克隆效率存在明顯差異,但導(dǎo)致這種差異的機理尚不清楚。體細胞的克隆效率主要取決于其重編程的效率,而重編程的效率可能與細胞的染色質(zhì)開放度和重塑難易程度密切相關(guān)。為此,本研究擬通過比較不同克隆效率細胞系的染色質(zhì)重塑相關(guān)基因表達、染色質(zhì)開放程度和轉(zhuǎn)錄水平的差異,并探討ATP含量對染色質(zhì)重塑相關(guān)基因表達的影響,以便初步探明不同個體水牛體細胞克隆效率差異的機制,為提高水牛體細胞克隆效率奠定基礎(chǔ)。研究取得如下結(jié)果:1.不同克隆效率的水牛體細胞特征分析選擇本實驗室建立的克隆效率存在明顯差異的2個水牛胎兒體細胞系(克隆效率較高的BFF3和克隆效率較低的BFF1),分析它們之間的染色質(zhì)重塑SWI/SNF ATP依賴性的核心酶基因SMARCA4表達差異。結(jié)果發(fā)現(xiàn),BFF1中SMARCA4表達水平顯著低于BFF3(P<0.05)。兩株細胞的生長特征檢測發(fā)現(xiàn),在對數(shù)期的增殖速度并無明顯差異,平臺期后的BFF1細胞增殖速度低于BFF3;接觸抑制后,兩株細胞G0/G1期所占比例分別為90.75%...
【文章來源】: 廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮寫-中文對照表
第一章 文獻綜述
1.1 動物體細胞克隆技術(shù)研究進展
1.1.1 影響體細胞克隆效率的因素
1.2 表觀遺傳修飾的重編程研究進展
1.2.1 組蛋白修飾
1.2.2 DNA甲基化
1.2.3 染色質(zhì)重塑
1.3 細胞重編程中的能量代謝
1.3.1 氧化磷酸化途徑
1.3.2 糖酵解途徑
1.4 高通量測序技術(shù)
1.4.1 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
1.4.2 染色質(zhì)可及性高通量測序(ATAC-seq)
1.5 研究目的及意義
第二章 不同克隆效率水牛體細胞染色質(zhì)開放度及轉(zhuǎn)錄水平分析
前言
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.3 結(jié)果
2.3.1 不同克隆效率細胞SMARCA4基因表達分析
2.3.2 不同克隆效率細胞生長曲線的繪制
2.3.3 不同克隆效率細胞周期分析
2.3.4 GO/G1期細胞SWI/SNF家族基因的表達分析
2.3.5 BFF1、BFF3細胞ATAC-seq分析
2.3.6 染色質(zhì)開放度分析
2.3.7 RNA-seq分析
2.4 分析討論
2.5 小結(jié)
第三章 ATP含量對不同克隆效率細胞SWI/SNF家族主要基因表達的影響
前言
3.1 試驗材料
3.2 試驗方法
3.3 結(jié)果
3.3.1 魚藤酮對細胞增殖的影響
3.3.2 魚藤酮處理對細胞凋亡的影響
3.3.3 魚藤酮處理對細胞線粒體膜電位的影響
3.3.4 魚藤酮處理對細胞ATP含量的影響
3.3.5 魚藤酮處理對細胞SWI/SNF家族特定基因表達的影響
3.3.6 2-DG處理細胞ATP含量的檢測
3.3.7 2-DG處理細胞對SWI/SNF家族基因表達的影響
3.4 分析與討論
3.5 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻
致謝
發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展和應(yīng)用 [J]. 王楚彪,盧萬鴻,林彥,羅建中. 桉樹科技. 2018(04)
[2]22-脫氧葡萄糖通過激活A(yù)MPK通路抑制類風濕關(guān)節(jié)炎血管新生 [J]. 王穎,韋穎梅,程秀,孫小錦,馬琳艷,宋宜寧,周靜,魏芳,劉浩. 南方醫(yī)科大學學報. 2018(08)
[3]SWI/SNF復(fù)合物相關(guān)基因在腫瘤中的研究進展 [J]. 賈彩虹,陳吉. 世界最新醫(yī)學信息文摘. 2018(45)
[4]表觀遺傳學研究進展 [J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學:生命科學. 2017(01)
[5]精子的表觀遺傳學與胚胎發(fā)育關(guān)系的研究進展 [J]. 何燕芳,馬潔樺,潘連軍,黃宇烽. 中華男科學雜志. 2014(08)
[6]供體細胞形態(tài)、直徑和傳代次數(shù)對豬體細胞核移植效果的影響 [J]. 黃雅瓊,石德順,陳旭健,李家洲,曾詩媛,詹萍,阮桂文,趙仕花. 中國獸醫(yī)科學. 2011(05)
[7]表觀遺傳學研究進展 [J]. 李光雷,喻樹迅,范術(shù)麗,宋美珍,龐朝友. 生物技術(shù)通報. 2011(01)
[8]完整的供體細胞膜及供體胞質(zhì)對小鼠體細胞克隆胚發(fā)育的影響 [J]. 王二耀,于洋,李雪梅,焦麗紅,周琪,王柳. 遺傳. 2007(02)
[9]Production of transgenic blastocyst by nuclear transfer from different types of somatic cells in cattle [J]. GONG Guochun1, DAI Yunping1, FAN Baoliang1, ZHU Huabing2, WANG Haiping3, WANG Lili1, FANG Changge1, WAN Rong3, LIU Ying3, LI Rong3 & LI Ning1 1. State Key Laboratory for Agrobiotechnology, China Agricultural University, Beijing 100094, China; 2. Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100094, China; 3. Gentitan Biotechnology Ltd., Beijing 100084, China. Science in China(Series C:Life Sciences). 2004(02)
[10]利用核移植技術(shù)生產(chǎn)人類疾病大鼠模型的研究 [J]. 周琪. 中國科學院院刊. 2003(06)
博士論文
[1]水牛供體細胞性別對其核移植胚胎發(fā)育及印記基因甲基化的影響[D]. 阮子蕓.廣西大學. 2017
[2]牛體細胞克隆中異常重編程的分析及提高重編程效率的研究[D]. 蘇建民.西北農(nóng)林科技大學. 2012
碩士論文
[1]雞卵泡體細胞轉(zhuǎn)錄組研究及芳香化酶基因調(diào)控分析[D]. 景若曦.華中農(nóng)業(yè)大學. 2018
[2]牛體外受精及顯微注射的研究[D]. 張緯.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學. 2016
[3]SWI/SNF染色質(zhì)重塑復(fù)合物的不同組分在人類胚胎干細胞中的功能研究[D]. 李兵.華東師范大學. 2013
本文編號:3534234
【文章來源】: 廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮寫-中文對照表
第一章 文獻綜述
1.1 動物體細胞克隆技術(shù)研究進展
1.1.1 影響體細胞克隆效率的因素
1.2 表觀遺傳修飾的重編程研究進展
1.2.1 組蛋白修飾
1.2.2 DNA甲基化
1.2.3 染色質(zhì)重塑
1.3 細胞重編程中的能量代謝
1.3.1 氧化磷酸化途徑
1.3.2 糖酵解途徑
1.4 高通量測序技術(shù)
1.4.1 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
1.4.2 染色質(zhì)可及性高通量測序(ATAC-seq)
1.5 研究目的及意義
第二章 不同克隆效率水牛體細胞染色質(zhì)開放度及轉(zhuǎn)錄水平分析
前言
2.1 試驗材料
2.2 試驗方法
2.3 結(jié)果
2.3.1 不同克隆效率細胞SMARCA4基因表達分析
2.3.2 不同克隆效率細胞生長曲線的繪制
2.3.3 不同克隆效率細胞周期分析
2.3.4 GO/G1期細胞SWI/SNF家族基因的表達分析
2.3.5 BFF1、BFF3細胞ATAC-seq分析
2.3.6 染色質(zhì)開放度分析
2.3.7 RNA-seq分析
2.4 分析討論
2.5 小結(jié)
第三章 ATP含量對不同克隆效率細胞SWI/SNF家族主要基因表達的影響
前言
3.1 試驗材料
3.2 試驗方法
3.3 結(jié)果
3.3.1 魚藤酮對細胞增殖的影響
3.3.2 魚藤酮處理對細胞凋亡的影響
3.3.3 魚藤酮處理對細胞線粒體膜電位的影響
3.3.4 魚藤酮處理對細胞ATP含量的影響
3.3.5 魚藤酮處理對細胞SWI/SNF家族特定基因表達的影響
3.3.6 2-DG處理細胞ATP含量的檢測
3.3.7 2-DG處理細胞對SWI/SNF家族基因表達的影響
3.4 分析與討論
3.5 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻
致謝
發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展和應(yīng)用 [J]. 王楚彪,盧萬鴻,林彥,羅建中. 桉樹科技. 2018(04)
[2]22-脫氧葡萄糖通過激活A(yù)MPK通路抑制類風濕關(guān)節(jié)炎血管新生 [J]. 王穎,韋穎梅,程秀,孫小錦,馬琳艷,宋宜寧,周靜,魏芳,劉浩. 南方醫(yī)科大學學報. 2018(08)
[3]SWI/SNF復(fù)合物相關(guān)基因在腫瘤中的研究進展 [J]. 賈彩虹,陳吉. 世界最新醫(yī)學信息文摘. 2018(45)
[4]表觀遺傳學研究進展 [J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學:生命科學. 2017(01)
[5]精子的表觀遺傳學與胚胎發(fā)育關(guān)系的研究進展 [J]. 何燕芳,馬潔樺,潘連軍,黃宇烽. 中華男科學雜志. 2014(08)
[6]供體細胞形態(tài)、直徑和傳代次數(shù)對豬體細胞核移植效果的影響 [J]. 黃雅瓊,石德順,陳旭健,李家洲,曾詩媛,詹萍,阮桂文,趙仕花. 中國獸醫(yī)科學. 2011(05)
[7]表觀遺傳學研究進展 [J]. 李光雷,喻樹迅,范術(shù)麗,宋美珍,龐朝友. 生物技術(shù)通報. 2011(01)
[8]完整的供體細胞膜及供體胞質(zhì)對小鼠體細胞克隆胚發(fā)育的影響 [J]. 王二耀,于洋,李雪梅,焦麗紅,周琪,王柳. 遺傳. 2007(02)
[9]Production of transgenic blastocyst by nuclear transfer from different types of somatic cells in cattle [J]. GONG Guochun1, DAI Yunping1, FAN Baoliang1, ZHU Huabing2, WANG Haiping3, WANG Lili1, FANG Changge1, WAN Rong3, LIU Ying3, LI Rong3 & LI Ning1 1. State Key Laboratory for Agrobiotechnology, China Agricultural University, Beijing 100094, China; 2. Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100094, China; 3. Gentitan Biotechnology Ltd., Beijing 100084, China. Science in China(Series C:Life Sciences). 2004(02)
[10]利用核移植技術(shù)生產(chǎn)人類疾病大鼠模型的研究 [J]. 周琪. 中國科學院院刊. 2003(06)
博士論文
[1]水牛供體細胞性別對其核移植胚胎發(fā)育及印記基因甲基化的影響[D]. 阮子蕓.廣西大學. 2017
[2]牛體細胞克隆中異常重編程的分析及提高重編程效率的研究[D]. 蘇建民.西北農(nóng)林科技大學. 2012
碩士論文
[1]雞卵泡體細胞轉(zhuǎn)錄組研究及芳香化酶基因調(diào)控分析[D]. 景若曦.華中農(nóng)業(yè)大學. 2018
[2]牛體外受精及顯微注射的研究[D]. 張緯.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學. 2016
[3]SWI/SNF染色質(zhì)重塑復(fù)合物的不同組分在人類胚胎干細胞中的功能研究[D]. 李兵.華東師范大學. 2013
本文編號:3534234
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