四環(huán)素脅迫下小鼠腸道微生物群落變化及代謝毒理效應(yīng)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-09 10:55
抗生素廣泛應(yīng)用于人類和動(dòng)物疾病預(yù)防和治療中。此外,抗生素作為生長(zhǎng)促進(jìn)劑廣泛運(yùn)用于畜牧養(yǎng)殖業(yè),提高飼料利用率,促進(jìn)畜禽生長(zhǎng)?股氐氖褂脤(duì)腸道微生物群落產(chǎn)生巨大影響,而這些腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和功能對(duì)畜禽健康、生長(zhǎng)起著重要作用。盡管抗生素的使用給畜牧業(yè)帶來明顯的效益,但其引發(fā)的耐藥基因的增加和水平轉(zhuǎn)移,對(duì)人類健康和生態(tài)安全構(gòu)成了潛在威脅。本文研究旨在探討鹽酸四環(huán)素(tetracycline hydrochloride, TET)對(duì)小鼠代謝毒性以及腸道微生物結(jié)構(gòu)與功能的影響,并評(píng)估其影響腸道微生物耐藥性潛在風(fēng)險(xiǎn)。肝臟組織切片顯示TET暴露誘發(fā)小鼠肝臟組織嚴(yán)重病變,且呈現(xiàn)顯著劑量效應(yīng);停止暴露后中高濃度組肝臟組織病變難以徹底恢復(fù)。基于氫質(zhì)譜核磁共振(’Hnuclear magnetic resonance spectroscopy,1H-NMR)的代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)及偏最小二乘判別法(partial least squares discriminant analysis, PLS-DA)分析結(jié)果顯示不同劑量TET暴露均影響小鼠血清和尿液代謝,染毒組血清和尿液中眾多代謝物質(zhì)與對(duì)照組存在顯著性差異,這些...
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素應(yīng)用與污染現(xiàn)狀及潛在風(fēng)險(xiǎn)
1.1.2 毒理代謝組學(xué)研究進(jìn)展
1.1.3 腸道微生物學(xué)研究進(jìn)展
1.1.4 宏基因組學(xué)和高通量測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展
1.2 選題依據(jù)與研究目的
1.3 研究?jī)?nèi)容和技術(shù)路線
參考文獻(xiàn)
第2章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠代謝的影響
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
2.2.2 小鼠肝臟組織切片實(shí)驗(yàn)
2.2.3 小鼠尿液和血清代謝分析預(yù)處理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代謝分析
2.3 試驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠表型和肝臟病理學(xué)的影響
2.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠血清代謝的影響
2.3.3 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠尿液代謝的影響
2.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第3章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道抗生素耐藥的影響
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
3.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
3.2.3 耐藥基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量測(cè)序及質(zhì)量控制
3.2.5 耐藥基因blast比對(duì)分析
3.2.6 可移動(dòng)元件blast比對(duì)分析
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道耐藥基因豐度和多樣性的影響
3.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道可移動(dòng)元件的多樣性和豐度的影響
3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第4章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群結(jié)構(gòu)與功能的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
4.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸測(cè)序及質(zhì)量控制
4.2.4 胃腸道微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性分析
4.2.5 Illumina高通量測(cè)序及質(zhì)量控制
4.2.6 COG功能數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建及微生物功能分析
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響
4.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群功能的影響
4.3.3 小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能與肝臟組織病變和尿液、血清代謝相關(guān)性結(jié)果
4.3.4 小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能與耐藥基因相關(guān)性結(jié)果
4.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第5章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 研究展望
第6章 創(chuàng)新點(diǎn)
項(xiàng)目支持
成果清單
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗生素濫用的現(xiàn)狀及解決對(duì)策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方藥學(xué). 2013(06)
[2]454測(cè)序技術(shù)在微生物生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 段曌,肖煒,王永霞,賴泳紅,崔曉龍. 微生物學(xué)雜志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及與肝病相關(guān)血清學(xué)指標(biāo)的關(guān)系[J]. 唐晚若,陳江,朱益斌,楊國(guó)英. 中外醫(yī)學(xué)研究. 2011(24)
[4]宏基因組技術(shù)及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 宋培勇,馬莉莉,王慶容,李黛,魏志琴. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(10)
[5]畜禽養(yǎng)殖中抗生素使用的現(xiàn)狀、問題及對(duì)策[J]. 李振,王云建. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一種新型環(huán)境污染物[J]. 羅義,周啟星. 環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2008(08)
[7]宏基因組學(xué)(Metagenomics)的研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢(shì)[J]. 賀紀(jì)正,張麗梅,沈菊培,朱永官. 環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2008(02)
[8]獸用抗生素在土壤環(huán)境中的行為及其生態(tài)毒理效應(yīng)研究進(jìn)展[J]. 李兆君,姚志鵬,張杰,梁永超. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2008(01)
[9]環(huán)境中抗生素殘留潛在風(fēng)險(xiǎn)及其研究進(jìn)展[J]. 王冰,孫成,胡冠九. 環(huán)境科學(xué)與技術(shù). 2007(03)
[10]土壤宏基因組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 沈菊培,張麗梅,鄭袁明,朱永官,賀紀(jì)正. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2007(01)
本文編號(hào):3530516
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素應(yīng)用與污染現(xiàn)狀及潛在風(fēng)險(xiǎn)
1.1.2 毒理代謝組學(xué)研究進(jìn)展
1.1.3 腸道微生物學(xué)研究進(jìn)展
1.1.4 宏基因組學(xué)和高通量測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展
1.2 選題依據(jù)與研究目的
1.3 研究?jī)?nèi)容和技術(shù)路線
參考文獻(xiàn)
第2章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠代謝的影響
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
2.2.2 小鼠肝臟組織切片實(shí)驗(yàn)
2.2.3 小鼠尿液和血清代謝分析預(yù)處理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代謝分析
2.3 試驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠表型和肝臟病理學(xué)的影響
2.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠血清代謝的影響
2.3.3 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠尿液代謝的影響
2.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第3章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道抗生素耐藥的影響
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
3.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
3.2.3 耐藥基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量測(cè)序及質(zhì)量控制
3.2.5 耐藥基因blast比對(duì)分析
3.2.6 可移動(dòng)元件blast比對(duì)分析
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道耐藥基因豐度和多樣性的影響
3.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道可移動(dòng)元件的多樣性和豐度的影響
3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第4章 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群結(jié)構(gòu)與功能的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
4.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸測(cè)序及質(zhì)量控制
4.2.4 胃腸道微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性分析
4.2.5 Illumina高通量測(cè)序及質(zhì)量控制
4.2.6 COG功能數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建及微生物功能分析
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響
4.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對(duì)小鼠胃腸道菌群功能的影響
4.3.3 小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能與肝臟組織病變和尿液、血清代謝相關(guān)性結(jié)果
4.3.4 小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能與耐藥基因相關(guān)性結(jié)果
4.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第5章 結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 研究展望
第6章 創(chuàng)新點(diǎn)
項(xiàng)目支持
成果清單
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗生素濫用的現(xiàn)狀及解決對(duì)策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方藥學(xué). 2013(06)
[2]454測(cè)序技術(shù)在微生物生態(tài)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 段曌,肖煒,王永霞,賴泳紅,崔曉龍. 微生物學(xué)雜志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及與肝病相關(guān)血清學(xué)指標(biāo)的關(guān)系[J]. 唐晚若,陳江,朱益斌,楊國(guó)英. 中外醫(yī)學(xué)研究. 2011(24)
[4]宏基因組技術(shù)及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 宋培勇,馬莉莉,王慶容,李黛,魏志琴. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(10)
[5]畜禽養(yǎng)殖中抗生素使用的現(xiàn)狀、問題及對(duì)策[J]. 李振,王云建. 中國(guó)動(dòng)物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一種新型環(huán)境污染物[J]. 羅義,周啟星. 環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2008(08)
[7]宏基因組學(xué)(Metagenomics)的研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢(shì)[J]. 賀紀(jì)正,張麗梅,沈菊培,朱永官. 環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2008(02)
[8]獸用抗生素在土壤環(huán)境中的行為及其生態(tài)毒理效應(yīng)研究進(jìn)展[J]. 李兆君,姚志鵬,張杰,梁永超. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2008(01)
[9]環(huán)境中抗生素殘留潛在風(fēng)險(xiǎn)及其研究進(jìn)展[J]. 王冰,孫成,胡冠九. 環(huán)境科學(xué)與技術(shù). 2007(03)
[10]土壤宏基因組學(xué)技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 沈菊培,張麗梅,鄭袁明,朱永官,賀紀(jì)正. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2007(01)
本文編號(hào):3530516
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