利用微衛(wèi)星和SNP標(biāo)記對(duì)西門塔爾牛進(jìn)行親子推斷的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 13:44
系譜信息在牛遺傳育種中起到重要作用,可用于QTL定位、全基因組選擇及基于BLUP模型的種公牛遺傳評(píng)定等研究。本研究的實(shí)驗(yàn)群體為來(lái)自內(nèi)蒙古烏拉蓋地區(qū)的西門塔爾牛資源群體,由于該資源群體以放牧形式為主、自然交配和人工授精相結(jié)合的配種方式,加之管理方式粗放,系譜記錄缺失和錯(cuò)誤十分嚴(yán)重。錯(cuò)誤的系譜會(huì)降低遺傳評(píng)定準(zhǔn)確性,降低遺傳進(jìn)展,因此進(jìn)行西門塔爾牛親子鑒定是亟待解決的問(wèn)題。本研究通過(guò)檢測(cè)西門塔爾牛實(shí)驗(yàn)群體中微衛(wèi)星和SNP兩種標(biāo)記的遺傳多態(tài)性,旨在優(yōu)化西門塔爾;谖⑿l(wèi)星標(biāo)記的親子鑒定體系,建立基于SNP標(biāo)記的西門塔爾牛親子鑒定體系,并利用兩套標(biāo)記對(duì)本群體牛進(jìn)行親子鑒定,糾正潛在的錯(cuò)誤系譜,建立完整、準(zhǔn)確的系譜體系,提高育種值估計(jì)的準(zhǔn)確性,進(jìn)而加快西門塔爾牛的遺傳進(jìn)展。結(jié)果如下:1.確定了8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記作為西門塔爾牛微衛(wèi)星親子鑒定體系的標(biāo)記組合:BM2113、TGLA122、ETH225、INRA023、TGLA53、CSSM66、HAUT27、INRA037及2個(gè)候選標(biāo)記:BM1824和INRA032。該標(biāo)記組合的等位基因數(shù)、期望雜合度、多態(tài)信息含量的平均值分別為:11.4、0.828、0....
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳物質(zhì)傳遞圖
SNP芯片分型流程
基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用SNP標(biāo)記進(jìn)行北京地區(qū)中國(guó)荷斯坦牛親子推斷的研究[J]. 郭剛,周磊,劉林,李東,張勝利,劉劍鋒,丁向東,張毅,王雅春,張勤,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(01)
[2]親權(quán)鑒定方法概述[J]. 徐衛(wèi)華,符生苗,趙英. 海南醫(yī)學(xué). 2011(23)
[3]內(nèi)蒙古地區(qū)西門塔爾牛親子鑒定微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 宋玲,賀建寧,孫東曉,李俊雅,張沅. 中國(guó)畜牧雜志. 2011(13)
[4]應(yīng)用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記分析荷斯坦母牛系譜可靠性及影響因素[J]. 初芹,張毅,孫東曉,俞英,王雅春,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(02)
[5]利用微衛(wèi)星和SNP標(biāo)記信息進(jìn)行奶牛親子鑒定的模擬研究[J]. 周磊,初芹,劉林,劉劍鋒,王雅春,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(02)
[6]奶牛親子鑒定技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 焦利紅,田雨澤,賈福德,朱芳賢,馬毅. 中國(guó)奶牛. 2009(05)
[7]羊駝種群內(nèi)親緣關(guān)系的研究[J]. 高莉,趙英虎,董常生. 激光生物學(xué)報(bào). 2007(06)
[8]微衛(wèi)星標(biāo)記的研究與應(yīng)用[J]. 荀來(lái)武,王桂瑛,何華川,劉燕,楊曉花,張琪艷. 草食家畜. 2007(03)
[9]應(yīng)用血型分析技術(shù)對(duì)奶牛親子關(guān)系正確率的調(diào)查初報(bào)[J]. 汪湛,田雨澤,劉和鳳. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2005(03)
[10]AFLP分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及其在海洋生物中的應(yīng)用[J]. 王偉繼,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水產(chǎn)研究. 2005(01)
博士論文
[1]中國(guó)牦牛分子系統(tǒng)發(fā)育的初步研究[D]. 李齊發(fā).南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]基于高密度SNP芯片技術(shù)對(duì)西門塔爾牛部分肉質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 張立敏.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[2]應(yīng)用微衛(wèi)星確定中國(guó)西門塔爾牛親緣關(guān)系[D]. 賀建寧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[3]應(yīng)用微衛(wèi)星DNA對(duì)Holstein奶牛進(jìn)行親子鑒定[D]. 魯玉霞.山東師范大學(xué) 2008
本文編號(hào):3516097
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
遺傳物質(zhì)傳遞圖
SNP芯片分型流程
基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用SNP標(biāo)記進(jìn)行北京地區(qū)中國(guó)荷斯坦牛親子推斷的研究[J]. 郭剛,周磊,劉林,李東,張勝利,劉劍鋒,丁向東,張毅,王雅春,張勤,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(01)
[2]親權(quán)鑒定方法概述[J]. 徐衛(wèi)華,符生苗,趙英. 海南醫(yī)學(xué). 2011(23)
[3]內(nèi)蒙古地區(qū)西門塔爾牛親子鑒定微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[J]. 宋玲,賀建寧,孫東曉,李俊雅,張沅. 中國(guó)畜牧雜志. 2011(13)
[4]應(yīng)用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記分析荷斯坦母牛系譜可靠性及影響因素[J]. 初芹,張毅,孫東曉,俞英,王雅春,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(02)
[5]利用微衛(wèi)星和SNP標(biāo)記信息進(jìn)行奶牛親子鑒定的模擬研究[J]. 周磊,初芹,劉林,劉劍鋒,王雅春,張沅. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(02)
[6]奶牛親子鑒定技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 焦利紅,田雨澤,賈福德,朱芳賢,馬毅. 中國(guó)奶牛. 2009(05)
[7]羊駝種群內(nèi)親緣關(guān)系的研究[J]. 高莉,趙英虎,董常生. 激光生物學(xué)報(bào). 2007(06)
[8]微衛(wèi)星標(biāo)記的研究與應(yīng)用[J]. 荀來(lái)武,王桂瑛,何華川,劉燕,楊曉花,張琪艷. 草食家畜. 2007(03)
[9]應(yīng)用血型分析技術(shù)對(duì)奶牛親子關(guān)系正確率的調(diào)查初報(bào)[J]. 汪湛,田雨澤,劉和鳳. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2005(03)
[10]AFLP分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及其在海洋生物中的應(yīng)用[J]. 王偉繼,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水產(chǎn)研究. 2005(01)
博士論文
[1]中國(guó)牦牛分子系統(tǒng)發(fā)育的初步研究[D]. 李齊發(fā).南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]基于高密度SNP芯片技術(shù)對(duì)西門塔爾牛部分肉質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 張立敏.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[2]應(yīng)用微衛(wèi)星確定中國(guó)西門塔爾牛親緣關(guān)系[D]. 賀建寧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
[3]應(yīng)用微衛(wèi)星DNA對(duì)Holstein奶牛進(jìn)行親子鑒定[D]. 魯玉霞.山東師范大學(xué) 2008
本文編號(hào):3516097
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