副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株差異分泌蛋白的篩選與鑒定
發(fā)布時間:2021-11-24 14:07
副豬嗜血桿菌(Haemophilus parasuis, Hps)屬于巴氏桿菌科嗜血桿菌屬,是豬上呼吸道的常在菌,該菌引起的感染給養(yǎng)豬生產(chǎn)帶來極大的損失。該菌血清型眾多,毒力因子復(fù)雜,到目前為止發(fā)現(xiàn)了一些副豬嗜血桿菌的毒力因子,但針對不同致病力副豬嗜血桿菌分泌蛋白的差異研究報(bào)道甚少。本試驗(yàn)選取兩株不同致病力副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114菌株作為研究對象,比較其生長特性及致病力,采用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)比較并鑒定其對數(shù)期差異分泌蛋白質(zhì),同時利用熒光定量PCR技術(shù)分析差異分泌蛋白基因轉(zhuǎn)錄水平,具體研究內(nèi)容如下:1副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株生長特性和致病力的比較本試驗(yàn)采用比濁法和平板活菌計(jì)數(shù)兩種方法測量了Nagasaki和SW114株的生長曲線,結(jié)果得知對數(shù)期SW114株生長速度明顯快于Nagasaki株,SW114株穩(wěn)定期持續(xù)時間約為9h,長于Nagasaki株的6h,當(dāng)OD600=0.6時,兩菌株都處于對數(shù)生長期。以體重20-22g 4-8周齡雌性BALB/c小鼠為試驗(yàn)動物,采用改進(jìn)寇氏法鋇Nagasaki和SW114株的半數(shù)致死量,結(jié)果Nagasaki株的半數(shù)致死量...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 副豬嗜血桿菌
1.1 副豬嗜血桿菌及其血清分型
1.2 副豬嗜血桿菌致病機(jī)制
1.3 副豬嗜血桿菌的毒力因子
1.3.1 6-P-葡萄糖酸脫氫酶
1.3.2 脂寡糖
1.3.3 細(xì)胞膨脹致死毒素
1.3.4 免疫球蛋白A蛋白酶
1.3.5 莢膜
1.3.6 菌毛
1.3.7 孔蛋白家族蛋白
1.3.8 V型蛋白分泌系統(tǒng)
1.3.9 單體自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
1.3.10 毒力相關(guān)的三聚體自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
1.4 副豬嗜血桿菌毒力因子鑒定途徑
1.4.1 通過構(gòu)建缺失突變株鑒別副豬嗜血毒力因子
1.4.2 通過不同毒力菌株的比較或者特定培養(yǎng)條件下的比較鑒定毒力因子
2 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的產(chǎn)生及其研究內(nèi)容
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線
2.2.1 雙向凝膠電泳
2.2.2 質(zhì)譜技術(shù)
2.2.3 蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)
2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在細(xì)菌蛋白篩選方面的應(yīng)用
2.3.1 篩選疫苗候選蛋白及發(fā)現(xiàn)新蛋白
2.3.2 篩選病原菌毒力蛋白
2.3.3 篩選耐藥機(jī)制相關(guān)蛋白
3 細(xì)菌分泌蛋白組研究進(jìn)展
4 研究目的及意義
第二部分 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株生長特性及致病力比較
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 實(shí)驗(yàn)動物
2 試驗(yàn)方法
2.1 Nagasaki和SW114株生長曲線測量
2.1.1 菌液OD_(600)的測定
2.1.2 平板活菌計(jì)數(shù)
2.2 Nagasaki和SW114株致病力比較
2.2.1 預(yù)試驗(yàn)
2.2.2 正式試驗(yàn)
2.2.3 半數(shù)致死量的計(jì)算
3 試驗(yàn)結(jié)果
3.1 Nagasaki和SW114株生長曲線
3.2 預(yù)試驗(yàn)結(jié)果
3.3 Nagasaki和SW114株的致病力比較
4 討論
5 小結(jié)
第二章 副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株分泌蛋白的差異分析
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
2 試驗(yàn)方法
2.1 分泌蛋白樣品的制備
2.2 分泌蛋白樣品濃度測定
2.2.1 分泌蛋白樣品的溶解
2.2.2 Bradford法定量
2.3 等點(diǎn)聚焦
2.3.1 膠條的準(zhǔn)備
2.3.2 上樣
2.3.3 放置膠條
2.3.4 加礦物油
2.3.5 設(shè)置程序
2.4 膠條的平衡、轉(zhuǎn)移及SDS-PAGE
2.4.1 膠條的平衡
2.4.2 膠條的轉(zhuǎn)移
2.4.3 SDS-PAGE
2.5 考馬氏亮藍(lán)G250染色與脫色
2.6 雙向電泳凝膠圖像掃描
2.7 圖譜分析及差異蛋白篩選
2.8 差異蛋白質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫搜索
2.8.1 質(zhì)譜鑒定
2.8.2 數(shù)據(jù)庫搜索
3 結(jié)果
3.1 蛋白定量結(jié)果
3.2 組內(nèi)一致性分析
3.3 雙向電泳凝膠圖像的掃描及差異蛋白點(diǎn)的篩選
3.4 差異蛋白的質(zhì)譜鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于雙向電泳圖譜的構(gòu)建
4.2 關(guān)于凝膠圖像的分析
4.3 關(guān)于篩選的差異蛋白
5 小結(jié)
第三章 副豬嗜血桿菌差異分泌蛋白轉(zhuǎn)錄水平的研究
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
2 試驗(yàn)方法
2.1 副豬嗜血桿菌SW114和Nagasaki株總RNA的抽提
2.2 cDNA的合成
2.3 引物合成
2.4 熒光定量PCR檢測
2.4.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
2.4.2 擴(kuò)增曲線的建立
2.4.3 相對轉(zhuǎn)錄水平的計(jì)算
3 結(jié)果
3.1 抽提RNA濃度測定及純度鑒定
3.2 擴(kuò)增效率的建立
3.3 16sRNA、AidA、ompD15和AfuA擴(kuò)增曲線
3.4 16sRNA、AidA、ompD15和AfuA熔解曲線的建立
3.5 相對轉(zhuǎn)錄水平差異分析
4 討論
5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
讀研期間發(fā)表論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 吳婷,陳金梅,李瑩. 大家健康(學(xué)術(shù)版). 2014(04)
[2]血小板蛋白質(zhì)組學(xué)的研究進(jìn)展[J]. 楊義玲,劉文君. 中國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2012(03)
[3]應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法分析缺鐵培養(yǎng)對化膿性鏈球菌MGAS5005的影響[J]. 呂潔,余光創(chuàng),孫正華,王南杰,朱穎,王紅翠,孫雪松. 微生物學(xué)通報(bào). 2012(04)
[4]蛋白質(zhì)組學(xué)研究的有效工具——雙向電泳鑒定技術(shù)[J]. 張穎,楊舸. 重慶文理學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[5]蛋白質(zhì)組學(xué)研究的相關(guān)技術(shù)進(jìn)展[J]. 馮雪,王彬,黃占景,沈銀柱. 生物學(xué)教學(xué). 2010(03)
[6]蛋白質(zhì)組學(xué)及其技術(shù)發(fā)展[J]. 王英超,黨源,李曉艷,王興龍. 生物技術(shù)通訊. 2010(01)
[7]副豬嗜血桿菌感染豚鼠試驗(yàn)及在其體內(nèi)的分布[J]. 高鵬程,儲岳峰,趙萍,賀英,逯忠新. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(09)
[8]熒光定量PCR技術(shù)及其在科研中的應(yīng)用[J]. 朱捷,楊成君,王軍. 生物技術(shù)通報(bào). 2009(02)
[9]蛋白質(zhì)組分析技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉立國,陸慧君,賀文琦,鄧旭明. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2008(01)
[10]柱狀黃桿菌強(qiáng)毒株和弱毒株胞外蛋白中差異蛋白的初步鑒定[J]. 劉國勇,聶品. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2007(05)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]副豬嗜血桿菌分離鑒定及疫苗種用特性研究[D]. 韋劍鋒.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及蜂膠疫苗的免疫保護(hù)效力研究[D]. 鐘霏.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]副豬嗜血桿菌自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白AT1的功能研究[D]. 劉莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]HPS自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的免疫原性及其與宿主細(xì)胞相互作用研究[D]. 張玉娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]柔嫩艾美耳球蟲菱形蛋白樣蛋白酶(EtROMs)基因的克隆及不同發(fā)育階段轉(zhuǎn)錄水平研究[D]. 王洪成.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]PmrA對傷寒沙門菌高滲應(yīng)激后期基因表達(dá)調(diào)節(jié)作用[D]. 高宇琳.江蘇大學(xué) 2009
[7]豬鏈球菌2型不同溫度條件下分泌蛋白的差異研究[D]. 謝春艷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3516131
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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中文摘要
Abstract
縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
1 副豬嗜血桿菌
1.1 副豬嗜血桿菌及其血清分型
1.2 副豬嗜血桿菌致病機(jī)制
1.3 副豬嗜血桿菌的毒力因子
1.3.1 6-P-葡萄糖酸脫氫酶
1.3.2 脂寡糖
1.3.3 細(xì)胞膨脹致死毒素
1.3.4 免疫球蛋白A蛋白酶
1.3.5 莢膜
1.3.6 菌毛
1.3.7 孔蛋白家族蛋白
1.3.8 V型蛋白分泌系統(tǒng)
1.3.9 單體自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
1.3.10 毒力相關(guān)的三聚體自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
1.4 副豬嗜血桿菌毒力因子鑒定途徑
1.4.1 通過構(gòu)建缺失突變株鑒別副豬嗜血毒力因子
1.4.2 通過不同毒力菌株的比較或者特定培養(yǎng)條件下的比較鑒定毒力因子
2 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的產(chǎn)生及其研究內(nèi)容
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線
2.2.1 雙向凝膠電泳
2.2.2 質(zhì)譜技術(shù)
2.2.3 蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)
2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在細(xì)菌蛋白篩選方面的應(yīng)用
2.3.1 篩選疫苗候選蛋白及發(fā)現(xiàn)新蛋白
2.3.2 篩選病原菌毒力蛋白
2.3.3 篩選耐藥機(jī)制相關(guān)蛋白
3 細(xì)菌分泌蛋白組研究進(jìn)展
4 研究目的及意義
第二部分 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株生長特性及致病力比較
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 實(shí)驗(yàn)動物
2 試驗(yàn)方法
2.1 Nagasaki和SW114株生長曲線測量
2.1.1 菌液OD_(600)的測定
2.1.2 平板活菌計(jì)數(shù)
2.2 Nagasaki和SW114株致病力比較
2.2.1 預(yù)試驗(yàn)
2.2.2 正式試驗(yàn)
2.2.3 半數(shù)致死量的計(jì)算
3 試驗(yàn)結(jié)果
3.1 Nagasaki和SW114株生長曲線
3.2 預(yù)試驗(yàn)結(jié)果
3.3 Nagasaki和SW114株的致病力比較
4 討論
5 小結(jié)
第二章 副豬嗜血桿菌Nagasaki和SW114株分泌蛋白的差異分析
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
2 試驗(yàn)方法
2.1 分泌蛋白樣品的制備
2.2 分泌蛋白樣品濃度測定
2.2.1 分泌蛋白樣品的溶解
2.2.2 Bradford法定量
2.3 等點(diǎn)聚焦
2.3.1 膠條的準(zhǔn)備
2.3.2 上樣
2.3.3 放置膠條
2.3.4 加礦物油
2.3.5 設(shè)置程序
2.4 膠條的平衡、轉(zhuǎn)移及SDS-PAGE
2.4.1 膠條的平衡
2.4.2 膠條的轉(zhuǎn)移
2.4.3 SDS-PAGE
2.5 考馬氏亮藍(lán)G250染色與脫色
2.6 雙向電泳凝膠圖像掃描
2.7 圖譜分析及差異蛋白篩選
2.8 差異蛋白質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫搜索
2.8.1 質(zhì)譜鑒定
2.8.2 數(shù)據(jù)庫搜索
3 結(jié)果
3.1 蛋白定量結(jié)果
3.2 組內(nèi)一致性分析
3.3 雙向電泳凝膠圖像的掃描及差異蛋白點(diǎn)的篩選
3.4 差異蛋白的質(zhì)譜鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于雙向電泳圖譜的構(gòu)建
4.2 關(guān)于凝膠圖像的分析
4.3 關(guān)于篩選的差異蛋白
5 小結(jié)
第三章 副豬嗜血桿菌差異分泌蛋白轉(zhuǎn)錄水平的研究
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)菌株
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
2 試驗(yàn)方法
2.1 副豬嗜血桿菌SW114和Nagasaki株總RNA的抽提
2.2 cDNA的合成
2.3 引物合成
2.4 熒光定量PCR檢測
2.4.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
2.4.2 擴(kuò)增曲線的建立
2.4.3 相對轉(zhuǎn)錄水平的計(jì)算
3 結(jié)果
3.1 抽提RNA濃度測定及純度鑒定
3.2 擴(kuò)增效率的建立
3.3 16sRNA、AidA、ompD15和AfuA擴(kuò)增曲線
3.4 16sRNA、AidA、ompD15和AfuA熔解曲線的建立
3.5 相對轉(zhuǎn)錄水平差異分析
4 討論
5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
讀研期間發(fā)表論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)研究進(jìn)展及應(yīng)用[J]. 吳婷,陳金梅,李瑩. 大家健康(學(xué)術(shù)版). 2014(04)
[2]血小板蛋白質(zhì)組學(xué)的研究進(jìn)展[J]. 楊義玲,劉文君. 中國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2012(03)
[3]應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法分析缺鐵培養(yǎng)對化膿性鏈球菌MGAS5005的影響[J]. 呂潔,余光創(chuàng),孫正華,王南杰,朱穎,王紅翠,孫雪松. 微生物學(xué)通報(bào). 2012(04)
[4]蛋白質(zhì)組學(xué)研究的有效工具——雙向電泳鑒定技術(shù)[J]. 張穎,楊舸. 重慶文理學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[5]蛋白質(zhì)組學(xué)研究的相關(guān)技術(shù)進(jìn)展[J]. 馮雪,王彬,黃占景,沈銀柱. 生物學(xué)教學(xué). 2010(03)
[6]蛋白質(zhì)組學(xué)及其技術(shù)發(fā)展[J]. 王英超,黨源,李曉艷,王興龍. 生物技術(shù)通訊. 2010(01)
[7]副豬嗜血桿菌感染豚鼠試驗(yàn)及在其體內(nèi)的分布[J]. 高鵬程,儲岳峰,趙萍,賀英,逯忠新. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(09)
[8]熒光定量PCR技術(shù)及其在科研中的應(yīng)用[J]. 朱捷,楊成君,王軍. 生物技術(shù)通報(bào). 2009(02)
[9]蛋白質(zhì)組分析技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉立國,陸慧君,賀文琦,鄧旭明. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2008(01)
[10]柱狀黃桿菌強(qiáng)毒株和弱毒株胞外蛋白中差異蛋白的初步鑒定[J]. 劉國勇,聶品. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2007(05)
博士論文
[1]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及診斷方法與滅活疫苗的研究[D]. 蔡旭旺.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
碩士論文
[1]副豬嗜血桿菌分離鑒定及疫苗種用特性研究[D]. 韋劍鋒.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]副豬嗜血桿菌的分離鑒定及蜂膠疫苗的免疫保護(hù)效力研究[D]. 鐘霏.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]副豬嗜血桿菌自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白AT1的功能研究[D]. 劉莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]HPS自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的免疫原性及其與宿主細(xì)胞相互作用研究[D]. 張玉娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]柔嫩艾美耳球蟲菱形蛋白樣蛋白酶(EtROMs)基因的克隆及不同發(fā)育階段轉(zhuǎn)錄水平研究[D]. 王洪成.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]PmrA對傷寒沙門菌高滲應(yīng)激后期基因表達(dá)調(diào)節(jié)作用[D]. 高宇琳.江蘇大學(xué) 2009
[7]豬鏈球菌2型不同溫度條件下分泌蛋白的差異研究[D]. 謝春艷.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3516131
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