基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)分析綠原酸對雞源大腸桿菌抑菌及耐藥消除的作用機(jī)制
發(fā)布時間:2021-11-15 10:46
為探究綠原酸對雞源抗生素耐藥大腸桿菌抑菌及耐藥消除的作用機(jī)制,以影印法分離綠原酸濃度為1.25 mg/mL(亞抑菌濃度,1/2 MIC)的LB肉湯培養(yǎng)的第3代禽源大腸桿菌耐藥逆轉(zhuǎn)菌株,以微板法測定耐藥逆轉(zhuǎn)菌株的左氧氟沙星最小抑菌濃度(MIC),并進(jìn)一步通過轉(zhuǎn)錄組測序方法分析綠原酸消除大腸桿菌耐藥性的分子機(jī)制。結(jié)果顯示:耐藥逆轉(zhuǎn)菌株對左氧氟沙星的MIC由16μg/mL降低至4~8μg/mL,說明1.25 mg/mL的綠原酸可在一定程度上消除耐藥大腸桿菌的左氧氟沙星耐藥性。為進(jìn)一步解析綠原酸對雞源大腸桿菌耐藥消除作用的分子機(jī)制,通過轉(zhuǎn)錄組測序方法對耐藥性消除前后雞源大腸桿菌基因表達(dá)水平進(jìn)行對比分析發(fā)現(xiàn):綠原酸作用后共有12個基因的表達(dá)量發(fā)生顯著下調(diào),通過熒光定量PCR驗(yàn)證結(jié)果基本一致。經(jīng)過GO功能富集分析和KEGG代謝通路富集分析發(fā)現(xiàn),差異表達(dá)基因在功能上集中于膜組成成分和DNA重組,在代謝通路富集中差異基因均與代謝相關(guān),差異基因中bhsA、cysP為Coli-HB染色質(zhì)轉(zhuǎn)錄RNA(GenBank登錄號:CP020933),oqxA、oqxR、emaA、pinR、xerD、folA、rep...
【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
臨床分離大腸桿菌菌株P(guān)CR擴(kuò)增結(jié)果
有向無環(huán)圖顯示GO富集條目在生物過程中指向DNA重組(圖2),在細(xì)胞組分中指向細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)(圖3),在分子功能中指向DNA結(jié)合和核苷酸結(jié)合(圖4)。圖3 差異基因細(xì)胞組分基因功能DAG圖
差異基因細(xì)胞組分基因功能DAG圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金銀花提取物對4種病原菌的體外抑菌效果研究[J]. 許欽坤,趙翠燕. 韶關(guān)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(12)
[2]抗生素耐藥性研究進(jìn)展[J]. 陸繼爽,李波,單春喬,馮柳柳,王業(yè)華,劉艷. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(10)
[3]小檗堿對禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]綠原酸、異綠原酸A對大腸桿菌的抑菌機(jī)制[J]. 周志娥,羅秋水,熊建華,湯凱潔. 食品科技. 2014(03)
[5]基于新一代高通量測序的環(huán)境微生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 蔡元鋒,賈仲君. 生物多樣性. 2013(04)
[6]轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)策略及其數(shù)據(jù)在分子標(biāo)記開發(fā)上的應(yīng)用[J]. 李小白,向林,羅潔,胡標(biāo)林,田勝平,謝鳴,孫崇波. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[7]養(yǎng)殖業(yè)抗生素的使用及其潛在危害[J]. 王云鵬,馬越. 中國抗生素雜志. 2008(09)
[8]金銀花中綠原酸一步提取法及綠原酸抗菌活性[J]. 屈景年,莫運(yùn)春,劉夢琴,李榮. 化學(xué)世界. 2005(03)
本文編號:3496625
【文章來源】:中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(12)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
臨床分離大腸桿菌菌株P(guān)CR擴(kuò)增結(jié)果
有向無環(huán)圖顯示GO富集條目在生物過程中指向DNA重組(圖2),在細(xì)胞組分中指向細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)(圖3),在分子功能中指向DNA結(jié)合和核苷酸結(jié)合(圖4)。圖3 差異基因細(xì)胞組分基因功能DAG圖
差異基因細(xì)胞組分基因功能DAG圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金銀花提取物對4種病原菌的體外抑菌效果研究[J]. 許欽坤,趙翠燕. 韶關(guān)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(12)
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[3]小檗堿對禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]綠原酸、異綠原酸A對大腸桿菌的抑菌機(jī)制[J]. 周志娥,羅秋水,熊建華,湯凱潔. 食品科技. 2014(03)
[5]基于新一代高通量測序的環(huán)境微生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 蔡元鋒,賈仲君. 生物多樣性. 2013(04)
[6]轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)策略及其數(shù)據(jù)在分子標(biāo)記開發(fā)上的應(yīng)用[J]. 李小白,向林,羅潔,胡標(biāo)林,田勝平,謝鳴,孫崇波. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[7]養(yǎng)殖業(yè)抗生素的使用及其潛在危害[J]. 王云鵬,馬越. 中國抗生素雜志. 2008(09)
[8]金銀花中綠原酸一步提取法及綠原酸抗菌活性[J]. 屈景年,莫運(yùn)春,劉夢琴,李榮. 化學(xué)世界. 2005(03)
本文編號:3496625
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