阿拉善戈壁駝與沙漠駝股二頭肌轉(zhuǎn)錄組學(xué)比較研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-09 06:23
經(jīng)過多年的社會生產(chǎn)實(shí)踐,大家發(fā)現(xiàn)了一個(gè)規(guī)律那就是:戈壁駝的體格和產(chǎn)肉量比沙漠駝普遍都大的多。在這個(gè)基礎(chǔ)上,本文以阿拉善戈壁駝和沙漠駝的股二頭肌為研究對象,探索兩種駱駝產(chǎn)肉量發(fā)生差異的分子機(jī)制。采用高通量轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)篩選出阿拉善戈壁駝和沙漠駝股二頭肌組織差異表達(dá)基因。利用數(shù)據(jù)庫對差異基因進(jìn)行GO功能注釋和信號通路分析。本研究的主要結(jié)果如下顯示:(1)高通量轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,阿拉善沙漠駝5個(gè)樣本得到的總Reads數(shù)分別是 47100696/63323176/5197540/49347678/61617914,其中 clean Reads 數(shù)分別是46041008/62211266/50906716/48313858/60988046,戈壁駝 5 個(gè)樣本得到的總 Reads數(shù)分別是 53658154/59330764/56583910/46423336/65432244;Clean reads 數(shù)分別是52687830/58009318/54861640/45504318/64529048,Clean reads 數(shù)占比都達(dá) 90%以上,這表明測序結(jié)果飽和度良好,測序數(shù)...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1阿拉善沙漠駝
沙漠駝股二頭肌轉(zhuǎn)錄組學(xué)的比較研究???總RNA??I????〇,BKAd^^?太除?rRNA?<?典核?Small?RNA??上m5%;)衣核?及擬核生物)??-p???v?\f???????...將狀八^機(jī)捫斷??j?3,端??5,端接頭連接???4;???用陸機(jī)引物和逆轉(zhuǎn)朵酚從RNA片段合??成cDNA片段??cDNA片段末端修仏迕接測嚇接頭?逆料錄合成cDNA片段???J;?;?;???M備測序文庫及*0序??圖3轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)流程圖??Fig.3?Flow?chart?of?transcriptome?sequencing?technology??目前,高通量測序技術(shù)有四種,分別為R〇che/454、ABI/Solid、??Helicos/HeliScope以及Illumina/Solexa測序技術(shù)。和其它3種測序技術(shù)相比,??Illumina測序技術(shù)具有以下4點(diǎn)優(yōu)勢:(1)能夠精確的識別單核苷酸的多態(tài)性和??可變剪切位點(diǎn)的編碼序列,對轉(zhuǎn)錄組信息進(jìn)行全面的分析;(2)測序成本低;(3)??在單核苷酸水平下,能檢測任何物種的轉(zhuǎn)錄活動;(4)能夠分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和??表達(dá)水平,可以找到稀有的以及以前不曾發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄本,這一點(diǎn)很重要。??1.5研究目的及意義??在我國阿拉善地區(qū),經(jīng)濟(jì)動物阿拉善雙峰駝的產(chǎn)肉率較高,并且不同地區(qū)雙??峰駝的體型及產(chǎn)肉量存在明顯差異。同一年齡段阿拉善戈壁騸駝平均體型明顯大??于沙漠騸駝,存在顯著差異(p<〇.〇5)或極顯著差異(p<0.01);同一年齡段戈壁騸駝??各項(xiàng)屠宰指標(biāo)相較于沙漠騸駝均體現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(活重比沙漠騸駝重約
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?5??1.6技術(shù)路線??昶序饑識準(zhǔn)備?實(shí)時(shí)災(zāi)光定軟PCR??1?兒?■丨?枰品準(zhǔn)拓??RNA拗娶樣姑??JT???文坪????的逑_?>:?設(shè)iWJ丨物???及??及??時(shí)泌m測吖??2????TT?1?劣時(shí)炎光達(dá)tftPCR??測序結(jié)采分析?^??^?,? ̄付珙尥勢分折 ̄??料泌特征分析????JI??幾??i;"m枰沙說駝和戈明駝產(chǎn)肉性能效時(shí)?分析??圖4技術(shù)路線圖??Fig.4?The?technology?road?map??
本文編號:3484794
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1阿拉善沙漠駝
沙漠駝股二頭肌轉(zhuǎn)錄組學(xué)的比較研究???總RNA??I????〇,BKAd^^?太除?rRNA?<?典核?Small?RNA??上m5%;)衣核?及擬核生物)??-p???v?\f???????...將狀八^機(jī)捫斷??j?3,端??5,端接頭連接???4;???用陸機(jī)引物和逆轉(zhuǎn)朵酚從RNA片段合??成cDNA片段??cDNA片段末端修仏迕接測嚇接頭?逆料錄合成cDNA片段???J;?;?;???M備測序文庫及*0序??圖3轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)流程圖??Fig.3?Flow?chart?of?transcriptome?sequencing?technology??目前,高通量測序技術(shù)有四種,分別為R〇che/454、ABI/Solid、??Helicos/HeliScope以及Illumina/Solexa測序技術(shù)。和其它3種測序技術(shù)相比,??Illumina測序技術(shù)具有以下4點(diǎn)優(yōu)勢:(1)能夠精確的識別單核苷酸的多態(tài)性和??可變剪切位點(diǎn)的編碼序列,對轉(zhuǎn)錄組信息進(jìn)行全面的分析;(2)測序成本低;(3)??在單核苷酸水平下,能檢測任何物種的轉(zhuǎn)錄活動;(4)能夠分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和??表達(dá)水平,可以找到稀有的以及以前不曾發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄本,這一點(diǎn)很重要。??1.5研究目的及意義??在我國阿拉善地區(qū),經(jīng)濟(jì)動物阿拉善雙峰駝的產(chǎn)肉率較高,并且不同地區(qū)雙??峰駝的體型及產(chǎn)肉量存在明顯差異。同一年齡段阿拉善戈壁騸駝平均體型明顯大??于沙漠騸駝,存在顯著差異(p<〇.〇5)或極顯著差異(p<0.01);同一年齡段戈壁騸駝??各項(xiàng)屠宰指標(biāo)相較于沙漠騸駝均體現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(活重比沙漠騸駝重約
?內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文?5??1.6技術(shù)路線??昶序饑識準(zhǔn)備?實(shí)時(shí)災(zāi)光定軟PCR??1?兒?■丨?枰品準(zhǔn)拓??RNA拗娶樣姑??JT???文坪????的逑_?>:?設(shè)iWJ丨物???及??及??時(shí)泌m測吖??2????TT?1?劣時(shí)炎光達(dá)tftPCR??測序結(jié)采分析?^??^?,? ̄付珙尥勢分折 ̄??料泌特征分析????JI??幾??i;"m枰沙說駝和戈明駝產(chǎn)肉性能效時(shí)?分析??圖4技術(shù)路線圖??Fig.4?The?technology?road?map??
本文編號:3484794
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3484794.html
最近更新
教材專著