發(fā)布時間：2021-10-20 19:07

　　為了豐富山羊內(nèi)源性鼻內(nèi)腫瘤病毒（enENTV）全基因組序列資源,本研究從1份患羊地方性鼻內(nèi)腫瘤（ENT）病羊的腎臟中經(jīng)PCR擴(kuò)增了1株enENTV全基因組序列,命名為enENTV-FJ1,分別對其全基因組、5’端長末端重復(fù)序列（5’LTR）基因、gag基因、env基因及其編碼的氨基酸序列進(jìn)行同源性分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,對enENTV的5’LTR進(jìn)行酶切位點(diǎn)分析,并分析該株病毒的gag、env序列與enENTV、山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒（ENTV-2）、綿羊鼻內(nèi)腫瘤病毒1型（ENTV-1）等相關(guān)病毒參考株相應(yīng)序列的差異性。結(jié)果顯示,enENTV-FJ1基因組結(jié)構(gòu)為LTR-gag-pro-pol-env-LTR,長度為7 923 bp;全基因組同源性分析結(jié)果顯示,enENTV-FJ1株與enENTVCHN1～enENTV-CHN6 6個參考株的同源性為95.7%～97.3%,同源性最近;與ENTV-2參考株的同源性為87.0%～93.2%;enENTV-FJ1的5’LTR基因序列、gag基因及其編碼的氨基酸序列與enENTV參考株相應(yīng)序列的同源性分別為92.8%～99.1%、92.6%～97... 

【文章來源】：中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

基于全基因組序列構(gòu)建的en ENTV-FJ1株系統(tǒng)進(jìn)化樹

以患ENT病羊的腎臟提取的DNA為模板，采用en ENTV分段擴(kuò)增引物經(jīng)RT-PCR方法擴(kuò)增病毒全基因組的4個片段。結(jié)果顯示，擴(kuò)增出與預(yù)期大小相符的4個片斷目的條帶（圖1）。測序結(jié)果顯示，各目的基因片段分別為2 267 bp、2 137 bp、2 461 bp、1 806 bp。表明，正確擴(kuò)增了en ENTV-FJ1株全基因組各基因片段。2.2 en ENTV-FJ1株全基因組序列同源性及進(jìn)化關(guān)系分析結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒重慶株基因組序列分析[J]. 沈克飛,唐達(dá),楊柳,徐登峰,許國洋,付利芝,張素輝.  中國生物制品學(xué)雜志. 2019(08)
[2]山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒Shaanxi株前病毒全基因組克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 何亞鵬,付明哲,許信剛,龐文靜,王景,周曼,張琪.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(01)
[3]山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒ENTV-SC株基因組cDNA文庫的構(gòu)建及生物信息學(xué)分析[J]. 馮迎春,顏其貴,郭萬柱,王小玉,舒蕾.  中國獸醫(yī)科學(xué). 2011(02)
[4]山羊地方性鼻內(nèi)腺瘤病毒和內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒gag變異區(qū)的克隆與分析[J]. 王小玉,馮迎春,顏其貴,張國俊,陳瑜,韓國全,任玉鵬,郭萬柱.  動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2011(01)

博士論文
[1]ENTV和enENTV全基因組分析及ENA組織miRNA差異表達(dá)分析[D]. 王彬.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號：3447443