本試驗(yàn)選用SLA復(fù)合體區(qū)域17個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),探究了豬地方群體遺傳多態(tài)性,包括萊蕪豬、藍(lán)塘豬、小梅山豬、寧鄉(xiāng)豬、淮南豬、圩豬和陸川豬7個(gè)品種；并篩選了12對(duì)微衛(wèi)星引物對(duì)杜洛克×二花臉F2資源群體進(jìn)行了多態(tài)性檢測(cè),且與80天血液免疫指標(biāo)做的關(guān)聯(lián)分析,通過(guò)計(jì)算等位基因數(shù)、遺傳雜合度和多態(tài)信息含量等指標(biāo)來(lái)衡量群體內(nèi)SLA的遺傳多態(tài)性,并運(yùn)用遺傳的距離和群體的結(jié)構(gòu)等分析了群體間的遺傳變異,利用R語(yǔ)言GLM模型與免疫指標(biāo)做了關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果如下：1.共檢測(cè)了7個(gè)地方豬品種SLA復(fù)合體內(nèi)17個(gè)微衛(wèi)星座位一共228個(gè)個(gè)體的遺傳多樣性。在總體群中總計(jì)檢測(cè)到了73個(gè)等位基因,7個(gè)地方品種所有座位平均10.18個(gè)等位基因,7個(gè)地方品種每個(gè)座位平均4.82個(gè)。2.發(fā)現(xiàn)了萊蕪豬中SLAMS034、SLAMS045和SLAMS056三個(gè)座位多態(tài)性較低,小梅山豬中SLAMS016、SLAMS034和SLAMS035多態(tài)性較低,寧鄉(xiāng)豬中SLAMS056多態(tài)性較低,淮南豬中SLAMS052和SLAMS098兩個(gè)座位多態(tài)性較低以及圩豬中SLAMS056多態(tài)性較低,其余座位均表現(xiàn)較好的多態(tài)性。從7個(gè)群體水平總體來(lái)看,觀測(cè)雜合... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 研究問(wèn)題的由來(lái)
    1.2 SLA復(fù)合體基本概況
    1.3 微衛(wèi)星DNA簡(jiǎn)介及其突變機(jī)制
    1.4 家畜遺傳多樣性的評(píng)估方法
    1.5 SLA復(fù)合體多樣性的研究概況與進(jìn)展
    1.6 SLA復(fù)合體與免疫性狀的關(guān)聯(lián)
        1.6.1 SLA與疾病抗性和免疫性狀的關(guān)系
        1.6.2 SLA復(fù)合體在免疫抗病與育種中的應(yīng)用
    1.7 本研究的目的與意義
2 試驗(yàn)材料與方法
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及免疫指標(biāo)
        2.1.2 主要儀器設(shè)備
        2.1.3 主要試驗(yàn)試劑
        2.1.4 微衛(wèi)星引物
        2.1.5 主要分子生物學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫(kù)
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 本研究的技術(shù)路線
        2.2.2 DNA提取
        2.2.3 PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)條件
        2.2.4 主要的數(shù)學(xué)指標(biāo)
3 結(jié)果
    3.1 PCR產(chǎn)物及峰形圖
        3.1.1 PCR擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測(cè)
        3.1.2 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳銀染檢測(cè)
        3.1.3 ABI3730測(cè)序檢測(cè)
    3.2 十七個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性分析
        3.2.1 檢測(cè)等位基因數(shù)
        3.2.2 品種內(nèi)SLA復(fù)合體微衛(wèi)星多態(tài)性
    3.3 七個(gè)地方品種豬遺傳多態(tài)性比較及資源群體遺傳多樣性
        3.3.1 固定指數(shù)
        3.3.2 地方豬群體聚類分析及群體結(jié)構(gòu)和遺傳混合分析
            3.3.2.1 地方豬群體聚類分析
            3.3.2.2 群體結(jié)構(gòu)和遺傳混合分析
        3.3.3 F2資源群體SLA復(fù)合體微衛(wèi)星多態(tài)性
    3.4 SLA復(fù)合體微衛(wèi)星與免疫性狀的關(guān)聯(lián)分析
4 討論
    4.1 關(guān)于微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)方法的選擇的討論
    4.2 關(guān)于微衛(wèi)星標(biāo)記缺陷引起的問(wèn)題以及引入第三條熒光前綴引物檢測(cè)技術(shù)的討論
    4.3 群體內(nèi)遺傳多樣性的討論
    4.4 群體間的遺傳變異的討論
        4.4.1 群體分化系數(shù)
        4.4.2 群體間遺傳距離的群體間聚類
        4.4.3 群體結(jié)構(gòu)分析
    4.5 雜交家系資源群體多態(tài)性及與免疫性狀關(guān)聯(lián)的討論
5 小結(jié)
    5.1 本研究所獲得的成果
    5.2 本研究的創(chuàng)新點(diǎn)
    5.3 下一步值得研究的問(wèn)題
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3420825