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布魯氏菌019株組學特征解析

發(fā)布時間:2021-10-05 06:48
  目的:布病是一種嚴重的人畜共患傳染病。新疆是我國的畜牧業(yè)大省,也是布病的主要疫區(qū)之一。上世紀80年代初期,新疆天山南北多個種羊場、養(yǎng)殖基地等單位爆發(fā)了綿羊傳染性附睪炎。隨后,從患附睪炎的種公羊精液中分離獲得布魯氏菌,經(jīng)生化鑒定,初步確定為綿羊種布魯氏菌,命名為布魯氏菌019株。但是,研究發(fā)現(xiàn),布魯氏菌019株可以感染恒河猴,在宿主上與綿羊種布魯氏菌存在差異;雖然其LPS呈粗糙型,但是脲酶呈陽性,在表型上與綿羊種布魯氏菌存在差異;并且該菌株的外膜蛋白等基因與綿羊種布魯氏菌存在差異,在分子特征上與綿羊種布魯氏菌也存在差異。然而,該菌株的死菌佐劑苗可以引發(fā)綿羊良好的細胞免疫和體液免疫,為綿羊抵御布病提供良好的保護力。為了解答布魯氏菌019株研究中產(chǎn)生的困惑,我們采用基因組和蛋白質(zhì)組等手段解析布魯氏菌019株的特征。方法:在基因組水平,我們采用Illumina hiseq2000對布魯氏菌019株進行了全基因組測序,利用SOAP1.05對測序數(shù)據(jù)進行組裝,使用Glimmer3.02預測ORF,使用Nr數(shù)據(jù)庫注釋ORF等,組裝結(jié)果與15個布魯氏菌基因組進行SNPs比較分析,與多個布魯氏菌基因組進... 

【文章來源】:石河子大學新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】:124 頁

【學位級別】:博士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
主要縮略詞
引言
第一章 文獻綜述
    0. 布魯氏菌組學研究進展
    1. 布病的流行
    2. 布魯氏菌基因組
    3. 布魯氏菌蛋白質(zhì)組
    4. 布魯氏菌的功能基因研究
第二章 實驗研究
    實驗一 布魯氏菌 019 株基因組測序以及多基因組比較分析
        摘要
        1 材料與方法
        2 結(jié)果
        3 討論
        4 小結(jié)
    實驗二 布魯氏菌 019 株特征的定量蛋白質(zhì)組學解析
        摘要
        1 材料和方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
        4 小結(jié)
    實驗三 比較蛋白質(zhì)組分析布魯氏菌 019 株的毒力相關(guān)基因
        摘要
        1 材料與方法
        2 結(jié)果
        3 討論
        4 小結(jié)
    實驗四 布魯氏菌 TetR 家族轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因和組氨酸感應激酶功能的初步研究
        摘要
        1 材料與方法
        2 實驗結(jié)果
        3 討論
        4 小結(jié)
第三章 結(jié)論與創(chuàng)新點
    1. 主要結(jié)論
    2. 主要創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
作者簡介及參與的研究項目、發(fā)表的文章
附件


【參考文獻】:
期刊論文
[1]TetR家族調(diào)控鏈霉菌次級代謝的機制[J]. 韓曉偉,沈月毛.  微生物學通報. 2013(10)
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博士論文
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[1]大腸桿菌EF-Tu多蛋白復合物誘導THP-1細胞免疫應答的研究[D]. 孟憲邑.廈門大學 2008
[2]大腸桿菌EF-Tu多蛋白復合體的研究[D]. 肖昆.廈門大學 2007
[3]新疆綿羊種布魯氏菌(80/019)omp2b基因的克隆及原核表達[D]. 滕文軍.石河子大學 2005



本文編號:3419212

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