山豬Myf5基因SNPs篩查及SNPs組合對三種肉質(zhì)性狀的影響
發(fā)布時間:2021-09-19 01:32
豬肉作為當(dāng)今世界人們生活最主要的肉制品來源,其肉質(zhì)品質(zhì)及肉質(zhì)安全問題越來越受人們的重視。我國是世界上第一豬肉生產(chǎn)國與消費(fèi)國,豬肉產(chǎn)量和消費(fèi)量占世界總產(chǎn)量和總消費(fèi)量的一半左右,人們的飯桌上幾乎離不開豬肉。而豬肉的肉質(zhì)性狀是由多基因控制的復(fù)雜的復(fù)合性狀,受到多種肉質(zhì)基因的共同影響,而單個基因的影響又是通過其堿基序列的突變而產(chǎn)生的。Myf5是生肌調(diào)節(jié)因子家族(MRFs)的成員之一,控制早期肌肉的分化,是影響肉質(zhì)的候選基因之一。早期對Myf5的多態(tài)性的研究多為研究基因部分片段的部分SNPs與肉質(zhì)的相關(guān)性,卻很少有擴(kuò)增Myf5基因全長,研究所有SNPs及其組成的單倍型對肉質(zhì)的影響,并且在山豬這個特殊的地方豬種中更沒有系統(tǒng)的分析研究。本研究對不同山豬血統(tǒng)的豬種的部分肉質(zhì)性狀進(jìn)行檢測,并在之前Myf5基因研究的基礎(chǔ)上,利用PCR-SSCP擴(kuò)增Myf5全部的外顯子片段,找出Myf5基因編碼序列上所有的突變位點(diǎn),對Myf5的全部外顯子進(jìn)行多態(tài)性分析,并利用SPSS statistics16.0分析單個SNP及SNPs組成的單倍型對部分肉質(zhì)性狀的影響,同時采用熒光定量PCR檢測不同樣本背最長肌的Myf5基...
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 豬肉質(zhì)研究現(xiàn)狀
1.1.1 用于豬肉質(zhì)研究的豬品種資源
1.1.2 山豬品種資源狀況
1.1.3 中國地方豬品種遺傳多樣性研究
1.1.4 山豬的遺傳結(jié)構(gòu)研究
1.2 豬肉質(zhì)的評定及影響因素
1.2.1 豬肉質(zhì)的評定
1.2.2 肌肉組織學(xué)特性對肉質(zhì)的影響
1.2.3 肉質(zhì)相關(guān)基因?qū)θ赓|(zhì)的影響
1.3 MRFs研究現(xiàn)狀
1.3.1 MRF簡介
1.3.2 Myf5研究現(xiàn)狀
1.3.3 Myf5對肌肉分化的作用
1.3.4 Myf5作為影響生長性能的肉質(zhì)性狀候選基因的研究
1.4 分子遺傳標(biāo)記在動物遺傳育種中的應(yīng)用
1.4.1 分子遺傳標(biāo)記簡介
1.4.2 SNPs簡介
1.4.3 PCR-SSCP原理及應(yīng)用
第二章 Myf5基因多態(tài)性對三種肉質(zhì)性狀的影響研究
2.1 材料、儀器與試劑
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的采集與保存
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)藥品、酶和試劑盒
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 豬血液基因組DNA提取
2.2.2 豬組織基因組DNA提取
2.2.3 DNA質(zhì)量檢測
2.2.3.1 DNA紫外分光光度計檢測
2.2.3.2 DNA瓊脂糖電泳檢測
2.2.4 PCR-SSCP檢測與測序
2.2.4.1 PCR引物設(shè)計與反應(yīng)條件
2.2.4.2 PCR產(chǎn)物檢測
2.2.4.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳
2.2.4.4 測序
2.2.5 胴體重及部分肉質(zhì)性狀測定
2.2.6 數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 豬血液和組織DNA濃度和質(zhì)量的檢測
2.3.2 PCR-SSCP檢測結(jié)果和序列的比較分析
2.3.2.1 外顯子1測序結(jié)果
2.3.2.2 突變點(diǎn)1和2組成單倍型SSCP檢測
2.3.2.3 外顯子2 SSCP檢測
2.3.2.4 外顯子3 SSCP檢測
2.3.3 Myf5基因多態(tài)性分析
2.3.4 胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)比較、
2.3.4.1 不同性別豬胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)比較
2.3.4.2 不同豬種部分肉質(zhì)比較
2.3.4.3 不同山豬血統(tǒng)的山豬杜洛克雜交豬胴體肉質(zhì)比較
2.3.5 Myf5基因多態(tài)性對部分肉質(zhì)性狀的影響
2.3.5.1 Myf5基因SNPs對胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)的影響
2.3.5.2 Myf5基因單倍型對部分肉質(zhì)性狀的影響
2.4 討論
2.4.1 江蘇山豬品種資源保護(hù)
2.4.2 SNPs的研究
2.4.3 不同豬種及不同性別豬基因多態(tài)性分析
2.4.4 基因多態(tài)性對部分肉質(zhì)性狀的影響
第三章 Myf5表達(dá)分析及其與肉質(zhì)的相關(guān)性研究
3.1 材料、儀器與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的采集與保存
3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.3 主要的實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.4 主要實(shí)驗(yàn)藥品
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 豬組織RNA的提取
3.2.1.1 總RNA的提取
3.2.1.2 RNA總濃度和質(zhì)量的檢測
3.2.2 RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA
3.2.3 實(shí)時熒光定量PCR
3.2.3.1 實(shí)時熒光定量PCR引物設(shè)計
3.2.3.2 熒光定量PCR反應(yīng)
3.2.4 胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)含量的檢測
3.2.5 數(shù)據(jù)處理和分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 RNA條帶檢測
3.3.2 熒光定量PCR產(chǎn)物特異性
3.3.3 Myf5基因熒光定量PCR分析
3.3.3.1 Myf5基因在不同豬種中的表達(dá)情況
3.3.3.2 Myf5基因多態(tài)性對表達(dá)量的影響
3.3.3.3 Myf5基因表達(dá)量與肉質(zhì)及各肉質(zhì)相關(guān)性分析
3.4 討論
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]影響豬肉質(zhì)的主效基因和候選基因[J]. 李鳳,黃業(yè)傳,吳照明. 食品工業(yè)科技. 2012(24)
[2]利用微衛(wèi)星PCR技術(shù)分析山豬的遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 伍革民,許曉風(fēng),章熙霞,霍金龍,苗永旺,霍海龍. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(01)
[3]豬MyoG基因3′端PCR-SSCP遺傳多態(tài)性及其遺傳效應(yīng)(英文)[J]. 薛慧良,周忠孝. 生態(tài)學(xué)雜志. 2007(04)
[4]山豬群體遺傳結(jié)構(gòu)的RAPD分析[J]. 伍革民,許曉風(fēng),章熙霞. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[5]山豬血清蛋白質(zhì)多態(tài)性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析研究[J]. 錢繼寧,朱善良,許曉鳳,伍革民. 江蘇教育學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2006(03)
[6]淺談中國家畜多樣性的保護(hù)[J]. 曹果清,周忠孝. 家畜生態(tài). 2001(02)
[7]新疆褐牛weaver位點(diǎn)部分序列的克隆測序及分析[J]. 單雪松,張沅,李寧. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2000(03)
[8]家豬染色體C-帶作為遺傳標(biāo)記的研究[J]. 徐銀學(xué),夏祖灼,甘杰,姜志華. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 1994(03)
[9]中國家豬高分辨G-帶及模式圖[J]. 陳文元,王子淑,王喜忠. 遺傳學(xué)報. 1991(02)
[10]銀染核仁組成區(qū)(Ag-NOR)與家豬品種的起源進(jìn)化[J]. 詹鐵生,袁志發(fā),柳萬生. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 1989(01)
本文編號:3400739
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 豬肉質(zhì)研究現(xiàn)狀
1.1.1 用于豬肉質(zhì)研究的豬品種資源
1.1.2 山豬品種資源狀況
1.1.3 中國地方豬品種遺傳多樣性研究
1.1.4 山豬的遺傳結(jié)構(gòu)研究
1.2 豬肉質(zhì)的評定及影響因素
1.2.1 豬肉質(zhì)的評定
1.2.2 肌肉組織學(xué)特性對肉質(zhì)的影響
1.2.3 肉質(zhì)相關(guān)基因?qū)θ赓|(zhì)的影響
1.3 MRFs研究現(xiàn)狀
1.3.1 MRF簡介
1.3.2 Myf5研究現(xiàn)狀
1.3.3 Myf5對肌肉分化的作用
1.3.4 Myf5作為影響生長性能的肉質(zhì)性狀候選基因的研究
1.4 分子遺傳標(biāo)記在動物遺傳育種中的應(yīng)用
1.4.1 分子遺傳標(biāo)記簡介
1.4.2 SNPs簡介
1.4.3 PCR-SSCP原理及應(yīng)用
第二章 Myf5基因多態(tài)性對三種肉質(zhì)性狀的影響研究
2.1 材料、儀器與試劑
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的采集與保存
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)藥品、酶和試劑盒
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 豬血液基因組DNA提取
2.2.2 豬組織基因組DNA提取
2.2.3 DNA質(zhì)量檢測
2.2.3.1 DNA紫外分光光度計檢測
2.2.3.2 DNA瓊脂糖電泳檢測
2.2.4 PCR-SSCP檢測與測序
2.2.4.1 PCR引物設(shè)計與反應(yīng)條件
2.2.4.2 PCR產(chǎn)物檢測
2.2.4.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳
2.2.4.4 測序
2.2.5 胴體重及部分肉質(zhì)性狀測定
2.2.6 數(shù)據(jù)處理和統(tǒng)計分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 豬血液和組織DNA濃度和質(zhì)量的檢測
2.3.2 PCR-SSCP檢測結(jié)果和序列的比較分析
2.3.2.1 外顯子1測序結(jié)果
2.3.2.2 突變點(diǎn)1和2組成單倍型SSCP檢測
2.3.2.3 外顯子2 SSCP檢測
2.3.2.4 外顯子3 SSCP檢測
2.3.3 Myf5基因多態(tài)性分析
2.3.4 胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)比較、
2.3.4.1 不同性別豬胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)比較
2.3.4.2 不同豬種部分肉質(zhì)比較
2.3.4.3 不同山豬血統(tǒng)的山豬杜洛克雜交豬胴體肉質(zhì)比較
2.3.5 Myf5基因多態(tài)性對部分肉質(zhì)性狀的影響
2.3.5.1 Myf5基因SNPs對胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)的影響
2.3.5.2 Myf5基因單倍型對部分肉質(zhì)性狀的影響
2.4 討論
2.4.1 江蘇山豬品種資源保護(hù)
2.4.2 SNPs的研究
2.4.3 不同豬種及不同性別豬基因多態(tài)性分析
2.4.4 基因多態(tài)性對部分肉質(zhì)性狀的影響
第三章 Myf5表達(dá)分析及其與肉質(zhì)的相關(guān)性研究
3.1 材料、儀器與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的采集與保存
3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.3 主要的實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.4 主要實(shí)驗(yàn)藥品
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 豬組織RNA的提取
3.2.1.1 總RNA的提取
3.2.1.2 RNA總濃度和質(zhì)量的檢測
3.2.2 RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA
3.2.3 實(shí)時熒光定量PCR
3.2.3.1 實(shí)時熒光定量PCR引物設(shè)計
3.2.3.2 熒光定量PCR反應(yīng)
3.2.4 胴體重、剪切力及蛋白質(zhì)含量的檢測
3.2.5 數(shù)據(jù)處理和分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 RNA條帶檢測
3.3.2 熒光定量PCR產(chǎn)物特異性
3.3.3 Myf5基因熒光定量PCR分析
3.3.3.1 Myf5基因在不同豬種中的表達(dá)情況
3.3.3.2 Myf5基因多態(tài)性對表達(dá)量的影響
3.3.3.3 Myf5基因表達(dá)量與肉質(zhì)及各肉質(zhì)相關(guān)性分析
3.4 討論
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]影響豬肉質(zhì)的主效基因和候選基因[J]. 李鳳,黃業(yè)傳,吳照明. 食品工業(yè)科技. 2012(24)
[2]利用微衛(wèi)星PCR技術(shù)分析山豬的遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 伍革民,許曉風(fēng),章熙霞,霍金龍,苗永旺,霍海龍. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2008(01)
[3]豬MyoG基因3′端PCR-SSCP遺傳多態(tài)性及其遺傳效應(yīng)(英文)[J]. 薛慧良,周忠孝. 生態(tài)學(xué)雜志. 2007(04)
[4]山豬群體遺傳結(jié)構(gòu)的RAPD分析[J]. 伍革民,許曉風(fēng),章熙霞. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[5]山豬血清蛋白質(zhì)多態(tài)性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析研究[J]. 錢繼寧,朱善良,許曉鳳,伍革民. 江蘇教育學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2006(03)
[6]淺談中國家畜多樣性的保護(hù)[J]. 曹果清,周忠孝. 家畜生態(tài). 2001(02)
[7]新疆褐牛weaver位點(diǎn)部分序列的克隆測序及分析[J]. 單雪松,張沅,李寧. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2000(03)
[8]家豬染色體C-帶作為遺傳標(biāo)記的研究[J]. 徐銀學(xué),夏祖灼,甘杰,姜志華. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 1994(03)
[9]中國家豬高分辨G-帶及模式圖[J]. 陳文元,王子淑,王喜忠. 遺傳學(xué)報. 1991(02)
[10]銀染核仁組成區(qū)(Ag-NOR)與家豬品種的起源進(jìn)化[J]. 詹鐵生,袁志發(fā),柳萬生. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 1989(01)
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