DNA甲基化是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下，將S-硫代腺苷甲硫氨酸中的甲基基團(tuán)轉(zhuǎn)移到胞嘧啶的第五個(gè)碳原子上，使DNA分子中堿基結(jié)合甲基的過(guò)程。DNA甲基化在基因表達(dá)、X染色體的失活、遺傳印記、細(xì)胞分化、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)維持、胚胎發(fā)育、癌癥的發(fā)生和胚胎發(fā)育中扮演著重要角色。DNA甲基化作為一種重要的表觀遺傳修飾，其功能主要是通過(guò)基因表達(dá)抑制來(lái)實(shí)現(xiàn)。顯著的甲基化水平差異已經(jīng)在不同組織中發(fā)現(xiàn)，并且在相同組織具有不同的功能。很多研究表明不同的甲基化水平可能與組織特異性轉(zhuǎn)錄和某些性狀有關(guān)，并且對(duì)正常的分化和發(fā)育以及一些性狀起到至關(guān)重要的作用。肉質(zhì)性狀是個(gè)復(fù)雜的性狀，由多基因控制，因此控制肉質(zhì)性狀基因的甲基化水平的改變必然影響其表達(dá)，進(jìn)而對(duì)肉質(zhì)性狀產(chǎn)生效應(yīng)。DNA甲基化水平受到品種、性別、年齡、環(huán)境、飼養(yǎng)管理水平等諸多因素的影響，并且在時(shí)間和空間上存在差異表達(dá)。本研究采用熒光標(biāo)記的甲基化敏感性擴(kuò)增多態(tài)性技術(shù)對(duì)汶上蘆花雞9種組織基因組DNA甲基化水平進(jìn)行了檢測(cè)，共計(jì)檢測(cè)到19,795個(gè)片段，其中非甲基化片段8,935個(gè)；半甲基化片段5,668個(gè)，全甲基化片段5,192個(gè)。半甲基化比率胸肌顯著高于其他組織（P... 

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【部分圖文】：

DNA甲基化示意圖

DNA發(fā)生去甲基化，而另外50%的DNA處于半甲基化狀態(tài)。有研究表MBD2具有去甲基的能力，認(rèn)為MBD2就是一種去甲基化酶[19-21]。動(dòng)去甲基化存在機(jī)制的可能有以下五種：（1）核苷酸外切修復(fù)機(jī)制G二核苷酸。（2）脫氨酶參與的堿基切除修復(fù)：5-mC脫氨變成胸腺入堿基切除修復(fù)途徑。（3）DNA轉(zhuǎn)葡糖基酶參與的堿基切除修復(fù)：直接去除。（4）水解去甲基化：水解胞嘧啶的甲基基團(tuán)，使其以甲醇化去甲基化：發(fā)生氧化反應(yīng)打開(kāi)碳-碳鍵，直接去除甲基基團(tuán)[22]。 甲基化轉(zhuǎn)移酶的分類(lèi)能和序列的同源性，真核生物DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶又分為4類(lèi)：維持DT1或維持甲基化酶）、甲基化轉(zhuǎn)移酶2（DNMT2）、從頭甲基化酶（甲基化轉(zhuǎn)移酶的家族成員結(jié)構(gòu)如圖2所示。

對(duì)照組用 Cy3 標(biāo)記），然后與芯片雜交。芯片上每個(gè)探針的Cy5/Cy3 強(qiáng)度比例顯示出該區(qū)域的甲基化程度。其原理和具體過(guò)程如圖 3 所示。圖3 免疫共沉淀分析基因組整體水平甲基化的原理和具體過(guò)程示意圖3.1.6 基于二代測(cè)序平臺(tái)的全基因組甲基化分析新一代測(cè)序儀的飛速發(fā)展使得全基因組甲基化測(cè)序的研究成為可能。近年來(lái)利用高通量測(cè)序相結(jié)合，繪制出了甲基化圖譜。全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序（whole genome bisulfite sequencing）又稱(chēng)為“金標(biāo)準(zhǔn)”BS-seq 測(cè)序，它是基于二代測(cè)序平臺(tái)的全基因組甲基化分析。其原理是首先用重亞硫酸鹽對(duì)基因組 DNA 進(jìn)行處理，將未發(fā)生甲基化的C 堿基轉(zhuǎn)換成 U，進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增后變成 T，與原本具有甲基化修飾的 C 堿基區(qū)分開(kāi)來(lái)，再結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)，特別適用于繪制單堿基分辨率的全基因組 DNA 甲基化圖譜。全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序成本比較高，而其中的甲基化 DNA 免疫共沉淀測(cè)序（MeDIP-seq）和簡(jiǎn)化的表觀亞硫酸?

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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