為了闡明大熊貓陰道微生物組成,為合理的進(jìn)行大熊貓陰道感染治療提供科學(xué)依據(jù),本研究利用宏基因組測序技術(shù)對不同地區(qū)（組別:WLQ、BFX、DJY）和不同年齡（組別:A1、A2、A3）的14個大熊貓陰道分泌物樣品進(jìn)行微生物菌群分析.結(jié)果表明:在物種注釋上,占主導(dǎo)地位的微生物為變形菌門、擔(dān)子菌門、厚壁菌門和放線菌門;在功能注釋上,注釋為碳水化合物代謝、氨基酸代謝的基因是樣品中含有微生物數(shù)量最多的功能基因;在抗性基因注釋上,變形菌門比厚壁菌門和擬桿菌門更易攜帶耐藥基因,且沙門氏菌耐藥基因APH3-lb分布存在于所有樣品中.此外,不同年齡組大熊貓陰道菌群差異顯著;DJY組衣原體比例最高.耐藥基因APH3-lb和衣原體對大熊貓繁育存在一定的威脅,需要持續(xù)關(guān)注. 

【文章來源】：四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,57(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

在屬水平上基于 Bray-Curtis 距離的聚類樹

在基因功能水平上基于Bray-Curtis距離的聚類樹

為研究地區(qū)組和年齡組中功能組成的相似度,在KEGG水平上對功能豐度值進(jìn)行了PCA分析.如圖3所示,在地區(qū)組中,WLQ組和DJY組的功能具有一定的相似性,BFX組則與WLQ組和DJY組存在一定的差異性.在年齡組中,A1組中的樣品在功能上存在一定的相似性,而A2組和A3組中的樣品功能差異較明顯.總的來說,盡管個體間差異較明顯,但每一個組都表現(xiàn)為獨立的分布.圖4 抗性基因物種歸屬分析圈圖和抗性機(jī)制與物種Overview圈圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于高通量測序?qū)λ拇☉堰h(yuǎn)特色發(fā)酵食品微生物群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 劉筱雪,袁文娟,丁濤,熊粟栗,張杰,白林含.  四川大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(03)
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博士論文
[1]基于宏基因組序列的黑熊腸道微生物組的應(yīng)用基礎(chǔ)研究[D]. 宋璨.重慶大學(xué) 2017



本文編號：3393928