[目的]了解槐豬和杜洛克豬背部皮下脂肪組織脂肪沉積的分子機(jī)制差異。[方法]對(duì)槐豬和杜洛克豬背部皮下脂肪組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。[結(jié)果]槐豬和杜洛克豬分別獲得37 858 968和37 545 394條干凈讀段（clean reads）�；必i和杜洛克豬分別預(yù)測到9 612和9 457可變剪接事件;兩豬種間共有709個(gè)差異表達(dá)基因,與杜洛克豬相比,槐豬有395個(gè)上調(diào)基因和314個(gè)下調(diào)基因。差異表達(dá)基因共歸類到46個(gè)GO條目中,其中細(xì)胞組分11個(gè)、分子功能12個(gè)及生物學(xué)過程23個(gè);顯著富集的KEGG通路共計(jì)9個(gè),其中含有與調(diào)節(jié)脂類代謝顯著相關(guān)通路,如胰島素信號(hào)通路和PPAR信號(hào)通路等。[結(jié)論]該研究可為今后研究脂肪沉積的遺傳機(jī)理提供科學(xué)依據(jù)。 

【文章來源】：安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(24)

【文章頁數(shù)】：3 頁

【部分圖文】：

可變剪切事件統(tǒng)計(jì)

該研究對(duì)槐豬和杜洛克豬背部皮下脂肪組織之間的差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能分類和KEGG通路分析,有助于進(jìn)一步了解差異表達(dá)基因的功能及基因產(chǎn)物在細(xì)胞代謝過程中的作用。KEGG通路反映蛋白質(zhì)之間的互相作用關(guān)系,參與代謝通路的蛋白的表達(dá)量或者酶的活性改變都可以引起通路調(diào)節(jié)出現(xiàn)差異。該研究顯著富集的通路中,發(fā)現(xiàn)一些與調(diào)節(jié)脂類代謝顯著相關(guān)通路,如胰島素信號(hào)通路和PPAR信號(hào)通路等,為進(jìn)一步研究脂肪沉積的分子機(jī)制提供了一定的參考,后期將結(jié)合蛋白質(zhì)功能試驗(yàn)(如基因敲除、轉(zhuǎn)基因和RNA干擾等)進(jìn)一步證實(shí)。表2 差異表達(dá)基因顯著富集的9個(gè)通路Table 2 Enriched 9 pathways of DEGs 通路名稱Pathway name 通路中有注釋的差異表達(dá)基因數(shù)目Number of DEGs annotated in the pathway Q值 Q value 通路ID號(hào)ID number of pathways 補(bǔ)體系統(tǒng)Complement and coagulation cascades 32 0.00E+00 ko04610 藥物代謝-細(xì)胞色素P450 Drug metabolism-cytochrome P450 21 3.40E-11 ko00982 視黃醇代謝Retinol metabolism 20 1.39E-10 ko00830 異生素細(xì)胞色素P450新陳代謝通路Metabolism of xenobiotics by cytochrome P450 17 5.88E-08 ko00980 PPAR信號(hào)通路 PPAR signaling pathway 12 8.10E-05 ko03320 甾類激素的生物合成Steroid hormone biosynthesis 22 2.38E-04 ko00140 胰島素信號(hào)通路Insulin signaling pathway 11 3.02E-04 ko04910 淀粉和蔗糖代謝Starch and sucrose metabolism 13 4.33E-04 ko00500 糖酵解/糖異生Glycolysis / Gluconeogenesis 12 2.14E-03 ko00010

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]北京油雞和來航雞脾臟差異表達(dá)基因的篩選與分析[J]. 耿立英,鞏元芳,劉錚鑄,張健,朱文進(jìn),趙書雨,張傳生,李祥龍.  中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(05)

碩士論文
[1]楊樹潰瘍病發(fā)生的水分生理效應(yīng)及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 劉文鑫.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]紋枯病菌對(duì)寄主侵染的選擇性機(jī)制初步研究[D]. 費(fèi)冰虹.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3359319