【目的】明確產(chǎn)蛋雞源傳染性支氣管炎病毒（IBV）分離株（GX-YL170808）的結(jié)構(gòu)基因及抗原變異情況,為廣西種雞場的傳染性支氣管炎（IB）防控提供科學(xué)依據(jù)。【方法】通過雞胚尿囊液血凝試驗、雞胚侏儒化試驗及3’端非編碼區(qū)（3’-UTR）測序?qū)Ψ蛛x株進行鑒定;采用RT-PCR擴增S1、E、M和N基因,以MegAlign和MEGA 6.0分別進行核苷酸序列相似性及系統(tǒng)發(fā)育進化樹分析,運用RDP4和SimPlot對S1、E、M和N基因進行重組分析,利用NetNGlyc 1.0和NetOGlyc 4.0進行糖基化位點預(yù)測分析,并通過中和試驗進行血清型鑒定�！窘Y(jié)果】分離株的雞胚尿囊液血凝試驗呈陰性,雞胚盲傳5代后出現(xiàn)侏儒胚典型病變,其3’-UTR序列與IBV的3’-UTR序列相似性為99.13%;綜合病雞臨床癥狀及其病理變化可確定該病毒為IBV,命名為GX-YL170808。GX-YL170808分離株S1、E、M和N基因的開放閱讀框（ORF）長度分別為1620、327、675和1230 bp,對應(yīng)編碼540、109、225和410個氨基酸殘基,與參考株的核苷酸序列相似性分別為60.4%～96... 

【文章來源】：南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2020,51(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

GX-YL170808分離株3"-UTR序列的RT-PCR鑒定結(jié)果

GX-YL170808分離株S1、E、M和N基因擴增電泳結(jié)果

為進一步了解GX-YL170808分離株的流行病學(xué)特征，本研究對其4個結(jié)構(gòu)基因（S1、E、M和N）進行擴增及重組分析。由于正股RNA病毒依賴的RNA聚合酶缺乏校正功能，導(dǎo)致IBV極易發(fā)生重組（周海生等，2017）。雖然本研究的基因重組分析結(jié)果表明4個結(jié)構(gòu)基因內(nèi)部均無重組區(qū)域，但系統(tǒng)發(fā)育進化樹顯示其S1、M和N基因?qū)貺X4型，而E基因?qū)貺DT3型。已有研究表明，基因重組可廣泛發(fā)生在IBV基因組的非結(jié)構(gòu)基因等位置（Thor et al.,2011），故不排除GX-YL170808分離株為重組株，且其重組斷點在S1、E、M和N基因之外的可能性。因此，下一步需對該分離株進行全基因組測序分析。圖5 GX-YL170808分離株S1、E、M和N蛋白糖基化位點預(yù)測分析結(jié)果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]2009-2017年廣西地區(qū)雞傳染性支氣管炎流行病學(xué)調(diào)查[J]. 董志華,范文勝,趙長潤,張文,陳基明,韋天超,磨美蘭,韋平.  中國獸醫(yī)學(xué)報. 2019(09)
[2]3株傳染性支氣管炎病毒蛋雞源河南株的S1基因序列分析[J]. 吳倩倩,許鑫,陳欽璽,闞云超,姚倫廣,王新衛(wèi),冀君.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(06)
[3]基于中國知網(wǎng)數(shù)據(jù)的雞傳染性支氣管炎病毒混合感染分析[J]. 李智超,孟春春,栗永華,車路平,仇旭升,孫英杰,譚磊,廖瑛,宋翠萍,姚剛,王金泉,丁鏟.  中國動物傳染病學(xué)報. 2018(05)
[4]我國2002-2016年間雞傳染性支氣管炎病毒基因組序列重組分析[J]. 周海生,張美紅,田雪,武奇,邵紅霞,錢琨,葉建強,秦愛建.  微生物學(xué)通報. 2017(12)
[5]桔百顆粒(樂康寧)對雛雞感染雞傳染性支氣管炎的防治效果[J]. 何怡寧,李仲林,唐寧,王海勇,曹艷杰,范文勝,朱雷,吳陽開,韋平,韋天超,磨美蘭.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2016(09)
[6]2012～2013年雞傳染性支氣管炎病毒廣西分離株S1基因序列分析與血清型鑒定[J]. 張麗華,吳翠蘭,張志鵬,何怡寧,李和鳴,秦麗莉,韋天超,磨美蘭,韋平.  病毒學(xué)報. 2016(01)

博士論文
[1]2001～2016年間華東地區(qū)IBV分子流行病學(xué)、致病性及S1蛋白的天然免疫應(yīng)答研究[D]. 周海生.揚州大學(xué) 2017

碩士論文
[1]2015-2017年廣西雞傳染性支氣管炎病毒分離株結(jié)構(gòu)基因序列分析與血清型鑒定[D]. 唐寧.廣西大學(xué) 2018



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