安格斯牛生長(zhǎng)性狀相關(guān)基因多態(tài)性及關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-10 04:08
生長(zhǎng)激素受體基因(GHR)、解耦聯(lián)蛋白家族基因(UCPs)、FBXO32基因和細(xì)胞周期蛋白基因(Wnt8a)在維持動(dòng)物正常生理生化機(jī)理的平衡和生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。為了驗(yàn)證5個(gè)基因的8個(gè)SNPs是否影響寧夏地區(qū)安格斯牛的生長(zhǎng)性狀。本研究以寧夏地區(qū)5個(gè)牛場(chǎng)1126頭20月齡左右的安格斯牛為研究對(duì)象,利用Sequenom SNP實(shí)驗(yàn)技術(shù)對(duì)GHR、UCP2、UCP3、FBX032和Wnt8a基因的SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型檢測(cè),統(tǒng)計(jì)分析各個(gè)SNP位點(diǎn)相關(guān)群體遺傳信息,并將SNPs與安格斯牛生長(zhǎng)性狀擬合進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。研究結(jié)果如下:1.本研究通過Sequenom SNP實(shí)驗(yàn)分型技術(shù)對(duì)8個(gè)SNPs進(jìn)行基因檢測(cè)分析后發(fā)現(xiàn),所選擇的基因位點(diǎn)在寧夏地區(qū)安格斯牛群體中都存在多態(tài)性。其中GHR-149、UCP2-655和FBXO32-53423位點(diǎn)均屬于中度多態(tài)(0.25<PIC<0.5)。除UCP3-5465位點(diǎn),其他突變位點(diǎn)經(jīng)卡方檢驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),都處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。2.GHR-149(g.149A>G)位點(diǎn)與安格斯牛的體高和十字部高顯著...
【文章來源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1?安格斯牛血液基因組DNA凝膠電泳檢測(cè)??Fig?3-1?Genomic?DNA?isolated?from?frozen?blood?of?Angus?cattle?inagarosegel??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]麥洼牦牛GH、GHR、GHSR基因的SNPs檢測(cè)及其與體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 海汀,柴志欣,鐘金城. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(04)
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[8]解偶聯(lián)蛋白1、2和3基因在中國西門塔爾牛組織器官中的表達(dá)水平及其與胴體品質(zhì)關(guān)系分析[J]. 孫國權(quán),高樹新,吳慧光,李俊雅,麗春,王景山,王玉泉,王國富. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(04)
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[10]豬MSTN基因的多態(tài)性和生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 劉曉琴,馬喜山,唐中林,周榮,楊述林,敖紅,牟玉蓮,李奎. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
博士論文
[1]F-box基因在動(dòng)物中的進(jìn)化和群體遺傳學(xué)研究[D]. 王愛蘭.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
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碩士論文
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[9]家兔POMC和UCP2基因?qū)ιL(zhǎng)性狀、屠體性狀和部分肉質(zhì)性狀的遺傳效應(yīng)研究[D]. 劉文超.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[10]SASH1和FBXO32蛋白在食管鱗狀細(xì)胞癌組織中的表達(dá)及其意義[D]. 丁小瑩.鄭州大學(xué) 2014
本文編號(hào):3333424
【文章來源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1?安格斯牛血液基因組DNA凝膠電泳檢測(cè)??Fig?3-1?Genomic?DNA?isolated?from?frozen?blood?of?Angus?cattle?inagarosegel??
?第三章結(jié)果與分析??3.2.1?GHR-149位點(diǎn)分型檢測(cè)結(jié)果??GHR-149位點(diǎn)位于GHR基因的內(nèi)含子1上,發(fā)生了?A/G轉(zhuǎn)換。如圖3-2所示,利用??SequenomSNP技術(shù)檢測(cè)到該位點(diǎn)存在A和G兩個(gè)等位基因,AA、AG和GG三種基因型。??I?Kai?tew]???;??;???■.-;?ax<???jb*??hc???1?/?71?|?/?7]?[?:?^??I?-?;?/?????'?T??/?I??I???/?/?/?/?/?/??/?/?,?;?,??*'?/?/??V?,?/?/??i?I?*?i?t???i>?¥? ̄ ̄i?5?;?a?t?z?i?i?:?i???5?<?i?i??G?G?G??圖3-2?GHR-149位點(diǎn)三種基因型散點(diǎn)圖??Fig?3-2?The?scatter?plot?of?three?genotypes?of?GHR-149??3.2.2?UCP2-655位點(diǎn)分型檢測(cè)結(jié)果??UCP2-655位點(diǎn)位于UCP2基因的外顯子丨上,發(fā)生了?G/A轉(zhuǎn)換,沒有引起氨基酸的改??變,為同義突變。如圖3-3所示,經(jīng)SequenomSNP質(zhì)譜技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),該位點(diǎn)存在A和G??兩個(gè)等位基因,AA、AG和GG二種基因型。??-?"J??/?
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[7]豬GHR基因兩個(gè)SNPs位點(diǎn)多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 楊慧,陳寶劍,蘭干球,郭亞芬,蔣欽楊,楊秀榮. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(11)
[8]解偶聯(lián)蛋白1、2和3基因在中國西門塔爾牛組織器官中的表達(dá)水平及其與胴體品質(zhì)關(guān)系分析[J]. 孫國權(quán),高樹新,吳慧光,李俊雅,麗春,王景山,王玉泉,王國富. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(04)
[9]不同受體胚胎移植荷斯坦奶牛生長(zhǎng)指標(biāo)比較及相關(guān)性分析[J]. 薛仰全,余四九,倪興軍. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(35)
[10]豬MSTN基因的多態(tài)性和生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 劉曉琴,馬喜山,唐中林,周榮,楊述林,敖紅,牟玉蓮,李奎. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
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[3]動(dòng)物肌肉生長(zhǎng)調(diào)控因子基因和豬脂肪沉積調(diào)控基因的研究[D]. 劉丑生.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]牦牛角候選蛋白表達(dá)及生長(zhǎng)發(fā)育基因關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 張志飛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[2]Wnt及相關(guān)基因在厚殼貽貝幼蟲生長(zhǎng)發(fā)育過程中的作用[D]. 徐躍峰.上海海洋大學(xué) 2017
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[4]CRTC家族3個(gè)基因SNP檢測(cè)及其與秦川肉牛生長(zhǎng)性狀和胴體性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 徐懷超.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[5]中國荷斯坦牛和新疆褐牛產(chǎn)奶性狀SNPs篩選及遺傳效應(yīng)分析[D]. 劉麗元.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]GHRL及其受體GHSR基因的多態(tài)性與秦川肉牛體尺性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 董夢(mèng)宇.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[7]NR6A1、PLAG1、LCORL基因在民豬群體內(nèi)的單倍型及連鎖不平衡分析[D]. 范家萌.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[8]西門塔爾雜種牛生長(zhǎng)速度相關(guān)基因與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性的研究[D]. 蔣秋斐.寧夏大學(xué) 2015
[9]家兔POMC和UCP2基因?qū)ιL(zhǎng)性狀、屠體性狀和部分肉質(zhì)性狀的遺傳效應(yīng)研究[D]. 劉文超.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[10]SASH1和FBXO32蛋白在食管鱗狀細(xì)胞癌組織中的表達(dá)及其意義[D]. 丁小瑩.鄭州大學(xué) 2014
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