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雞胚外泌體miRNAs功能分析

發(fā)布時間:2021-08-02 22:50
  旨在基于雞胚外泌體及所含有的miRNAs解析其產(chǎn)生生理功效的活性物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機制。本研究收集13胚齡惠陽胡須雞胚蛋18枚(3組,每組6枚),采用酶消化、蔗糖密度梯度和差速超速離心等方法分離雞胚組織來源的外泌體,經(jīng)透射電鏡、納米流式和標(biāo)志蛋白流式檢測等方法鑒定其特征。利用高通量測序方法研究外泌體樣本中miRNAs表達譜,對各樣本top 10且共表達的miRNAs進行靶基因預(yù)測與功能分析。結(jié)果表明,分別獲得了3個浮力密度范圍(S1:1.13 g·mL-1、S2:1.21 g·mL-1和S3:1.32 g·mL-1)具有外泌體典型特征的胞外囊泡;與miRBase V21進行比對發(fā)現(xiàn),S1、S2和S3樣品中分別含有675、661和845個已知的miRNAs,這些miRNAs中有488個(52.6%)三者共有,包括了廣泛參與細胞增殖、分化和免疫應(yīng)答等過程的功能性miRNAs。TargetScan 7.2和miRDB預(yù)測得到3個樣本中top 10且共表達的56個miRNAs的靶基因,獲得的3 650個靶基因經(jīng)DAVID分析,顯著富... 

【文章來源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2020,51(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:11 頁

【部分圖文】:

雞胚外泌體miRNAs功能分析


雞胚組織中胞外囊泡分離流程

高通量,測序,名稱,引物


表2 miRNA熒光定量驗證特異性引物Table2 miRNA-specific primers for qPCR miRNA名稱Name 引物Primer miRNA名稱Name 引物Primer gga-miR-203a GCGGTGAAATGTTTAGGACCACTTG gga-miR-205a CTCCTTCATTCCACCGGAGTCTG gga-miR-155 GCCTTAATGCTAATCGTGATAGGGG gga-miR-122-5p GCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTGT gga-miR-148a-3p GCGTCAGTGCACTACAGAACTTTGT gga-miR-30a-5p GCTTGTAAACATCCTCGACTGGAAG gga-miR-200a-5p GCGCATCTTACTAGACAGTGCTGGA gga-miR-125b-5p GCTCCCTGAGACCCTAACTTGTGA圖7 3個樣品top 10共表達miRNAs的維恩圖

樣品,高通量,靶基因,富集


3個樣品top 10共表達miRNAs的維恩圖


本文編號:3318418

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