興義鴨MEF2C和MEF2D基因的SNPs分析及原核表達研究
發(fā)布時間:2021-07-24 09:38
肌細胞增強因子2C(myocyte enhancer factor 2C,MEF2C)和肌細胞增強因子2D(myocyte enhancer factor 2D,MEF2D)是肌細胞增強因子2(myocyte enhancer factor 2,MEF2)基因家族的成員,被認為與骨骼肌發(fā)生發(fā)育和再生有關。本研究以貴州省地方品種興義鴨為研究對象,以MEF2C和MEF2D基因為候選基因,利用直接測序方法檢測兩個基因外顯子的多態(tài)性,并與屠宰性狀各指標進行相關性分析,同時構建兩個基因的原核表達載體,以期為興義鴨屠宰性狀的分子標記輔助選育提供依據,為其他畜禽相關基因的研究提供參考,為下一步相關蛋白質功能的研究提供基礎。研究結果如下:1、興義鴨MEF2C和MEF2D基因多態(tài)性與屠宰性狀的關聯性研究。在本試驗群體MEF2C基因外顯子中沒有發(fā)現SNP位點。在MEF2D基因外顯子發(fā)現了6個多態(tài)位點,均為同義突變;群體遺傳學分析顯示,6個多態(tài)位點均表現為中度多態(tài)(0.25<PIC<0.5),經χ2檢驗表明興義鴨群體在這6個多態(tài)位點均處于Hardy-weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)...
【文章來源】:貴州大學貴州省 211工程院校
【文章頁數】:64 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 貴州興義鴨概述
2 影響畜禽屠宰性狀的候選基因
2.1 MEF2C基因的研究進展
2.2 MEF2D基因的研究進展
3 可變剪接
4 本研究的目的和意義
第二章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因多態(tài)性與屠宰性狀的關聯性研究
1 試驗材料
1.1 試驗動物與樣品
1.2 主要試劑
1.3 試驗儀器設備
1.4 主要試劑的配制
2 試驗方法
2.1 基因組DNA提取
2.2 引物設計
2.3 PCR擴增及測序
2.4 數據分析
3 結果與分析
3.1 MEF2C、MEF2D基因PCR擴增結果
3.2 測序結果分析
3.3 多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.4 MEF2D多態(tài)性與屠宰性狀相關性分析
4 討論
5 小結
第三章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因原核表達載體的構建
1 試驗材料
1.1 樣品、菌株、載體
1.2 試驗主要試劑
1.3 試驗儀器
1.4 常用試劑配制
2 試驗方法
2.1 興義鴨組織總RNA提取
2.2 cDNA的合成
2.3 MEF2C和MEF2D基因CDS區(qū)的克隆
2.4 pET32a(+)-MEF2C、pET32a(+)-MEF2D原核表達載體構建
3 結果與分析
3.1 CDS區(qū)擴增產物的PCR檢測結果
3.2 pUCmT-MEF2C/pMD18-T-MEF2D重組載體的菌液PCR鑒定和測序鑒定
3.3 pUCmT-MEF2C/pMD18-T-MEF2D重組質粒的雙酶切檢測
3.4 pET32a(+)-MEF2C/MEF2D重組載體的構建
3.5 MEF2C和MEF2D基因CDS區(qū)的稀有密碼子分析
4 討論
5 小結
第四章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因原核表達
1 實驗材料
1.1 實驗樣品
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器設備
1.4 主要試劑的配制
2 實驗方法
2.1 重組質粒轉入BL21(DE3)感受態(tài)細胞
2.2 總蛋白的提取
2.3 蛋白樣品變性處理
2.4 SDS-PAGE凝膠電泳
2.5 重組蛋白的Western Blot檢測
3 結果與分析
3.1 重組載體和空載體轉入BL21(DE3)感受態(tài)的酶切檢測
3.2 重組蛋白的表達形式
3.3 重組蛋白western blot的檢測
4 討論
5 小結
第五章 結論與展望
1 結論
2 展望
參考文獻
致謝
附錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]簡州大耳羊早期胎兒到新出生階段背最長肌中可變剪接的鑒定與分析[J]. 郭家中,陶海溪,李鵬飛,李利,張紅平. 西北農業(yè)學報. 2018(03)
[2]興義鴨MyoG基因SNPs與屠宰性狀相關性分析[J]. 彭邦星,李輝,易恒潔,趙忠海,卜小雁. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(03)
[3]MEF2D在肺癌中的表達及其在肺癌細胞增殖與轉移中的作用[J]. 張秀芳,孫瑩,趙丹,白小雪,魏靜,華樹成. 中國老年學雜志. 2016(14)
[4]組學時代的可變剪接研究進展[J]. 周冬虎,姜穎,賀福初. 中國科學:生命科學. 2015(12)
[5]高郵鴨VLDLR基因部分序列的多態(tài)性及其與腹脂率的關聯分析[J]. 趙南南,張湯杰. 畜牧與獸醫(yī). 2015(07)
[6]梅山豬TAP1基因多態(tài)性及組織表達譜分析[J]. 戴超輝,陳慧子,吳森,楊建生,吳圣龍,包文斌. 中國畜牧雜志. 2014(17)
[7]三穗鴨MSTN基因多態(tài)性與屠宰性狀相關性研究[J]. 易恒潔,李輝,楊勝林,趙忠海,彭邦星. 中國家禽. 2013(23)
[8]北柴胡糖基轉移酶基因BcUGT1的表達分析及其原核表達與蛋白純化[J]. 陶韻文,徐潔森,魏建和,孫晶,徐艷紅,楊欣,張巖,劉娟,隋春. 藥學學報. 2013(08)
[9]鴨TLR4基因可變剪接體的克隆、鑒定及組織表達分析[J]. 黃正洋,陳陽,李欣鈺,甄霆,張揚,徐琪,段修軍,趙文明,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學報. 2013(05)
[10]棉花GhCOMT1基因原核表達載體構建及蛋白純化和Western鑒定[J]. 李波,倪志勇,李曉東,范玲. 西北植物學報. 2012(10)
博士論文
[1]miR-218通過影響MEF2D表達對非小細胞肺癌的作用研究[D]. 孫瑩.吉林大學 2016
[2]神經生長因子MEF2D氧化修飾及降解在帕金森發(fā)病機制中的作用[D]. 高立.第四軍醫(yī)大學 2013
[3]豬Sirtuin家族基因的克隆及脂肪生成中SIRT3的功能研究[D]. 金丹.華中農業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]興義鴨MEF2A、MEF2B、MEF2C和MEF2D基因克隆與組織時空表達研究[D]. 趙忠海.貴州大學 2016
[2]MSTN、MyoG、MEF2A基因與興義鴨屠宰性狀相關性分析[D]. 彭邦星.貴州大學 2015
[3]山羊MEF2C基因選擇性剪接鑒定及其單核苷酸多態(tài)性與生長性狀的關聯分析[D]. 沈并兵.四川農業(yè)大學 2015
[4]MEF2D在腦膠質瘤中的表達及其對膠質瘤細胞增殖和遷移的影響[D]. 李晨.寧夏醫(yī)科大學 2015
[5]鴨MEF2D基因編碼區(qū)克隆及其微衛(wèi)星多態(tài)與屠宰性能的關聯分析[D]. 胡繼偉.四川農業(yè)大學 2014
[6]黃牛MEF2C基因遺傳變異及其效應分析和組織表達規(guī)律研究[D]. 展召陽.西北農林科技大學 2014
[7]紹興鴨PPARγ、GH基因多態(tài)性與生長發(fā)育性能和屠宰性能關聯性分析[D]. 李麗.揚州大學 2014
[8]小體型北京鴨屠宰性能及其相關基因遺傳多態(tài)性研究[D]. 吳豪.中國農業(yè)科學院 2014
[9]新疆卡拉庫爾羊TNF-α基因的克隆、原核表達及抗原性分析[D]. 賀艷艷.塔里木大學 2012
[10]新疆卡拉庫爾羊Fas基因的克隆、原核表達及抗原性分析[D]. 潘輝.塔里木大學 2012
本文編號:3300405
【文章來源】:貴州大學貴州省 211工程院校
【文章頁數】:64 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 貴州興義鴨概述
2 影響畜禽屠宰性狀的候選基因
2.1 MEF2C基因的研究進展
2.2 MEF2D基因的研究進展
3 可變剪接
4 本研究的目的和意義
第二章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因多態(tài)性與屠宰性狀的關聯性研究
1 試驗材料
1.1 試驗動物與樣品
1.2 主要試劑
1.3 試驗儀器設備
1.4 主要試劑的配制
2 試驗方法
2.1 基因組DNA提取
2.2 引物設計
2.3 PCR擴增及測序
2.4 數據分析
3 結果與分析
3.1 MEF2C、MEF2D基因PCR擴增結果
3.2 測序結果分析
3.3 多態(tài)位點遺傳多態(tài)性的分析
3.4 MEF2D多態(tài)性與屠宰性狀相關性分析
4 討論
5 小結
第三章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因原核表達載體的構建
1 試驗材料
1.1 樣品、菌株、載體
1.2 試驗主要試劑
1.3 試驗儀器
1.4 常用試劑配制
2 試驗方法
2.1 興義鴨組織總RNA提取
2.2 cDNA的合成
2.3 MEF2C和MEF2D基因CDS區(qū)的克隆
2.4 pET32a(+)-MEF2C、pET32a(+)-MEF2D原核表達載體構建
3 結果與分析
3.1 CDS區(qū)擴增產物的PCR檢測結果
3.2 pUCmT-MEF2C/pMD18-T-MEF2D重組載體的菌液PCR鑒定和測序鑒定
3.3 pUCmT-MEF2C/pMD18-T-MEF2D重組質粒的雙酶切檢測
3.4 pET32a(+)-MEF2C/MEF2D重組載體的構建
3.5 MEF2C和MEF2D基因CDS區(qū)的稀有密碼子分析
4 討論
5 小結
第四章 興義鴨MEF2C和MEF2D基因原核表達
1 實驗材料
1.1 實驗樣品
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器設備
1.4 主要試劑的配制
2 實驗方法
2.1 重組質粒轉入BL21(DE3)感受態(tài)細胞
2.2 總蛋白的提取
2.3 蛋白樣品變性處理
2.4 SDS-PAGE凝膠電泳
2.5 重組蛋白的Western Blot檢測
3 結果與分析
3.1 重組載體和空載體轉入BL21(DE3)感受態(tài)的酶切檢測
3.2 重組蛋白的表達形式
3.3 重組蛋白western blot的檢測
4 討論
5 小結
第五章 結論與展望
1 結論
2 展望
參考文獻
致謝
附錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]簡州大耳羊早期胎兒到新出生階段背最長肌中可變剪接的鑒定與分析[J]. 郭家中,陶海溪,李鵬飛,李利,張紅平. 西北農業(yè)學報. 2018(03)
[2]興義鴨MyoG基因SNPs與屠宰性狀相關性分析[J]. 彭邦星,李輝,易恒潔,趙忠海,卜小雁. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(03)
[3]MEF2D在肺癌中的表達及其在肺癌細胞增殖與轉移中的作用[J]. 張秀芳,孫瑩,趙丹,白小雪,魏靜,華樹成. 中國老年學雜志. 2016(14)
[4]組學時代的可變剪接研究進展[J]. 周冬虎,姜穎,賀福初. 中國科學:生命科學. 2015(12)
[5]高郵鴨VLDLR基因部分序列的多態(tài)性及其與腹脂率的關聯分析[J]. 趙南南,張湯杰. 畜牧與獸醫(yī). 2015(07)
[6]梅山豬TAP1基因多態(tài)性及組織表達譜分析[J]. 戴超輝,陳慧子,吳森,楊建生,吳圣龍,包文斌. 中國畜牧雜志. 2014(17)
[7]三穗鴨MSTN基因多態(tài)性與屠宰性狀相關性研究[J]. 易恒潔,李輝,楊勝林,趙忠海,彭邦星. 中國家禽. 2013(23)
[8]北柴胡糖基轉移酶基因BcUGT1的表達分析及其原核表達與蛋白純化[J]. 陶韻文,徐潔森,魏建和,孫晶,徐艷紅,楊欣,張巖,劉娟,隋春. 藥學學報. 2013(08)
[9]鴨TLR4基因可變剪接體的克隆、鑒定及組織表達分析[J]. 黃正洋,陳陽,李欣鈺,甄霆,張揚,徐琪,段修軍,趙文明,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學報. 2013(05)
[10]棉花GhCOMT1基因原核表達載體構建及蛋白純化和Western鑒定[J]. 李波,倪志勇,李曉東,范玲. 西北植物學報. 2012(10)
博士論文
[1]miR-218通過影響MEF2D表達對非小細胞肺癌的作用研究[D]. 孫瑩.吉林大學 2016
[2]神經生長因子MEF2D氧化修飾及降解在帕金森發(fā)病機制中的作用[D]. 高立.第四軍醫(yī)大學 2013
[3]豬Sirtuin家族基因的克隆及脂肪生成中SIRT3的功能研究[D]. 金丹.華中農業(yè)大學 2013
碩士論文
[1]興義鴨MEF2A、MEF2B、MEF2C和MEF2D基因克隆與組織時空表達研究[D]. 趙忠海.貴州大學 2016
[2]MSTN、MyoG、MEF2A基因與興義鴨屠宰性狀相關性分析[D]. 彭邦星.貴州大學 2015
[3]山羊MEF2C基因選擇性剪接鑒定及其單核苷酸多態(tài)性與生長性狀的關聯分析[D]. 沈并兵.四川農業(yè)大學 2015
[4]MEF2D在腦膠質瘤中的表達及其對膠質瘤細胞增殖和遷移的影響[D]. 李晨.寧夏醫(yī)科大學 2015
[5]鴨MEF2D基因編碼區(qū)克隆及其微衛(wèi)星多態(tài)與屠宰性能的關聯分析[D]. 胡繼偉.四川農業(yè)大學 2014
[6]黃牛MEF2C基因遺傳變異及其效應分析和組織表達規(guī)律研究[D]. 展召陽.西北農林科技大學 2014
[7]紹興鴨PPARγ、GH基因多態(tài)性與生長發(fā)育性能和屠宰性能關聯性分析[D]. 李麗.揚州大學 2014
[8]小體型北京鴨屠宰性能及其相關基因遺傳多態(tài)性研究[D]. 吳豪.中國農業(yè)科學院 2014
[9]新疆卡拉庫爾羊TNF-α基因的克隆、原核表達及抗原性分析[D]. 賀艷艷.塔里木大學 2012
[10]新疆卡拉庫爾羊Fas基因的克隆、原核表達及抗原性分析[D]. 潘輝.塔里木大學 2012
本文編號:3300405
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