為了克隆TNNI基因家族,預(yù)測其蛋白結(jié)構(gòu)和功能,并分析其在牦牛不同組織中的表達(dá)差異,以0.5歲健康的類烏齊牦牛為試驗材料,采用RT-PCR技術(shù)克隆牦牛肌鈣蛋白Ⅰ基因家族的CDS區(qū)序列并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,利用實時熒光定量PCR技術(shù)檢測TNNI基因家族各成員的mRNA表達(dá)水平。結(jié)果表明,TNNI1、TNNI2和TNNI3基因CDS區(qū)大小分別為564,549,639 bp,分別編碼187,182,212個氨基酸殘基。預(yù)測分析結(jié)果顯示:TNNI基因家族編碼的蛋白質(zhì)均為偏堿性蛋白,蛋白結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,均無跨膜結(jié)構(gòu)域,無信號肽,屬非分泌型蛋白;二、三級結(jié)構(gòu)均以α-螺旋為主,均含有肌蛋白超家族保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明:類烏齊牦牛TNNI1基因與水牛的親緣關(guān)系最近,其次是綿羊、黃牛,與小鼠親緣關(guān)系最遠(yuǎn);TNNI2和TNNI3均與黃牛、水牛的親緣關(guān)系較近,與其他親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示,TNNI1和TNNI2基因在臀肌中的相對表達(dá)量最高,且TNNI1基因在心臟、肝臟和肺臟中的表達(dá)量顯著高于TNNI2基因（P<0.05）,TNNI3基因在心臟中表達(dá)量較高,而在肺臟、臀肌和肝臟中表... 

【文章來源】：華北農(nóng)學(xué)報. 2020,35(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

牦牛TNNI1基因編碼蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測

牦牛TNNI2基因編碼蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測

牦牛TNNI3基因編碼蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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