灘羊、小尾寒羊、湖羊、薩福克羊和德克塞爾羊均是肉、裘兼用的優(yōu)良綿羊品種。GPR54、LIN28和LIN28b基因的作用是調控綿羊繁殖性能和生長速度;SCD基因的作用是調控綿羊脂肪沉積,影響肉品質。分析這四個基因的多態(tài)性,并結合生產數(shù)據(jù)篩選優(yōu)良基因,繼而提高綿羊養(yǎng)殖的經濟效益。對基因進行生物信息學分析,為提高綿羊繁殖性能、加快生長發(fā)育速度和提高肉品質奠定理論基礎。以5個品種的250只綿羊為研究對象,應用PCR-SSCP技術檢測四個基因的多態(tài)性。利用GenBank數(shù)據(jù)庫和各種分子生物學軟件,對四個基因進行生物信息學分析,預測其編碼產物的理化性質、結構與功能。結果表明:1.GPR54基因出現(xiàn)1處突變位點,位于第2內含子的g.2958-24C>A顛換。2.LIN28基因出現(xiàn)2處突變位點,分別位于第1內含子的g.111+70C>G轉換和第4外顯子的g.46A>G同義突變。3.預測GPR54基因編碼產物的開放閱讀框長1137 bp,編碼378個氨基酸殘基,為疏水性跨膜蛋白,無信號肽存在,二級結構為Mixed型,主要在內質網上發(fā)揮生物學作用,在離子跨膜與信號傳遞過程中發(fā)揮重要作用。... 

【文章來源】：寧夏大學寧夏回族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－３引物Ｎ４梯度ＰＣＲ產物的瓊脂糖凝膠電泳??Ｆｉｇ．２－３?Ａｇａｒｏｓｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｇｒａｄｉｅｎｔ?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔｓ?ｆｒｏｍ?Ｍ４??

２．３．１基因組ＤＮＡ樣品的檢測??試驗采用傳統(tǒng)的酚－氯仿抽提法從綿羊的血液組織中提取基因組ＤＮＡ，然后利用瓊脂糖凝膠??電泳檢測ＤＮＡ濃度。利用２?％的瓊脂糖凝膠檢測的結果見圖２－２，只有一條清晰的條帶，沒有明??顯的拖帶，說明ＤＮＡ沒有降解純度較高。分光光度計檢測ＤＮＡ濃度，２６０ｎｍ／２８０ｎｍ的結果為??１．８２，說明粗提的基因組ＤＮＡ無ＲＮＡ與蛋白質污染。粗提的基因組ＤＮＡ質量達到了后續(xù)試驗??的要求。??圖２－２綿羊基因組ＤＮＡ瓊脂糖凝膠電泳??Ｆｉｇ．２－２?Ａｇａｒｏｓｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｆｒｏｍ?Ｓｈｅｅｐ??２．３．２最適退火溫度??梯度ＰＣＲ后，利用２?％的瓊脂糖凝膠對ＰＣＲ產物進行電泳，選擇最適退火溫度。圖２－３，引??物Ｍ４ＰＣＲ產物的電泳圖。??圖２－３引物Ｎ４梯度ＰＣＲ產物的瓊脂糖凝膠電泳??Ｆｉｇ．２－３?Ａｇａｒｏｓｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｇｒａｄｉｅｎｔ?ＰＣＲ?ｐｒｏｄｕｃｔｓ?ｆｒｏｍ?Ｍ４??從圖２－３可以看出第５泳道的條帶最亮，確定第５泳道對應的溫度為最適退火溫度。所有引??物的最適退火溫度見表２－４。??表２－４最佳退火溫度??Ｔａｂｌｅ?２－４?Ｔｈｅ?ｂｅｓｔ?ａｎｎｅａｌｉｎｇ?ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ??基因ｇｅｎｅｓ?名稱ｎａｍｅ?退火溫度（°Ｃ）?Ｔｍ??ＰＩ?５８．０??Ｐ２?５０．１??ＧＰＲ５４?Ｐ３?５８．０??Ｐ４?５６．７??Ｐ５?５９．３??Ｍｌ?５６．０?

．３．３等位基因序列比對分析??與ＮＣＢＩ公布的綿羊ＧＰＲ５４基因序列（ＨＭ１３５３９３．１）進行比對發(fā)現(xiàn)，Ｐ３引物擴增片段多態(tài)第２內含子中的一個核苷酸點突變造成的，等位基因序列比對如圖２－６。等位基因Ａ在第子發(fā)現(xiàn)ｇ．２９５８－２４Ｃ＞Ａ顛換。??ＧｅｎＢａｎｋ．?ｓｅｑ?ＡＣＡＣＧＣＣＧＧＭＴＣＣＣＡＴＴＴＴＴＴＣＣＣＡＧＧＴＣＴＣＧＧＴＧＣＡＧＧ?４０??ＡＡ．?ｓｅｑ???４０??ＡＢ．?ｓｅｑ?—ａ??４０??ＧｅｎＢａｎｋ．?ｓｅｑ?ＣＣＡＣＧＴＧＣＧＣＣＡＣＣＣＴＧＡＣＣＧＣＣＡＴＧＡＧＣＧＴＧＧＡＣＣＧＣＴＧ?８０??ＡＡ．?ｓｅｑ???８０??ＡＢ．?ｓｅｑ???８０??ＧｅｎＢａｎｋ．?ｓｅｑ?ＧＴＡＣＧＴＧＡＣＡＧＴＧＴＴＣＣＣＧＣＴＧＣＧＣＧＣＣＣＴＧＣＡＣＣＧＣＣＧＣ?１２０??ＡＡ．?ｓｅｑ???１２０??ＡＢ．?ｓｅｑ???１２０??ＧｅｎＢａｎｋ．?ｓｅｑ?ＡＣＧＣＣＣＣＧＣＣＴＧＧＣＧＣＴＧＧＣＡＧＴＣＡＧＣＣＴＣＧＧＣＡＴＣＴＧＧＧ?１６０??ＡＡ．?ｓｅｑ???１６０??ＡＢ．?ｓｅｑ???１６０??ＧｅｎＢａｎｋ．?ｓｅｑ?ＴＧＧＧＴＧＡＧＴＴＣＡＧＣＡＴＧＧＧＧＧＴＣＧＣＡＣＧＧＧＣＧＧＧＧＧＧＡＧＡ?２００???

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3268401