試驗(yàn)旨在探討不同的飼養(yǎng)環(huán)境及日糧結(jié)構(gòu)對(duì)牦牛瘤胃菌群結(jié)構(gòu)的影響,應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)分析了青海牦牛引進(jìn)山東后的瘤胃菌群變化情況。結(jié)果表明,青海牦牛瘤胃液可見物種（Observed species）及Chao1指數(shù)（Chao1 index）與引進(jìn)牦牛瘤胃液相比差異極顯著（P<0.01）,ACE指數(shù)差異顯著（P<0.05）;青海牦牛菌群豐度顯著高于引進(jìn)牦牛,說(shuō)明青海牦牛引進(jìn)山東后瘤胃菌群豐度發(fā)生了顯著變化,而引進(jìn)前后牦牛瘤胃液香濃指數(shù)（Shannon index）以及辛普森指數(shù)（Simpson index）差異不顯著（P>0.05）,說(shuō)明青海牦牛引進(jìn)山東后瘤胃菌群多樣性未顯著改變。測(cè)序數(shù)據(jù)表明,牦牛瘤胃液中豐度較高的菌群依次是擬桿菌門、厚壁菌門、變形菌門、疣微菌門、互養(yǎng)菌門、軟壁菌門、纖維桿菌門;青海牦牛引進(jìn)山東后菌群結(jié)構(gòu)比例變化顯著的門是浮霉菌門和裝甲菌門（P<0.05）,變化顯著的屬是顫桿菌克屬和帕匹桿菌屬（P<0.05）。數(shù)據(jù)分析得出,擬桿菌和理研菌科在青海牦牛瘤胃液中起重要作用,而普雷沃氏菌科、琥珀酸弧菌科和產(chǎn)氣單胞菌在引進(jìn)山東牦牛瘤胃液中起主要的作用,推... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(07)北大核心

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樣本16S rDNA基因S5-16SV45區(qū)域擴(kuò)增結(jié)果

根據(jù)聚類得到的OTUs分析兩組樣本之間共有和特有OTUs,繪制成韋恩圖(Venn diagram)。圖中每個(gè)圈代表1組樣本,圈和圈重疊部分的數(shù)字代表兩組共有的OTUs個(gè)數(shù)。由圖2可知,牦牛由青海遷至山東后瘤胃液菌群多樣性降低。2.2.2 牦牛瘤胃液各樣品物種豐度分析

基于OTU水平的PCA分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3262093