為了探討山羊誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡DFF45樣效應(yīng)因子a （CIDEa）基因分子特征,了解其組織表達(dá)譜和在不同品種山羊之間的表達(dá)差異,試驗(yàn)對(duì)隆林山羊CIDEa基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)CIDEa基因的組織表達(dá)情況。結(jié)果表明:克隆獲得的隆林山羊CIDEa基因編碼區(qū)（CDS區(qū)）全長(zhǎng)為660 bp,編碼219個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為23 367.21 ku,屬于親水性不穩(wěn)定膜外蛋白。與普通山羊CIDEa基因CDS區(qū)對(duì)比,隆林山羊CIDEa基因序列存在一個(gè)核苷酸突變位點(diǎn),由亮氨酸變?yōu)楦彼�。隆林山羊CIDEa基因與綿羊CIDEa基因同源性最高,與豬、獼猴、人的同源性較低,與大鼠、小鼠的遺傳距離最遠(yuǎn);隆林山羊CIDEa基因編碼蛋白中α-螺旋占35.62%,T-轉(zhuǎn)角占8.68%,β-氨基酸殘基構(gòu)成的延伸鏈占16.44%,無(wú)規(guī)則卷曲占39.27%;隆林山羊CIDEa基因在腹脂和皮下脂肪中高表達(dá),其表達(dá)水平顯著高于努比亞山羊,在其他組織中表達(dá)水平極低或不表達(dá)。說(shuō)明試驗(yàn)成功克隆出隆林山羊CIDEa基因,該基因與山羊脂肪代謝有著密不可分的關(guān)系。 

【文章來(lái)源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(21)北大核心

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隆林山羊CIDEa基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物鑒定結(jié)果

利用在線軟件ExPASy中的Protscale對(duì)隆林山羊CIDEa蛋白進(jìn)行親疏水性分析(見(jiàn)圖3),結(jié)果該蛋白質(zhì)屬于親水蛋白,即為可溶性蛋白。3.2.4 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

利用在線軟件SWISS-MODEL預(yù)測(cè)隆林山羊CIDEa蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果見(jiàn)圖5。在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,隆林山羊CIDEa蛋白肽鏈按照一定的空間結(jié)構(gòu)進(jìn)一步形成了更復(fù)雜高級(jí)的三級(jí)結(jié)構(gòu),暗示著該蛋白的某些功能。3.3 隆林山羊CIDEa基因序列分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]豫西脂尾羊CIDEa基因的克隆、序列分析與組織表達(dá)[J]. 李君,候霞飛,梁文雙,鄧紅雨,張桂枝,劉太宇,王笑笑,權(quán)凱.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2019(06)
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[5]誘導(dǎo)細(xì)胞死亡DNA片段化因子a樣效應(yīng)因子A基因?qū)Ψ逝趾痛x綜合征作用的研究進(jìn)展[J]. 張玲,戴穎,王瑋,王嵬,華琦.  中華老年心腦血管病雜志. 2010(07)
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博士論文
[1]Cidea和Cidec的轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及在細(xì)胞脂肪生成中的作用[D]. 王瑞.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2009

碩士論文
[1]CIDEa和CIDEc基因在肉雞中的表達(dá)分析[D]. 黃柳梅.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]大鼠肝再生中脂肪滴蛋白質(zhì)組的差異分析[D]. 張一甫.復(fù)旦大學(xué) 2010
[3]豬CIDE家族基因的克隆及功能研究[D]. 李艷華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3252273