雞腸道微生物的群落結(jié)構(gòu)和功能基因與雞的健康養(yǎng)殖
發(fā)布時間:2021-06-23 14:01
雞肉生產(chǎn)對全球食品安全至關(guān)重要。長期以來,亞治療劑量的抗生素在養(yǎng)雞行業(yè)中被廣泛用作促生長劑,并導(dǎo)致了抗生素抗性問題,對公共健康產(chǎn)生了威脅。博落回提取物(MCE)是一種植物源的天然促生長劑,其主要有效成分為芐基異喹啉生物堿,能替代抗生素產(chǎn)生促生長的效果。雖然各類促生長劑的作用機(jī)制尚未被完全解析,但已明確腸道微生物在其中有重要作用。為了更好地研究腸道微生物的促生長作用機(jī)制,本研究建立了一種從雞腸道內(nèi)容物中提取宏基因組DNA的方法,并構(gòu)建了首個雞腸道微生物宏基因集。然后在此基礎(chǔ)上,研究了雞的前腸與后腸微生物菌群的不同特征和隨時間變化的規(guī)律。在雞的飼料中添加博落回提取物(MCE)和金霉素(CTC),均能提高雞的生長性能,并且影響前腸微生物的菌群特征。博落回提取物(MCE)增強(qiáng)了前腸中益生菌乳酸菌屬(Lactobacillus)的相對豐度,也增強(qiáng)了菌群中氨基酸、維生素和次級膽汁酸的生物合成通路,為宿主提供了營養(yǎng)補(bǔ)充。金霉素(CTC)促進(jìn)了天然生產(chǎn)抗生素的北里孢菌屬(Kitasatospora)和鏈霉菌屬(Streptomyces),并且增強(qiáng)了抗生素、脂肪酸、不飽和脂肪酸和次級膽汁酸的微生物合成通...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:博士
【圖文】:
腸道微生物宏基因組DNA的實(shí)驗(yàn)處理流程
2.?A.差速離心富集微生物細(xì)胞示意圖B.裂解破碎微生物細(xì)胞糜顆粒沉淀,取上清微生物細(xì)胞懸浮液進(jìn)行高速離心,富集得到微生物細(xì)胞。液95°C高溫破碎方法進(jìn)行第一輪細(xì)胞裂解破碎,a得到含DNA的上清液;b磨破碎、裂解液95°C高溫破碎,得到含DNA的上清液;c混合兩次得到的DNA13??
測和去冗余分析,得到包含9,037,241個非冗余基因的宏基因集,開放閱??讀框(ORF)的平均長度為697?bp。??對所有樣品進(jìn)行基因的稀釋曲線分析。如圖4所示,稀釋曲線最終??接近于飽和,即隨著樣品數(shù)的增加,基因數(shù)目幾乎不再變化,表明該宏??基因集已包含了雞腸道微生物中絕大多數(shù)的基因。如果使用單一地區(qū)樣??品或者單一腸段樣品做稀釋曲線分析,則不能達(dá)到9.0?M的基因數(shù)目和??較高的飽和度?梢姡褂貌煌贩N地區(qū)和不同腸段來源的雞腸道樣品,??對構(gòu)建完整的雞腸道微生物宏基因集是非常必要的。??20??
本文編號:3245068
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:博士
【圖文】:
腸道微生物宏基因組DNA的實(shí)驗(yàn)處理流程
2.?A.差速離心富集微生物細(xì)胞示意圖B.裂解破碎微生物細(xì)胞糜顆粒沉淀,取上清微生物細(xì)胞懸浮液進(jìn)行高速離心,富集得到微生物細(xì)胞。液95°C高溫破碎方法進(jìn)行第一輪細(xì)胞裂解破碎,a得到含DNA的上清液;b磨破碎、裂解液95°C高溫破碎,得到含DNA的上清液;c混合兩次得到的DNA13??
測和去冗余分析,得到包含9,037,241個非冗余基因的宏基因集,開放閱??讀框(ORF)的平均長度為697?bp。??對所有樣品進(jìn)行基因的稀釋曲線分析。如圖4所示,稀釋曲線最終??接近于飽和,即隨著樣品數(shù)的增加,基因數(shù)目幾乎不再變化,表明該宏??基因集已包含了雞腸道微生物中絕大多數(shù)的基因。如果使用單一地區(qū)樣??品或者單一腸段樣品做稀釋曲線分析,則不能達(dá)到9.0?M的基因數(shù)目和??較高的飽和度?梢姡褂貌煌贩N地區(qū)和不同腸段來源的雞腸道樣品,??對構(gòu)建完整的雞腸道微生物宏基因集是非常必要的。??20??
本文編號:3245068
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