一株豬流感病毒A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)的分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析
發(fā)布時間:2021-06-07 15:48
為鑒定上海地區(qū)豬流感病毒的流行株及其分子生物學(xué)特征,本研究從上海地區(qū)養(yǎng)殖場采集疑似流感癥狀的豬咽拭子樣品40份,采用套式PCR結(jié)合雞胚分離鑒定方法,從中分離到1株H1N1亞型豬流感病毒(SIV),命名為A/swine/Shanghai/01/2019(H1N1)。經(jīng)全基因組測定和遺傳進(jìn)化分析結(jié)果顯示該分離株的8個基因節(jié)段與歐亞類禽H1N1 SIV同源性最高,其PB2、PB1、PA基因節(jié)段可能來源于A/swine/Jiangsu/49/2012(H1N1)病毒,NA、NP和M基因節(jié)段可能來源于A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)病毒。該分離病毒的HA蛋白裂解位點(diǎn)為PSIQSR↓GLFGAI,為低致病性流感病毒的分子特征。該分離株NA蛋白未出現(xiàn)與神經(jīng)氨酸酶抑制劑相關(guān)的氨基酸突變,M2蛋白S31N突變表明該病毒可能對金剛烷胺類藥物具有一定的耐藥性。PA蛋白224S和PB2蛋白701N突變提示該分離株對哺乳動物的適應(yīng)性增強(qiáng),可能導(dǎo)致其致病性增強(qiáng),需要加強(qiáng)對此類SIV的監(jiān)測。結(jié)合近年來的監(jiān)測表明,上海地區(qū)豬群...
【文章來源】:中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
SIV的分離鑒定(A)及8個基因節(jié)段的擴(kuò)增(B)結(jié)果
對毒株A swine/Shanghai/01/2019的8個基因節(jié)段進(jìn)行序列測定分析,結(jié)果顯示,分離株HA、PB2、PB1、PA基因與A/swine/Jiangsu/49/2012(H1N1)的同源性最高,達(dá)99.2%~99.8%;而NA、NP、M和NS基因則與A swine/Shanghai/3/2014(H1N1)毒株的同源性最高,達(dá)99.5%~100%。通過將分離株的8個基因節(jié)段的核苷酸序列與GenBank中的經(jīng)典型H1N1、歐亞類禽型H1N1、類人型H1N1和2009H1N1分支代表毒株進(jìn)行比對分析,結(jié)果顯示,A/swine/Shanghai/01/2019的8個基因節(jié)段均屬于歐亞類禽型H1N1進(jìn)化分支,未出現(xiàn)不同基因型流感病毒片段之間的重組,與江蘇省豬群中分離出的類禽型H1N1 SIV親源關(guān)系很近(圖2)。結(jié)合近年來監(jiān)測結(jié)果發(fā)現(xiàn),歐亞類禽型H1N1 SIV在我國豬群感染具有持續(xù)性,自2006年后成為主要流行株,雖然其致病力相對較低,但可感染人類,并通過空氣飛沫傳播,因此值得長期持續(xù)檢測。2.3 HA蛋白關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一株H1N1亞型豬流感病毒全基因組序列分析以及生物學(xué)特性研究[J]. 孟飛,楊煥良,王增,馬樹杰,陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]豬流感病毒分離株A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)分子特性研究[J]. 陶潔,殷秀辰,李星,張清真,熊年年,常宏賞,劉惠莉. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]一株類禽型H1N1亞型豬流感病毒的反向遺傳系統(tǒng)的建立[J]. 孟沙沙,喬傳玲,陳艷,楊煥良,劉麗萍,尹航,辛?xí)怨?陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(02)
[4]多重RT-PCR檢測豬流感病毒及血清亞型[J]. 劉惠莉,周宗清,邢繼蘭,潘潔,楊秋峰,饒柏忠. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2008(11)
[5]套式RT-PCR方法檢測臨床樣品中的豬流感病毒[J]. 祁賢,陸承平,王貴平,宋長緒. 中國病毒學(xué). 2005(02)
本文編號:3216860
【文章來源】:中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,42(08)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
SIV的分離鑒定(A)及8個基因節(jié)段的擴(kuò)增(B)結(jié)果
對毒株A swine/Shanghai/01/2019的8個基因節(jié)段進(jìn)行序列測定分析,結(jié)果顯示,分離株HA、PB2、PB1、PA基因與A/swine/Jiangsu/49/2012(H1N1)的同源性最高,達(dá)99.2%~99.8%;而NA、NP、M和NS基因則與A swine/Shanghai/3/2014(H1N1)毒株的同源性最高,達(dá)99.5%~100%。通過將分離株的8個基因節(jié)段的核苷酸序列與GenBank中的經(jīng)典型H1N1、歐亞類禽型H1N1、類人型H1N1和2009H1N1分支代表毒株進(jìn)行比對分析,結(jié)果顯示,A/swine/Shanghai/01/2019的8個基因節(jié)段均屬于歐亞類禽型H1N1進(jìn)化分支,未出現(xiàn)不同基因型流感病毒片段之間的重組,與江蘇省豬群中分離出的類禽型H1N1 SIV親源關(guān)系很近(圖2)。結(jié)合近年來監(jiān)測結(jié)果發(fā)現(xiàn),歐亞類禽型H1N1 SIV在我國豬群感染具有持續(xù)性,自2006年后成為主要流行株,雖然其致病力相對較低,但可感染人類,并通過空氣飛沫傳播,因此值得長期持續(xù)檢測。2.3 HA蛋白關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一株H1N1亞型豬流感病毒全基因組序列分析以及生物學(xué)特性研究[J]. 孟飛,楊煥良,王增,馬樹杰,陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]豬流感病毒分離株A/swine/Shanghai/3/2014(H1N1)分子特性研究[J]. 陶潔,殷秀辰,李星,張清真,熊年年,常宏賞,劉惠莉. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]一株類禽型H1N1亞型豬流感病毒的反向遺傳系統(tǒng)的建立[J]. 孟沙沙,喬傳玲,陳艷,楊煥良,劉麗萍,尹航,辛?xí)怨?陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(02)
[4]多重RT-PCR檢測豬流感病毒及血清亞型[J]. 劉惠莉,周宗清,邢繼蘭,潘潔,楊秋峰,饒柏忠. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2008(11)
[5]套式RT-PCR方法檢測臨床樣品中的豬流感病毒[J]. 祁賢,陸承平,王貴平,宋長緒. 中國病毒學(xué). 2005(02)
本文編號:3216860
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