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玻璃化冷凍牛GV卵母細(xì)胞全基因組甲基化模式初探

發(fā)布時(shí)間:2021-06-07 06:43
  旨在研究玻璃化冷凍對(duì)牛GV期卵母細(xì)胞全基因組甲基化的影響。本研究收集新鮮、玻璃化冷凍的牛GV卵母細(xì)胞,采用單細(xì)胞全基因組甲基化測(cè)序(ScWGBS)技術(shù)對(duì)新鮮、玻璃化法冷凍牛GV卵母細(xì)胞的全基因組甲基化水平進(jìn)行檢測(cè),旨在揭示兩者DNA甲基化模式的差異。結(jié)果表明,玻璃化冷凍不會(huì)對(duì)牛GV卵母細(xì)胞的全基因甲基化水平造成顯著影響;诨虮倔w(GO)和信號(hào)通路(KEGG)對(duì)140個(gè)差異甲基化區(qū)域(DMRs)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)DMRs主要參與細(xì)胞發(fā)育、細(xì)胞骨架組織等功能,主要富集在PI3K-Akt信號(hào)通路、GnRH信號(hào)通路等,并篩選出與卵母細(xì)胞成熟(TSC2)、細(xì)胞骨架(NUDC)、細(xì)胞活力(MAFK)等相關(guān)的基因。上述結(jié)果,可為提高GV卵母細(xì)胞玻璃化冷凍效率奠定信息基礎(chǔ)和研究方向。 

【文章來(lái)源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(05)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)

【部分圖文】:

玻璃化冷凍牛GV卵母細(xì)胞全基因組甲基化模式初探


F_GV、V_GV組的DMR聚類圖

區(qū)域圖,甲基化,富集,基因


差異甲基化區(qū)域相關(guān)基因的GO富集結(jié)果

散點(diǎn)圖,甲基化,富集,基因


圖2 差異甲基化區(qū)域相關(guān)基因的GO富集結(jié)果如表1所示,本試驗(yàn)中兩組樣品Q30平均值均大于89%。同時(shí),F_GV、V_GV組樣品過(guò)濾后比對(duì)到基因組上的序列數(shù)占過(guò)濾后序列數(shù)的平均百分比分別為35.18%、35.87%,較人卵母細(xì)胞(29.4%)[22]、小鼠肝細(xì)胞(32.3%)測(cè)序結(jié)果高[24]。這些結(jié)果說(shuō)明,本試驗(yàn)測(cè)序結(jié)果可靠,可用于下一步分析。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新鮮、玻璃化冷凍牛卵母細(xì)胞體外受精囊胚全基因組甲基化模式初探[J]. 趙亞涵,郝海生,杜衛(wèi)華,龐云渭,閆長(zhǎng)亮,劉巖,趙善江,趙學(xué)明,朱化彬.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(06)



本文編號(hào):3216081

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