禽流感病毒RT-LAMP系列檢測方法的建立和應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-05-20 23:40
A型流感病毒屬于正粘病毒科,病毒基因組共有8個(gè)片段,至少編碼11種蛋白。病毒粒子表面囊膜上有血凝素(hemagglut inin, HA)與神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase, NA)兩種表面纖突。根據(jù)HA與NA的不同可區(qū)分為不同的亞型,H有H1-H16,而N有N1~N10。禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血清亞型眾多,抗原變異性強(qiáng),宿主范圍廣泛,亞型之間無交叉保護(hù)性。在禽流感的HA亞型中,只有H5和H7亞型對禽是高致病性的,稱為高致病性禽流感(High pathogenic avian influenza, HPAI)。近年在全球時(shí)見報(bào)道的主要是H5N1和H7N1亞型以及去年報(bào)道的H7N9亞型AIV。比如1997年香港H5N1亞型AIV直接感染人并致死;1999-2000年在意大利爆發(fā)的H7N1病毒導(dǎo)致1300多萬羽雞死亡,造成重大經(jīng)濟(jì)損失;2003年荷蘭爆發(fā)了H7N7亞型禽流感,不僅導(dǎo)致了重大的經(jīng)濟(jì)損失,而且感染89人。去年爆發(fā)的H7N9亞型AIV,造成超過300余人感染,50多人死亡。這些事件提示高致病性禽流感不僅會(huì)給養(yǎng)禽業(yè)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失,同...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究的目的和意義
1.2 文獻(xiàn)綜述
1.2.1 禽流感分子生物學(xué)研究進(jìn)展
1.2.2 禽流感公共衛(wèi)生意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)毒株
2.1.2 試劑
2.1.3 儀器設(shè)備
2.1.4 細(xì)胞、菌株、載體
2.1.5 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.6 臨床樣品
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 RNA的提取
2.2.2 MDCK細(xì)胞的培養(yǎng)
2.2.3 AIV尿囊液病毒擴(kuò)增和細(xì)胞噬斑測定
2.2.4 RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化
2.2.5 特異性試驗(yàn)
2.2.6 敏感性試驗(yàn)
2.2.7 RT-PCR試驗(yàn)方法及其引物序列
2.2.8 病毒分離
2.2.9 動(dòng)物人工感染實(shí)驗(yàn)
2.2.10 人工感染試驗(yàn)樣品和臨床樣品的采集與處理
3 結(jié)果與分析
3.1 AIV尿囊液病毒擴(kuò)增和細(xì)胞噬斑測定結(jié)果
3.2 禽流感病毒通用型LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.2.1 引物設(shè)計(jì)
3.2.2 RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的建立
3.2.3 特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.2.4 敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.2.5 已知AIV分離毒株的檢測
3.2.6 人工感染試驗(yàn)樣品的檢測
3.3 H9亞型AIV LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.3.1 引物設(shè)計(jì)
3.3.2 H9-RT-LAMP擴(kuò)增體系和條件
3.3.3 H9-RT-LAMP特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.3.4 H9亞型AIV LAMP的敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.3.5 H9 AIV LAMP人工感染棉拭子樣品的檢測結(jié)果
3.4 H5亞型AIV LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.4.1 引物設(shè)計(jì)
3.4.2 RT-LAMP擴(kuò)增體系和條件
3.4.3 H5型AIVRT-LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.4.4 H5亞型AIV LAMP的敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.4.5 H5 AIV LAMP對不同宿主來源的H5 AIV分離株檢測結(jié)果
3.5 H7N9亞型AIVRT-LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.5.1 引物設(shè)計(jì)
3.5.2 H7-RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化建立
3.5.3 H7亞型AIV LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.5.4 H7亞型AIV強(qiáng)弱毒株敏感性的試驗(yàn)結(jié)果
3.5.5 H7亞型RT-LAMP對H7N9AIV不同來源分離株的檢測結(jié)果
3.5.6 H7亞型AIV LAMP人工感染樣品檢測結(jié)果
3.5.7 N9亞型RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化確定
3.5.8 N9亞型RT-LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.5.9 N9亞型RT-LAMP敏感性的試驗(yàn)結(jié)果
3.5.10 H7N9亞型RT-LAMP對H7N9病料及樣品檢測的試驗(yàn)結(jié)果
4 討論
4.1 A型AIVRT-LAMP檢測方法的研究
4.2 H9亞型RT-LAMP檢測方法的研究
4.3 H5亞型RT-LAMP檢測方法的研究
4.4 H7N9亞型RT-LAMP檢測方法的研究
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄A
附錄B
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3198639
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級別】:博士
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摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究的目的和意義
1.2 文獻(xiàn)綜述
1.2.1 禽流感分子生物學(xué)研究進(jìn)展
1.2.2 禽流感公共衛(wèi)生意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)毒株
2.1.2 試劑
2.1.3 儀器設(shè)備
2.1.4 細(xì)胞、菌株、載體
2.1.5 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.6 臨床樣品
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 RNA的提取
2.2.2 MDCK細(xì)胞的培養(yǎng)
2.2.3 AIV尿囊液病毒擴(kuò)增和細(xì)胞噬斑測定
2.2.4 RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化
2.2.5 特異性試驗(yàn)
2.2.6 敏感性試驗(yàn)
2.2.7 RT-PCR試驗(yàn)方法及其引物序列
2.2.8 病毒分離
2.2.9 動(dòng)物人工感染實(shí)驗(yàn)
2.2.10 人工感染試驗(yàn)樣品和臨床樣品的采集與處理
3 結(jié)果與分析
3.1 AIV尿囊液病毒擴(kuò)增和細(xì)胞噬斑測定結(jié)果
3.2 禽流感病毒通用型LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.2.1 引物設(shè)計(jì)
3.2.2 RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的建立
3.2.3 特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.2.4 敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.2.5 已知AIV分離毒株的檢測
3.2.6 人工感染試驗(yàn)樣品的檢測
3.3 H9亞型AIV LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.3.1 引物設(shè)計(jì)
3.3.2 H9-RT-LAMP擴(kuò)增體系和條件
3.3.3 H9-RT-LAMP特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.3.4 H9亞型AIV LAMP的敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.3.5 H9 AIV LAMP人工感染棉拭子樣品的檢測結(jié)果
3.4 H5亞型AIV LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.4.1 引物設(shè)計(jì)
3.4.2 RT-LAMP擴(kuò)增體系和條件
3.4.3 H5型AIVRT-LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.4.4 H5亞型AIV LAMP的敏感性試驗(yàn)結(jié)果
3.4.5 H5 AIV LAMP對不同宿主來源的H5 AIV分離株檢測結(jié)果
3.5 H7N9亞型AIVRT-LAMP快速檢測方法的建立及評估
3.5.1 引物設(shè)計(jì)
3.5.2 H7-RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化建立
3.5.3 H7亞型AIV LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.5.4 H7亞型AIV強(qiáng)弱毒株敏感性的試驗(yàn)結(jié)果
3.5.5 H7亞型RT-LAMP對H7N9AIV不同來源分離株的檢測結(jié)果
3.5.6 H7亞型AIV LAMP人工感染樣品檢測結(jié)果
3.5.7 N9亞型RT-LAMP擴(kuò)增體系條件的優(yōu)化確定
3.5.8 N9亞型RT-LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果
3.5.9 N9亞型RT-LAMP敏感性的試驗(yàn)結(jié)果
3.5.10 H7N9亞型RT-LAMP對H7N9病料及樣品檢測的試驗(yàn)結(jié)果
4 討論
4.1 A型AIVRT-LAMP檢測方法的研究
4.2 H9亞型RT-LAMP檢測方法的研究
4.3 H5亞型RT-LAMP檢測方法的研究
4.4 H7N9亞型RT-LAMP檢測方法的研究
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄A
附錄B
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3198639
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