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牛病毒性腹瀉病毒復(fù)制相關(guān)宿主細(xì)胞環(huán)狀RNA的篩選

發(fā)布時(shí)間:2021-05-17 22:21
  為了明確環(huán)狀RNA(circRNA)在牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)復(fù)制中的作用,用BVDV NADL感染牛腎細(xì)胞(MDBK)并進(jìn)行高通量測(cè)序分析,結(jié)果獲得大量差異表達(dá)circRNA,對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,共獲得了12個(gè)上調(diào)的circRNA,通過(guò)RNase R消化、熒光定量PCR驗(yàn)證及通路分析,初步認(rèn)為circ-0027407具有抑制病毒復(fù)制的可能性。在RNA干擾試驗(yàn)中,設(shè)計(jì)的干擾片段顯著降低了circ-0027407的表達(dá)量,降低幅度約為66.1%,使用干擾載體轉(zhuǎn)染MDBK細(xì)胞后感染病毒,發(fā)現(xiàn)干擾circ-0027407會(huì)顯著增加病毒復(fù)制,提高了約113.2%。說(shuō)明circ-0027407對(duì)BVDV感染有抑制作用。 

【文章來(lái)源】:動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(09)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 細(xì)胞與病毒
        1.1.2 主要試劑
        1.1.3 主要儀器
    1.2 方法
        1.2.1 MDBK細(xì)胞培養(yǎng)
        1.2.2 BVDV擴(kuò)增
        1.2.3 circRNA篩選與引物設(shè)計(jì)
        1.2.4 circRNA鑒定
        1.2.5 RNA干擾
        1.2.6 TCID50測(cè)定
2 結(jié)果
    2.1 circRNA鑒定
    2.2 circ-0027407干擾片段的驗(yàn)證
    2.3 BVDV NADL感染MDBK細(xì)胞病毒復(fù)制與時(shí)間的關(guān)系
    2.4 干擾circ-0027407對(duì)病毒復(fù)制的影響
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本文編號(hào):3192553

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