為了解豬繁殖與呼吸綜合征病毒（PRRSV）貴州株GZ-R的遺傳變異情況及其NSP2基因的特征,本試驗(yàn)基于NSP2基因設(shè)計(jì)了2對特異性引物對目的基因進(jìn)行巢式RT-PCR、克隆和序列分析。結(jié)果顯示,第二輪巢式PCR除擴(kuò)增出約3 000 bp的預(yù)期條帶外,還擴(kuò)增出另一條約1 200 bp的條帶;將兩DNA片段克隆至pMD19-T載體后經(jīng)測序得到兩條片段,大片段長2 980 bp,命名為GZR-NSP2-L;小片段長1 131 bp,命名為,GZR-NSP2-S;兩片段同源性比對發(fā)現(xiàn),GZR-NSP2-S具有GZR-NSP2-L N端第1-945位核苷酸與C端第2 795-2 980位核苷酸,缺失GZR-NSP2-L第946-2 794位之間的核苷酸;GZR-NSP2-L與VR-2332株、Lelystad virus株的核苷酸同源性分別為81.2%、48.6%;編碼氨基酸同源性比對結(jié)果與核苷酸同源性結(jié)果一致,揭示PRRSV GZ-R株屬于美洲型毒株;氨基酸缺失位點(diǎn)比對發(fā)現(xiàn),GZ-R NSP2在其第481位、第533-561位存在30個不連續(xù)氨基酸的缺失,缺失位點(diǎn)與PRRSV高致病性毒株一致。... 

【文章來源】：中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(11)北大核心

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 病料
        1.1.2 主要試劑
    1.2 方法
        1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成
        1.2.2 病毒總RNA的提取和cDNA合成
        1.2.3 PRRSV NSP2基因巢式RT-PCR
        1.2.4 PRRSV NSP2基因克隆
        1.2.5 GZ-R NSP2基因遺傳變異分析
2 結(jié) 果
    2.1 NSP2基因巢式RT-PCR結(jié)果
    2.2 GZ-R NSP2克隆質(zhì)粒PCR鑒定結(jié)果
    2.3 同源性比對結(jié)果
        2.3.1 GZR-NSP2-L、GZR-NSP2-S測序和比對結(jié)果
        2.3.2 GZR-NSP2-L核苷酸同源性比對結(jié)果
        2.3.3 GZR-NSP2-L編碼氨基酸同源性比對結(jié)果
    2.4 GZR-NSP2-L編碼氨基酸缺失位點(diǎn)分析
    2.5 GZR-NSP2-L核苷酸遺傳進(jìn)化樹分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]內(nèi)蒙古自治區(qū)PRRSV分離株全基因測序與遺傳變異分析[J]. 解蕊伊,溫樹波,李卓昕,解長占,趙冠宇,莊忻雨,張赫,任靜強(qiáng),魯會軍.  中國病原生物學(xué)雜志. 2019(05)
[2]豬繁殖與呼吸綜合征病毒細(xì)胞受體功能研究進(jìn)展[J]. 王向鵬,陳璐,張赟.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(07)
[3]豬繁殖與呼吸綜合征病毒的遺傳變異與演化[J]. 楊漢春,周磊.  生命科學(xué). 2016(03)
[4]一株不能被高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒（HP-PRRSV）疫苗抗血清中和的HP-PRRSV的分離鑒定[J]. 陳家锃,白云,常丹,張秋月,王倩,冷超糧,張武超,趙鴻遠(yuǎn),葉超,李琳,田志軍,彭金美,安同慶,童光志.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(03)

碩士論文
[1]EDC3蛋白與PRRSV作用關(guān)系的探究[D]. 李昌紅.貴州大學(xué) 2019
[2]豬繁殖與呼吸綜合征病毒分離鑒定、變異與重組及致病性研究[D]. 王新港.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號：3183022