LKB1/AMPK信號通路相關(guān)基因在家兔腸炎模型中的表達(dá)差異研究
發(fā)布時間:2021-04-28 04:09
LKB1/AMPK信號通路廣泛參與機體細(xì)胞的增殖、分化和凋亡等生理活動,調(diào)控能量代謝等生命活動。而LKB1基因作為AMPK上游關(guān)鍵基因之一,其突變或者失活會引起AMPK信號通路變化,由此導(dǎo)致人類胃腸道疾病發(fā)生。因此,本試驗旨在研究LKB1/AMPK信號通路內(nèi)信號因子在家兔非特異性腸炎中的表達(dá)差異和作用機制,從而為家兔非特異性腸炎治療和預(yù)防提供理論依據(jù)。試驗前期克隆LKB1基因并通過構(gòu)建低纖維日糧誘導(dǎo)家免非特異性腸炎模型,采用RT-qPCR法檢測LKB1、AMPK (PRKAA2)、mTOR和NF-κβ基因在健康正常組(30只)和低纖維誘導(dǎo)腸炎組(60只)中7個組織(十二指腸、圓小囊、空腸、回腸、結(jié)腸、肝臟和脾臟)的mRNA表達(dá)量。試驗后期通過培養(yǎng)家兔結(jié)腸上皮細(xì)胞(CEC)以及利用LPS構(gòu)建家兔CEC炎癥模型,采用RNAi技術(shù)干擾炎癥細(xì)胞中LKB1基因的表達(dá),然后通過RT-qPCR法檢測LKB1、PRKAA2、NUAK1、mTOR、NF-κβ、IL-1A、TNF-α、PGC-1α和ATG13基因在不同炎癥細(xì)胞組中mRNA表達(dá)量,由此分析LKB1/AMPK信號通路在家兔非特異性腸炎中的作用...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
學(xué)術(shù)名詞簡表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 腸炎發(fā)生分子機制研究
1.2 LKB1基因的發(fā)現(xiàn)及其分子結(jié)構(gòu)
1.3 LKB1基因的調(diào)節(jié)方式
1.4 LKB1基因功能
1.4.1 對T細(xì)胞發(fā)育影響
1.4.2 促進(jìn)成肌細(xì)胞分化
1.4.3 可變剪切體LKB1s與精細(xì)胞形成
1.4.4 LKB1對細(xì)胞極性調(diào)節(jié)
1.4.5 LKB1與癌癥發(fā)生關(guān)系
1.5 LKB1基因相關(guān)信號通路
1.5.1 LKB1/AMPK信號通路與能量代謝
1.5.2 AMPK/SIRT1/NF-κβ信號通路介導(dǎo)炎癥反應(yīng)
1.5.3 LKB1/AMPK/mTOR信號通路與癌癥發(fā)生
1.6 本研究的目的和意義
1.6.1 試驗?zāi)康?br> 1.6.2 試驗研究的主要內(nèi)容
1.7 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 儀器與試劑
2.3 試驗方法
2.3.1 各組織總RNA的提取
2.3.2 總RNA質(zhì)量檢測
2.3.3 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
2.3.4 克隆LKB1基因
2.3.5 組織定量表達(dá)分析
2.4 細(xì)胞試驗
2.4.1 細(xì)胞傳代
2.4.2 冷凍和復(fù)蘇細(xì)胞
2.4.3 細(xì)胞計數(shù)
2.4.4 siRNA序列及相關(guān)基因引物信息
2.4.5 篩選siRNA分子及檢測炎癥細(xì)胞中各基因表達(dá)水平
3 試驗結(jié)果
3.1 LKB1基因克隆及序列分析
3.1.1 RNA質(zhì)量的檢測
3.1.2 LKB1基因克隆結(jié)果
3.1.3 測序及生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.2 檢測腸炎模型組各組織基因表達(dá)
3.3 細(xì)胞試驗結(jié)果
3.3.1 CEC細(xì)胞培養(yǎng)及觀察
3.3.2 細(xì)胞生長曲線
3.3.3 構(gòu)建細(xì)胞炎癥模型
3.4 篩選干擾siRNA序列
3.4.1 細(xì)胞總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
3.4.2 轉(zhuǎn)染及篩選siRNA
3.5 干擾LKB1基因?qū)MPK信號通路相關(guān)基因表達(dá)結(jié)果
3.5.1 LKB1/AMPK信號通路下游相關(guān)基因表達(dá)
3.5.2 PGC-1α和ATG13表達(dá)
3.6 炎癥細(xì)胞中促炎因子IL-lA和TNF-a表達(dá)結(jié)果
4 討論
4.1 克隆及生物信息學(xué)分析
4.2 腸炎模型組各組織表達(dá)分析
4.2.1 LKB1組織表達(dá)分析
4.2.2 與LKB1相關(guān)基因的組織表達(dá)分析
4.3 轉(zhuǎn)染si-02-LKB1對炎癥細(xì)胞模型中信號因子表達(dá)影響
4.3.1 PGC-1α和ATG13表達(dá)差異分析
4.3.2 AMPK激酶及其相關(guān)信號因子表達(dá)差異分析
4.3.3 促炎因子IL-1A和TNF-α表達(dá)差異分析
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]潰瘍性結(jié)腸炎與克羅恩病基因譜表達(dá)的差異[J]. 趙琦,何鮮平,游紹偉. 世界華人消化雜志. 2014(34)
[2]NUAK1通過影響F-actin聚合促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[J]. 尹崇高,李平,李洪利,孫磊,劉菲,張麗娜,李文通,張寶剛. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2013(10)
[3]不同中性洗滌纖維與淀粉比例飼糧對生長肉兔生產(chǎn)性能、盲腸發(fā)酵及胃腸道發(fā)育的影響[J]. 朱巖麗,李福昌,王春陽,王雪鵬. 動物營養(yǎng)學(xué)報. 2013(08)
[4]轉(zhuǎn)錄因子Sp1對肺癌細(xì)胞LKB1-VEGF通路調(diào)控作用研究[J]. 臧遠(yuǎn)勝,周平坤,丁新民,梁璇,隋建麗,白貝,李強,徐勤枝. 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院院刊. 2007(01)
[5]自噬和自噬性細(xì)胞死亡與腫瘤的關(guān)系及研究進(jìn)展[J]. 賀淑芳,萬小云,謝幸. 國外醫(yī)學(xué)(老年醫(yī)學(xué)分冊). 2006(01)
[6]Ultrastructural Pathologic Observation on the Gut-Associated Lymphoid Tissues of Sacculus Rotundus of Rabbits Infected with Rabbit Haemorrhagic Disease Virus[J]. SHE Rui-ping, YANG Han-chun, JIA Jun-zheng, LIU Hai-hong, MA Yi-xin and Itakura CCollege of Animal Medicine , China Agricultural University , Beijing 100094 , P. R. China;Veterinary Faculty , Hokkaido University , Sapttoro 062, Japan. Agricultural Sciences in China. 2003(04)
博士論文
[1]RNAi技術(shù)在抑制HBV復(fù)制和表達(dá)中的應(yīng)用[D]. 張宏斌.第一軍醫(yī)大學(xué) 2006
[2]斷乳仔兔腹瀉發(fā)生機制及生物活性物質(zhì)的調(diào)控研究[D]. 谷子林.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]黑斑息肉綜合征雙氣囊小腸鏡治療的臨床研究及其STK11/LKB1基因突變篩查[D]. 卞德建.第二軍醫(yī)大學(xué) 2014
[2]新西蘭兔ATG16L1基因多態(tài)性與非特異性消化道紊亂的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖正龍.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]家兔IL-10基因多態(tài)性對基因表達(dá)量和腸炎易感性的影響[D]. 王霞.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]不同ADF水平飼糧對肉兔生產(chǎn)性能、腸道粘膜免疫及盲腸發(fā)酵的影響[D]. 彭全輝.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3164771
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
學(xué)術(shù)名詞簡表
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 腸炎發(fā)生分子機制研究
1.2 LKB1基因的發(fā)現(xiàn)及其分子結(jié)構(gòu)
1.3 LKB1基因的調(diào)節(jié)方式
1.4 LKB1基因功能
1.4.1 對T細(xì)胞發(fā)育影響
1.4.2 促進(jìn)成肌細(xì)胞分化
1.4.3 可變剪切體LKB1s與精細(xì)胞形成
1.4.4 LKB1對細(xì)胞極性調(diào)節(jié)
1.4.5 LKB1與癌癥發(fā)生關(guān)系
1.5 LKB1基因相關(guān)信號通路
1.5.1 LKB1/AMPK信號通路與能量代謝
1.5.2 AMPK/SIRT1/NF-κβ信號通路介導(dǎo)炎癥反應(yīng)
1.5.3 LKB1/AMPK/mTOR信號通路與癌癥發(fā)生
1.6 本研究的目的和意義
1.6.1 試驗?zāi)康?br> 1.6.2 試驗研究的主要內(nèi)容
1.7 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 儀器與試劑
2.3 試驗方法
2.3.1 各組織總RNA的提取
2.3.2 總RNA質(zhì)量檢測
2.3.3 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
2.3.4 克隆LKB1基因
2.3.5 組織定量表達(dá)分析
2.4 細(xì)胞試驗
2.4.1 細(xì)胞傳代
2.4.2 冷凍和復(fù)蘇細(xì)胞
2.4.3 細(xì)胞計數(shù)
2.4.4 siRNA序列及相關(guān)基因引物信息
2.4.5 篩選siRNA分子及檢測炎癥細(xì)胞中各基因表達(dá)水平
3 試驗結(jié)果
3.1 LKB1基因克隆及序列分析
3.1.1 RNA質(zhì)量的檢測
3.1.2 LKB1基因克隆結(jié)果
3.1.3 測序及生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.2 檢測腸炎模型組各組織基因表達(dá)
3.3 細(xì)胞試驗結(jié)果
3.3.1 CEC細(xì)胞培養(yǎng)及觀察
3.3.2 細(xì)胞生長曲線
3.3.3 構(gòu)建細(xì)胞炎癥模型
3.4 篩選干擾siRNA序列
3.4.1 細(xì)胞總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
3.4.2 轉(zhuǎn)染及篩選siRNA
3.5 干擾LKB1基因?qū)MPK信號通路相關(guān)基因表達(dá)結(jié)果
3.5.1 LKB1/AMPK信號通路下游相關(guān)基因表達(dá)
3.5.2 PGC-1α和ATG13表達(dá)
3.6 炎癥細(xì)胞中促炎因子IL-lA和TNF-a表達(dá)結(jié)果
4 討論
4.1 克隆及生物信息學(xué)分析
4.2 腸炎模型組各組織表達(dá)分析
4.2.1 LKB1組織表達(dá)分析
4.2.2 與LKB1相關(guān)基因的組織表達(dá)分析
4.3 轉(zhuǎn)染si-02-LKB1對炎癥細(xì)胞模型中信號因子表達(dá)影響
4.3.1 PGC-1α和ATG13表達(dá)差異分析
4.3.2 AMPK激酶及其相關(guān)信號因子表達(dá)差異分析
4.3.3 促炎因子IL-1A和TNF-α表達(dá)差異分析
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]潰瘍性結(jié)腸炎與克羅恩病基因譜表達(dá)的差異[J]. 趙琦,何鮮平,游紹偉. 世界華人消化雜志. 2014(34)
[2]NUAK1通過影響F-actin聚合促進(jìn)乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移[J]. 尹崇高,李平,李洪利,孫磊,劉菲,張麗娜,李文通,張寶剛. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2013(10)
[3]不同中性洗滌纖維與淀粉比例飼糧對生長肉兔生產(chǎn)性能、盲腸發(fā)酵及胃腸道發(fā)育的影響[J]. 朱巖麗,李福昌,王春陽,王雪鵬. 動物營養(yǎng)學(xué)報. 2013(08)
[4]轉(zhuǎn)錄因子Sp1對肺癌細(xì)胞LKB1-VEGF通路調(diào)控作用研究[J]. 臧遠(yuǎn)勝,周平坤,丁新民,梁璇,隋建麗,白貝,李強,徐勤枝. 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院院刊. 2007(01)
[5]自噬和自噬性細(xì)胞死亡與腫瘤的關(guān)系及研究進(jìn)展[J]. 賀淑芳,萬小云,謝幸. 國外醫(yī)學(xué)(老年醫(yī)學(xué)分冊). 2006(01)
[6]Ultrastructural Pathologic Observation on the Gut-Associated Lymphoid Tissues of Sacculus Rotundus of Rabbits Infected with Rabbit Haemorrhagic Disease Virus[J]. SHE Rui-ping, YANG Han-chun, JIA Jun-zheng, LIU Hai-hong, MA Yi-xin and Itakura CCollege of Animal Medicine , China Agricultural University , Beijing 100094 , P. R. China;Veterinary Faculty , Hokkaido University , Sapttoro 062, Japan. Agricultural Sciences in China. 2003(04)
博士論文
[1]RNAi技術(shù)在抑制HBV復(fù)制和表達(dá)中的應(yīng)用[D]. 張宏斌.第一軍醫(yī)大學(xué) 2006
[2]斷乳仔兔腹瀉發(fā)生機制及生物活性物質(zhì)的調(diào)控研究[D]. 谷子林.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]黑斑息肉綜合征雙氣囊小腸鏡治療的臨床研究及其STK11/LKB1基因突變篩查[D]. 卞德建.第二軍醫(yī)大學(xué) 2014
[2]新西蘭兔ATG16L1基因多態(tài)性與非特異性消化道紊亂的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖正龍.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]家兔IL-10基因多態(tài)性對基因表達(dá)量和腸炎易感性的影響[D]. 王霞.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]不同ADF水平飼糧對肉兔生產(chǎn)性能、腸道粘膜免疫及盲腸發(fā)酵的影響[D]. 彭全輝.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3164771
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