本研究采用RT-PCR方法對從廣西9個地市采集的豬腸樣以及豬糞便樣品進(jìn)行了豬嵴病毒（PKV）的檢測,從498份樣品中檢測出159份陽性,陽性率為31.9%,從陽性病料中挑選21株豬嵴病毒毒株進(jìn)行完整的ORF基因測序分析。在這21株毒株中有14株毒株ORF全長7467bp,編碼2488個氨基酸;有7株毒株在2B基因位置連續(xù)缺失90個堿基,ORF全長7377bp,編碼2458個氨基酸。廣西毒株的多聚蛋白的預(yù)測剪切位點與PKV標(biāo)準(zhǔn)毒株S-1一致。廣西毒株的完整ORF框與豬嵴病毒的參考毒株進(jìn)行同源性比對,發(fā)現(xiàn)這些毒株的核苷酸同源性為86.5%-90.3%,氨基酸同源性為93.0%-97.2%；與其他動物源性的嵴病毒相比,同源性最高的是羊源,核昔酸同源性為73.2%-74.1%,氨基酸同源性為77.0%-78.2%；而同源性最低的是人源,核苷酸和氨基酸同源性分別為57.9%-59.0%和60.6%-61.5%。分析豬嵴病毒各個基因片段,發(fā)現(xiàn)21株毒株與豬嵴病毒參考毒株核苷酸變異最大的是VP0,同源性僅為79.8%-89.7%,而突變最小的為3D,同源性高達(dá)91%-94%；氨基酸方面,氨基酸變化最... 

【文章來源】：廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

病毒粒子模式圖

日本學(xué)者就是采用憐媽酸負(fù)染的電鏡方法發(fā)現(xiàn)了BKV U-1株與AiV粒子很相似，并結(jié)合其他方法確定了U-1是嵴病毒的一個新種（圖1-3)。IHHHHAichi vims. U-1 strain FV-1圖1-3電子顯微鏡下的AiV以及負(fù)染色的BKV和PV-1 (引自Teruo Yamashita等，2003)Fig 】-3 Electrom micrograph of Aichi Virus,U-1 stain and PV-1 stain with 2% phosphotungsticacid(PH=7.2) for 2 min9

D基因RT-PCR產(chǎn)物電泳圖

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3138589