發(fā)布時(shí)間：2021-04-11 13:03

　　為了解山東地區(qū)豬瘟病毒（CSFV）的感染和變異情況,應(yīng)用RT-PCR方法對(duì)2018年從無(wú)害化處理場(chǎng)和屠宰場(chǎng)采集的756份豬的組織樣品進(jìn)行CSFV檢測(cè),并對(duì)陽(yáng)性毒株的5′UTR、E0和E2基因進(jìn)行擴(kuò)增、克隆和序列分析。結(jié)果顯示,756份樣品中有59份為CSFV陽(yáng)性,陽(yáng)性率為7.8%。根據(jù)測(cè)序結(jié)果選取有代表性的9株CSFV病毒進(jìn)行序列分析,對(duì)E2基因序列分析顯示,與兔化弱毒（HCLV）疫苗株相比,在可造成免疫逃逸的關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)這9株毒株均存在相同的3個(gè)氨基酸位點(diǎn)的突變,而E0基因在密碼子程度上一直向著遠(yuǎn)離經(jīng)典毒株Shimen株和HCLV疫苗株方向發(fā)展。以5′UTR和E2基因?yàn)榛A(chǔ)進(jìn)行分型,發(fā)現(xiàn)這9株病毒均屬于2.1d亞群,與Shimen株、HCLV疫苗株親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。綜上說(shuō)明,山東地區(qū)豬瘟病毒已經(jīng)朝著遠(yuǎn)離疫苗株的方向進(jìn)化。 

【文章來(lái)源】：動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(11)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【部分圖文】：

CSFV 5′UTR和E2基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

使用MegAlign軟件對(duì)豬瘟病毒E2基因推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)(圖1)。擴(kuò)增的9株豬瘟病毒的E2基因,Dezhou-1株和Zaozhuang-1株在20位氨基酸位點(diǎn)與其他毒株位點(diǎn)有所不同,這些毒株與Shimen株和HCLV株對(duì)比,均存在11個(gè)氨基酸位點(diǎn)的突變:4 aa (L-P)、8 aa (G-E)、15 aa (K-R)、24 aa (N-D)、29 aa (K-R)、33 aa (V-T)、40 aa (T-I)、56 aa (G-R)、59 aa (L-P)、72 aa (N-S)和74 aa (S/L-A)。2.4 E0基因的核苷酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列同源性比較

E0基因的2個(gè)RNase活性區(qū)域和豬瘟病毒的毒力等相關(guān),運(yùn)用MegAlign軟件對(duì)擴(kuò)增的豬瘟病毒E0基因的RNase活性區(qū)域進(jìn)行比對(duì)(圖2)。2.6 基于5′UTR和E2基因的進(jìn)化樹(shù)分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]2012-2013年廣西豬瘟流行病學(xué)調(diào)查[D]. 歐瑩.廣西大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3131305