發(fā)布時間：2021-04-11 13:03

　　為了解山東地區(qū)豬瘟病毒（CSFV）的感染和變異情況,應用RT-PCR方法對2018年從無害化處理場和屠宰場采集的756份豬的組織樣品進行CSFV檢測,并對陽性毒株的5′UTR、E0和E2基因進行擴增、克隆和序列分析。結(jié)果顯示,756份樣品中有59份為CSFV陽性,陽性率為7.8%。根據(jù)測序結(jié)果選取有代表性的9株CSFV病毒進行序列分析,對E2基因序列分析顯示,與兔化弱毒（HCLV）疫苗株相比,在可造成免疫逃逸的關鍵氨基酸位點這9株毒株均存在相同的3個氨基酸位點的突變,而E0基因在密碼子程度上一直向著遠離經(jīng)典毒株Shimen株和HCLV疫苗株方向發(fā)展。以5′UTR和E2基因為基礎進行分型,發(fā)現(xiàn)這9株病毒均屬于2.1d亞群,與Shimen株、HCLV疫苗株親緣關系較遠。綜上說明,山東地區(qū)豬瘟病毒已經(jīng)朝著遠離疫苗株的方向進化。 

【文章來源】：動物醫(yī)學進展. 2020,41(11)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

CSFV 5′UTR和E2基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

使用MegAlign軟件對豬瘟病毒E2基因推導的氨基酸序列進行比對(圖1)。擴增的9株豬瘟病毒的E2基因,Dezhou-1株和Zaozhuang-1株在20位氨基酸位點與其他毒株位點有所不同,這些毒株與Shimen株和HCLV株對比,均存在11個氨基酸位點的突變:4 aa (L-P)、8 aa (G-E)、15 aa (K-R)、24 aa (N-D)、29 aa (K-R)、33 aa (V-T)、40 aa (T-I)、56 aa (G-R)、59 aa (L-P)、72 aa (N-S)和74 aa (S/L-A)。2.4 E0基因的核苷酸序列及推導的氨基酸序列同源性比較

E0基因的2個RNase活性區(qū)域和豬瘟病毒的毒力等相關,運用MegAlign軟件對擴增的豬瘟病毒E0基因的RNase活性區(qū)域進行比對(圖2)。2.6 基于5′UTR和E2基因的進化樹分析

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3131305