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RFM奶牛血清代謝組學(xué)分析及Gln對奶牛RFM發(fā)生調(diào)控機制的研究

發(fā)布時間:2021-04-03 23:53
  胎衣不下(Retained fetal membranes,RFM)是奶牛圍產(chǎn)期常見的繁殖障礙性疾病,其致病因素復(fù)雜多變,研究證實奶牛的營養(yǎng)代謝情況直接影響胎衣外排,對RFM奶牛整體代謝狀況與RFM發(fā)生關(guān)系的研究有助于揭示RFM的發(fā)生機理從而制定及時有效的防控措施。因此本研究通過液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(Liquid Chromatograph-Mass Spectrometry,LC-MS)技術(shù)鑒定RFM血清差異代謝物并分析其參與的代謝途徑,以差異代謝物谷氨酰胺(Glutamine,Gln)為研究對象,探究Gln補充對奶牛子宮內(nèi)膜上皮細胞免受氧化損傷的保護作用,初步Gln在RFM疾病發(fā)生中的作用及機制。本試驗選擇年齡、體況、胎次相近的無其他疾病的RFM奶牛和產(chǎn)后胎衣正常排出奶牛各8頭,分別采集其血清和母體胎盤組織樣本,通過LC-MS技術(shù)結(jié)合多元統(tǒng)計分析篩選RFM奶牛體內(nèi)的差異代謝物,并對這些差異代謝物進行多元統(tǒng)計分析和生物信息學(xué)分析;通過qRT-PCR、ELISA等方法檢測氧化/抗氧化分子指標以及Gln含量。體外實驗觀察不同濃度(0、0.25、0.5、2、4、8 mM)Gln補充對H

【文章來源】:黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)黑龍江省

【文章頁數(shù)】:87 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

RFM奶牛血清代謝組學(xué)分析及Gln對奶牛RFM發(fā)生調(diào)控機制的研究


QC樣本BPC圖

散點圖,統(tǒng)計分析,模式,散點圖


RFM奶牛血清代謝組學(xué)分析及Gln對奶牛RFM發(fā)生調(diào)控機制的研究18圖2.2多元統(tǒng)計分析的結(jié)果。A.ESI(+)模式下RFM組對N組的PCA模型得分散點圖;B.ESI(-)模式下RFM組對N組的PCA模型得分散點圖;C.ESI(+)模式下RFM組對N組的OPLS-DA模型得分散點圖;D.ESI(-)模式下RFM組對N組的OPLS-DA模型得分散點圖;E.ESI(+)模式下RFM組對N組OPLS-DA模型的置換檢驗結(jié)果;F.ESI(-)模式下RFM組對N組OPLS-DA模型的置換檢驗結(jié)果。Fig2.2Resultsofmultivariatestatisticalanalysis.A.ScorescatterplotofPCAmodelforgroupRFMvsNinESI(+)mode;B.ScorescatterplotofPCAmodelforgroupRFMvsNinESI(-)mode;C.ScorescatterplotofOPLS-DAmodelforgroupRFMvsNinESI(+)mode;D.ThescatteredpointchartoftheOPM-DAmodeloftheRFMgrouptotheNgroupinESI(-)mode;E.PermutationtestofOPLS-DAmodelforgroupRFMvsNinESI(+)mode;F.PermutationtestofOPLS-DAmodelforgroupRFMvsNinESI(-)mode.

氣泡圖,熱力,聚類分析,層次


RFM奶牛血清代謝組學(xué)分析及Gln對奶牛RFM發(fā)生調(diào)控機制的研究22圖2.3RFM組對N組的層次聚類分析熱力圖。A.ESI(+)模式下;B.ESI(-)模式下Fig2.3HeatmapofhierarchicalclusteringanalysisforRFMgrouptoNgroup.A.A.ESI(+)model;B.ESI(-)model2.3.4差異代謝物通路分析差異代謝產(chǎn)物的通路分析結(jié)果如表2.6所示,在通路數(shù)據(jù)庫中總計有19種差異代謝物具有映射通路。應(yīng)用MetPA數(shù)據(jù)庫對R組與N組奶牛血清ESI(+)/ESI(-)兩種模式下篩選出的差異代謝物映射的通路進行濃縮和拓撲分析,以篩選出與代謝物相關(guān)性最高的關(guān)鍵通路,結(jié)果以氣泡圖形式表示(圖2.4)。氣泡圖中各個氣泡分別不同的某一代謝通路,氣泡的大小及其對應(yīng)的橫坐標表示該通路在拓撲分析中的影響因子大小,氣泡越大或橫坐標越靠右表示影響因子越大;氣泡顏色的深淺及其對應(yīng)的縱坐標表示該通路在富集分析中的P值的負自然對數(shù)即-lnP-value,氣泡顏色越深或縱坐標越靠上表示P值越小,富集程度越顯著。兩組奶牛血清中篩選出的差異代謝物主要參與甘油磷脂代謝;D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代謝;谷胱甘肽代謝;醚脂質(zhì)代謝;鞘脂代謝;丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代謝;初級膽汁酸的生物合成;苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸的生物合成;苯丙氨酸的代謝;乙醛

【參考文獻】:
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碩士論文
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本文編號:3117322

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